More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0850 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0850  isochorismatase hydrolase  100 
 
 		 227 aa  468  1.0000000000000001e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.633323  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1705  isochorismatase hydrolase  77.13 
 
 		 239 aa  358  3e-98  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.936948 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2024  isochorismatase hydrolase  75.78 
 
 		 239 aa  352  2.9999999999999997e-96  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.166105  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1111  isochorismatase hydrolase  78.28 
 
 		 239 aa  351  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.77446  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4623  putative isochorismatase family protein  70.22 
 
 		 227 aa  343  2e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0276016 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3023  isochorismatase hydrolase  73.91 
 
 		 233 aa  339  2e-92  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5240  isochorismatase hydrolase  69.87 
 
 		 230 aa  338  4e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.599557  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1356  isochorismatase family protein  74.31 
 
 		 228 aa  336  1.9999999999999998e-91  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1165  isochorismatase hydrolase  74.31 
 
 		 228 aa  335  2.9999999999999997e-91  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.712866  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1371  isochorismatase family protein  70.67 
 
 		 230 aa  335  3.9999999999999995e-91  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.16071  normal  0.0672215 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0766  isochorismatase family protein  69.3 
 
 		 231 aa  335  3.9999999999999995e-91  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0251753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0273  isochorismatase hydrolase  71.24 
 
 		 234 aa  331  7.000000000000001e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.221084  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5654  hypothetical protein  70.35 
 
 		 233 aa  329  2e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6453  isochorismatase hydrolase  69.37 
 
 		 234 aa  328  5.0000000000000004e-89  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.344539  normal  0.0179591 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0839  isochorismatase hydrolase  69.33 
 
 		 232 aa  324  6e-88  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4478  isochorismatase hydrolase  68.47 
 
 		 234 aa  322  3e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0676  isochorismatase hydrolase  67.74 
 
 		 247 aa  317  7e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.456581 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_26363  predicted protein  62.67 
 
 		 230 aa  313  1.9999999999999998e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6450  isochorismatase hydrolase  67.42 
 
 		 241 aa  310  1e-83  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0709723  normal  0.0611102 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06124  isochorismatase family hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G08700)  55.45 
 
 		 389 aa  253  1.0000000000000001e-66  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.189791 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1695  isochorismatase hydrolase  53.6 
 
 		 226 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.305053  normal  0.0828387 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2014  isochorismatase hydrolase  53.15 
 
 		 226 aa  215  4e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.35213  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2027  isochorismatase hydrolase  50.67 
 
 		 240 aa  214  9.999999999999999e-55  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0107803  hitchhiker  0.00287244 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6446  isochorismatase hydrolase  51.63 
 
 		 236 aa  213  1.9999999999999998e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.443341  normal  0.0975575 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4501  isochorismatase hydrolase  47.03 
 
 		 231 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1123  isochorismatase hydrolase  52.25 
 
 		 226 aa  212  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1163  isochorismatase hydrolase  48.43 
 
 		 225 aa  212  3.9999999999999995e-54  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.427272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0732  isochorismatase hydrolase  51.79 
 
 		 240 aa  209  3e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.044592 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6450  isochorismatase hydrolase  48.2 
 
 		 222 aa  208  6e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0382853 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2755  putative isochorismatase  52.71 
 
 		 228 aa  206  2e-52  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2912  isochorismatase hydrolase  47.3 
 
 		 240 aa  206  2e-52  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2658  isochorismatase hydrolase  50.92 
 
 		 223 aa  204  9e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.481302  normal  0.112501 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4480  isochorismatase hydrolase  47.09 
 
 		 222 aa  204  1e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5651  hypothetical protein  48.2 
 
 		 223 aa  204  1e-51  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.101784  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3021  isochorismatase hydrolase  48.65 
 
 		 232 aa  202  4e-51  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1373  isochorismatase family protein  51.42 
 
 		 231 aa  202  5e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0213344 
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46626  predicted protein  47.17 
 
 		 227 aa  200  9.999999999999999e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1354  isochorismatase family protein  49.31 
 
 		 225 aa  200  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5238  isochorismatase hydrolase  49.08 
 
 		 231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.51684  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3053  isochorismatase hydrolase  47.75 
 
 		 230 aa  199  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0333292  normal  0.223788 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03716  conserved hypothetical protein  50.45 
 
 		 222 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03665  hypothetical protein  50.45 
 
 		 222 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4203  isochorismatase family protein  50.45 
 
 		 222 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000421381 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1017  isochorismatase hydrolase  50.49 
 
 		 233 aa  196  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2765  isochorismatase hydrolase  50.22 
 
 		 230 aa  194  7e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2809  isochorismatase hydrolase  50.22 
 
 		 230 aa  194  7e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.168317 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0275  isochorismatase hydrolase  48.83 
 
 		 223 aa  191  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0199791  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0848  isochorismatase hydrolase  46.01 
 
 		 236 aa  190  2e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.171362  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0764  hypothetical protein  49.77 
 
 		 229 aa  188  5e-47  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0418642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1649  isochorismatase hydrolase  39.92 
 
 		 281 aa  174  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137775  normal  0.599986 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5250  isochorismatase hydrolase  35.91 
 
 		 266 aa  134  9e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1269  putative isochorismatase family protein  36.54 
 
 		 274 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.544851 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1578  isochorismatase hydrolase  35.27 
 
 		 264 aa  114  2.0000000000000002e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.488451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3936  pyrimidine utilization protein B  35.36 
 
 		 241 aa  112  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.259493  hitchhiker  0.00944074 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2114  putative isochorismatase family protein, rutB  31.22 
 
 		 231 aa  105  6e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2631  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 231 aa  104  1e-21  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.662963  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01014  predicted enzyme  30.88 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1126  putative isochorismatase family protein, rutB  30.77 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1129  putative isochorismatase family protein, rutB  31.09 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.880561  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2584  isochorismatase hydrolase  30.77 
 
 		 231 aa  103  2e-21  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.118098 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01021  hypothetical protein  30.88 
 
 		 230 aa  103  2e-21  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1098  isochorismatase hydrolase  33.68 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3979  isochorismatase hydrolase  31.67 
 
 		 233 aa  103  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00761  isochorismatase family protein  29.33 
 
 		 244 aa  102  6e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1248  putative isochorismatase family protein, rutB  30.57 
 
 		 231 aa  101  7e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2859  isochorismatase hydrolase  33.63 
 
 		 212 aa  101  8e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0688366 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1822  isochorismatase hydrolase  29.82 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.709387  normal  0.03112 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17210  nicotinamidase-like amidase  32.96 
 
 		 256 aa  98.6  6e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1257  isochorismatase hydrolase  31.41 
 
 		 201 aa  97.4  1e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.35565 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3116  isochorismatase hydrolase  33.17 
 
 		 224 aa  97.1  2e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0998  isochorismatase hydrolase  30.62 
 
 		 245 aa  95.5  6e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0992  isochorismatase hydrolase  29.41 
 
 		 224 aa  95.1  7e-19  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1524  isochorismatase hydrolase  29.95 
 
 		 230 aa  94  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.405798 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2981  isochorismatase family protein  33.03 
 
 		 227 aa  94  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0757911  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2056  isochorismatase hydrolase  30.95 
 
 		 248 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.647626  normal  0.0831182 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4839  isochorismatase hydrolase  30.05 
 
 		 252 aa  93.2  3e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.722387  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2058  isochorismatase hydrolase  32.02 
 
 		 214 aa  92.4  5e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1583  isochorismatase hydrolase  31.55 
 
 		 258 aa  92.4  5e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.418934 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1459  isochorismatase hydrolase  31.72 
 
 		 204 aa  92  7e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1156  isochorismatase family protein  31.03 
 
 		 246 aa  91.7  8e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0258  isochorismatase hydrolase  30.54 
 
 		 203 aa  91.7  9e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1124  isochorismatase hydrolase  32.29 
 
 		 196 aa  91.3  1e-17  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.590608  normal  0.46427 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2400  isochorismatase hydrolase  28.49 
 
 		 201 aa  90.5  2e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.268382  normal  0.777879 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2477  isochorismatase hydrolase  30.32 
 
 		 205 aa  90.1  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0529331  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3660  isochorismatase hydrolase  28.57 
 
 		 213 aa  89.4  4e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0150605  normal  0.0962565 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1717  isochorismatase hydrolase  33.51 
 
 		 201 aa  89  5e-17  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.00000789432 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0780  isochorismatase hydrolase  33.87 
 
 		 243 aa  89.4  5e-17  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.473619  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2385  isochorismatase hydrolase  30.73 
 
 		 221 aa  88.6  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0141  isochorismatase hydrolase  31.91 
 
 		 214 aa  88.6  7e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18103  predicted protein  28.64 
 
 		 214 aa  88.2  9e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000572408  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0141  isochorismatase hydrolase  33.89 
 
 		 191 aa  88.2  1e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4490  isochorismatase hydrolase  30.81 
 
 		 220 aa  87.4  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.628501  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1076  isochorismatase hydrolase  32.34 
 
 		 247 aa  85.5  5e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0373691  normal  0.029222 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72660  hypothetical protein  31.53 
 
 		 217 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.280253  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0413  isochorismatase hydrolase  30.85 
 
 		 201 aa  85.9  5e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.500644  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3125  isochorismatase hydrolase  30.21 
 
 		 213 aa  85.5  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0638  isochorismatase hydrolase  30.84 
 
 		 200 aa  85.5  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1737  isochorismatase hydrolase  30.62 
 
 		 248 aa  85.1  9e-16  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0664  isochorismatase hydrolase  29.32 
 
 		 217 aa  85.1  9e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2226  isochorismatase hydrolase  34.83 
 
 		 188 aa  84.3  0.000000000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>