More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0855 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0855  transcriptional regulator, GntR family  100 
 
 		 238 aa  493  9.999999999999999e-139  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.894475  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3020  GntR family transcriptional regulator  39.81 
 
 		 239 aa  154  1e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0770  GntR family transcriptional regulator  38.14 
 
 		 255 aa  152  2.9999999999999998e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0774402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1161  transcriptional regulator GntR  38.57 
 
 		 228 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.480758  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1352  transcriptional regulator, GntR family  37.74 
 
 		 228 aa  145  6e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0276  transcriptional regulator, GntR family  36.65 
 
 		 254 aa  142  4e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0241099  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0702  GntR family transcriptional regulator  38.07 
 
 		 240 aa  137  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.582572  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1375  GntR family transcriptional regulator  35.07 
 
 		 252 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.473972  normal  0.0210118 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0841  GntR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 247 aa  133  1.9999999999999998e-30  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.938482 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5236  transcriptional regulator, GntR family  34.21 
 
 		 252 aa  132  6e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.27643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1420  GntR family transcriptional regulator  34.78 
 
 		 236 aa  130  2.0000000000000002e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1104  transcriptional regulator, GntR family  33.65 
 
 		 266 aa  128  1.0000000000000001e-28  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2162  transcriptional regulator, GntR family  35.21 
 
 		 262 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.173243  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5712  transcriptional regulator, GntR family  36.08 
 
 		 223 aa  125  7e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.678342 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2501  transcriptional regulator, GntR family  34.74 
 
 		 262 aa  124  1e-27  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.365709  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2747  transcriptional regulator, GntR family  32.57 
 
 		 233 aa  124  1e-27  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.756614  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4544  GntR family transcriptional regulator  34.7 
 
 		 260 aa  123  3e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.377364 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0795  GntR family transcriptional regulator  36.87 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6237  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 233 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.223321  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2564  transcriptional regulator GntR  33.5 
 
 		 246 aa  115  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6406  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 233 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507804  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6639  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 233 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.497673  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1831  transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 		 239 aa  113  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.185738  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3396  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 233 aa  111  9e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.296167  normal  0.56362 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0345  transcriptional regulator, GntR family  35.68 
 
 		 223 aa  111  1.0000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.244112  normal  0.239723 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3952  GntR family transcriptional regulator  35.2 
 
 		 221 aa  108  8.000000000000001e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.942603  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3487  transcriptional regulator, GntR family  31.19 
 
 		 223 aa  107  2e-22  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0600  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 225 aa  105  7e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3836  GntR family transcriptional regulator  33.95 
 
 		 312 aa  105  8e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.155558  normal  0.0735717 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5040  GntR family transcriptional regulator  34.88 
 
 		 243 aa  102  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.435911  normal  0.566869 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0088  transcriptional regulator, GntR family  31.34 
 
 		 239 aa  102  4e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0551  transcriptional regulator, GntR family  32 
 
 		 219 aa  102  5e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23200  transcriptional regulator, GntR  33.5 
 
 		 240 aa  102  7e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4721  transcriptional regulator  33.18 
 
 		 240 aa  102  7e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1021  GntR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 231 aa  102  7e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.698861  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2899  GntR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 226 aa  101  8e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.0000458154  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0023  transcriptional regulator, GntR family  30.81 
 
 		 228 aa  101  9e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2079  GntR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.70187  normal  0.119624 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4057  transcriptional regulator, GntR family  31.92 
 
 		 227 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53920  transcriptional regulator  33.83 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.531171  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1768  GntR family transcriptional regulator  30.05 
 
 		 227 aa  99.4  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000893003  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1667  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 226 aa  99  5e-20  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.429941  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0103  transcriptional regulator, GntR family  31.47 
 
 		 221 aa  99  6e-20  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1934  GntR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 238 aa  99  6e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.168362  hitchhiker  0.000000002523 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1988  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 221 aa  98.6  8e-20  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0497005  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3720  GntR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 222 aa  98.2  9e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2333  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 238 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.527944  hitchhiker  0.0000370874 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3437  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 238 aa  98.2  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00721447  normal  0.10278 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0694  transcriptional regulator, GntR family  28.87 
 
 		 215 aa  97.1  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1076  GntR family transcriptional regulator  32.29 
 
 		 222 aa  97.1  2e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.928588  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0926  GntR family transcriptional regulator  32.32 
 
 		 229 aa  97.1  2e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0059  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 229 aa  96.7  3e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4175  transcriptional regulator, GntR family  32.11 
 
 		 216 aa  96.7  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.454993  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1774  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 234 aa  96.7  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.253131  hitchhiker  0.0000230253 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5741  GntR family transcriptional regulator  30.5 
 
 		 228 aa  96.3  4e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0911809  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0677  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 254 aa  96.3  4e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16960  transcriptional regulator, GntR family  32.14 
 
 		 229 aa  95.9  5e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.916885 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1829  GntR family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 246 aa  95.5  6e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1870  transcriptional regulator  34.15 
 
 		 237 aa  95.5  6e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.120377 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0483  transcriptional regulator, GntR family  32.32 
 
 		 227 aa  95.5  7e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4468  GntR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 229 aa  95.1  9e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.885152  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0202  transcriptional regulator, GntR family  32.51 
 
 		 233 aa  94.7  1e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.0023081  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1510  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 232 aa  94.7  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3780  GntR family transcriptional regulator  33.5 
 
 		 245 aa  94.7  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0104971 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3293  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 256 aa  94.4  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.336996 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6102  transcriptional regulator GntR family  29.08 
 
 		 229 aa  94.4  1e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0813  GntR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 257 aa  94  2e-18  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0065  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 235 aa  94  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0261299  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3368  transcriptional regulator, GntR family  31.44 
 
 		 227 aa  94.4  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00646565  normal  0.0258143 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6522  transcriptional regulator, GntR family  31.43 
 
 		 234 aa  94.4  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0968671 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0611  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 222 aa  93.6  2e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.0000000176506  normal  0.0227892 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3984  transcriptional regulator, GntR family  31.86 
 
 		 216 aa  94  2e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4090  GntR family transcriptional regulator  29.9 
 
 		 224 aa  93.6  3e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2641  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 219 aa  93.6  3e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6449  transcriptional regulator, GntR family  30.09 
 
 		 236 aa  93.6  3e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.110693  normal  0.091376 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1763  GntR family transcriptional regulator  32.58 
 
 		 241 aa  92.8  4e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.481898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0062  GntR family transcriptional regulator  27.55 
 
 		 234 aa  92.8  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0450  GntR family transcriptional regulator  34.41 
 
 		 222 aa  92.8  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0946  transcriptional regulator, GntR family  32.32 
 
 		 239 aa  92.8  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.961128  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2702  transcriptional regulator, GntR family  29.47 
 
 		 232 aa  92.8  4e-18  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1669  transcriptional regulator, GntR family  30.14 
 
 		 225 aa  92.8  4e-18  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.072531  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0479  transcriptional regulator, GntR family  32.45 
 
 		 265 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2404  GntR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 230 aa  92.4  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2084  transcriptional regulator GntR  32.34 
 
 		 239 aa  92.4  6e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.853758  hitchhiker  0.00432704 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0658  GntR family transcriptional regulator  34.36 
 
 		 211 aa  92.4  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.117657 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0572  transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 		 216 aa  92  6e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.666259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0933  transcriptional regulator, GntR family  29.9 
 
 		 212 aa  92.4  6e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0705  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 243 aa  92.4  6e-18  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000407645 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2823  GntR family transcriptional regulator  31.92 
 
 		 239 aa  92  7e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.346929  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2286  transcriptional regulator, GntR family  32.51 
 
 		 232 aa  92  7e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.28962  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4656  transcriptional regulator, GntR family  30.05 
 
 		 237 aa  92  7e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.741615 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3604  GntR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 214 aa  92  7e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.463907 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0453  GntR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 202 aa  91.7  8e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0874  transcriptional regulator, GntR family  28.42 
 
 		 226 aa  91.7  9e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.917982  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1537  transcriptional regulator, GntR family  28.57 
 
 		 226 aa  91.7  9e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000150611  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2413  GntR family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 238 aa  91.3  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.224265  normal  0.351453 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2569  GntR family transcriptional regulator  33.68 
 
 		 251 aa  91.7  1e-17  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2897  GntR family transcriptional regulator  30.29 
 
 		 234 aa  91.3  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4691  GntR family transcriptional regulator  32.12 
 
 		 233 aa  91.3  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.517604  normal  0.0635309 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0280  GntR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 233 aa  91.3  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0095071 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>