More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0780 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
401 aa  796    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1812  hypothetical protein  71.07 
 
 
401 aa  600  1e-170  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1082  hypothetical protein  65.46 
 
 
456 aa  572  1.0000000000000001e-162  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  63.59 
 
 
400 aa  511  1e-144  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  62.34 
 
 
400 aa  508  1e-143  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  65.25 
 
 
403 aa  492  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  60.79 
 
 
403 aa  494  9.999999999999999e-139  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  60.7 
 
 
402 aa  485  1e-136  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  60.35 
 
 
402 aa  479  1e-134  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  60.35 
 
 
402 aa  479  1e-134  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3187  hypothetical protein  59.59 
 
 
400 aa  472  1e-132  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  58.63 
 
 
402 aa  470  1.0000000000000001e-131  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  55.33 
 
 
403 aa  451  1.0000000000000001e-126  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3866  TRAP-type C4-dicarboxylate transport system periplasmic component-like protein  57.46 
 
 
401 aa  449  1e-125  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0415964  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3019  hypothetical protein  57.71 
 
 
401 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  58.46 
 
 
400 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  58.71 
 
 
400 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3373  ABC efflux transporter, inner membrane subunit  57.71 
 
 
401 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2149  hypothetical protein  56.72 
 
 
402 aa  429  1e-119  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0531927  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  49.01 
 
 
409 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  48.28 
 
 
409 aa  350  3e-95  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  48.28 
 
 
409 aa  350  3e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  46.04 
 
 
409 aa  347  2e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  43.78 
 
 
406 aa  338  8e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  46.04 
 
 
408 aa  338  9.999999999999999e-92  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  47.91 
 
 
409 aa  334  2e-90  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  47.91 
 
 
409 aa  333  3e-90  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  47.67 
 
 
409 aa  331  2e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3570  protein of unknown function DUF214  48.5 
 
 
409 aa  330  3e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  46.98 
 
 
402 aa  326  4.0000000000000003e-88  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  43.03 
 
 
406 aa  325  9e-88  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2775  hypothetical protein  45.77 
 
 
409 aa  322  9.000000000000001e-87  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0520922  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  44.36 
 
 
405 aa  321  9.999999999999999e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  42.04 
 
 
406 aa  317  2e-85  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  41.98 
 
 
405 aa  308  1.0000000000000001e-82  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0306  ABC transporter related  44.03 
 
 
707 aa  299  7e-80  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.114507  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  43.42 
 
 
404 aa  297  2e-79  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  41.03 
 
 
411 aa  296  3e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1168  hypothetical protein  45.15 
 
 
406 aa  295  1e-78  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.69946  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  43.26 
 
 
658 aa  291  1e-77  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  37.56 
 
 
406 aa  290  3e-77  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2918  protein of unknown function DUF214  44.89 
 
 
405 aa  288  9e-77  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.393852  normal  0.599334 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  41.98 
 
 
405 aa  286  2.9999999999999996e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2810  ABC transporter related  38.22 
 
 
715 aa  285  1.0000000000000001e-75  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.780778  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  41.29 
 
 
406 aa  283  4.0000000000000003e-75  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  43.28 
 
 
653 aa  283  5.000000000000001e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  39 
 
 
412 aa  282  6.000000000000001e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  42.96 
 
 
656 aa  281  1e-74  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2608  hypothetical protein  43.67 
 
 
411 aa  280  3e-74  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  42.86 
 
 
657 aa  280  3e-74  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  44.44 
 
 
657 aa  279  6e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  44.72 
 
 
408 aa  279  7e-74  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  41.06 
 
 
661 aa  275  1.0000000000000001e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  42.05 
 
 
407 aa  275  1.0000000000000001e-72  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  41.77 
 
 
391 aa  274  2.0000000000000002e-72  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  43.15 
 
 
671 aa  273  4.0000000000000004e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  42.93 
 
 
670 aa  273  4.0000000000000004e-72  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  40.92 
 
 
412 aa  272  7e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  38.57 
 
 
409 aa  271  2e-71  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  40.91 
 
 
644 aa  269  5e-71  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0337  ATPase  43.75 
 
 
657 aa  269  5.9999999999999995e-71  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.498916  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  40.64 
 
 
409 aa  266  5.999999999999999e-70  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3198  ABC transporter related  37.66 
 
 
647 aa  266  7e-70  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0833808  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  39.85 
 
 
657 aa  264  3e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  41.96 
 
 
653 aa  263  3e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  38.94 
 
 
651 aa  263  3e-69  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  38.61 
 
 
405 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  40.39 
 
 
405 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  40.39 
 
 
405 aa  261  1e-68  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  39.29 
 
 
443 aa  261  2e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1006  ABC transporter related protein  36.5 
 
 
649 aa  258  1e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  38.48 
 
 
409 aa  258  1e-67  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  37.13 
 
 
405 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  39.34 
 
 
405 aa  258  1e-67  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  37.13 
 
 
405 aa  258  1e-67  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2039  hypothetical protein  41.94 
 
 
403 aa  257  2e-67  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.417724  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  39.6 
 
 
405 aa  256  4e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0104  protein of unknown function DUF214  36.47 
 
 
454 aa  254  2.0000000000000002e-66  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8874  protein of unknown function DUF214  38.72 
 
 
418 aa  253  5.000000000000001e-66  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00933707  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  41.13 
 
 
410 aa  252  7e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  38.94 
 
 
652 aa  250  4e-65  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  38.98 
 
 
410 aa  250  4e-65  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0210  protein of unknown function DUF214  39.9 
 
 
409 aa  250  4e-65  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1422  ABC transporter related  36.88 
 
 
678 aa  249  5e-65  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.155076  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1311  efflux ABC transporter, ATP-binding/permease protein  36.88 
 
 
678 aa  249  5e-65  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000105037  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2755  efflux ABC transporter ATP-binding/permease  36.88 
 
 
678 aa  249  6e-65  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000385404  normal  0.585052 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0769  ABC transporter related  37.25 
 
 
650 aa  249  8e-65  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  38.12 
 
 
398 aa  248  9e-65  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  39.22 
 
 
654 aa  248  2e-64  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0394  ABC transporter related  36.43 
 
 
652 aa  247  3e-64  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  37.47 
 
 
404 aa  246  3e-64  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1126  hypothetical protein  37.79 
 
 
414 aa  246  4e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  37.5 
 
 
657 aa  246  6e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  38.12 
 
 
410 aa  246  6e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  38.06 
 
 
409 aa  246  6.999999999999999e-64  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  36.78 
 
 
403 aa  245  9e-64  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  39.41 
 
 
656 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  38.12 
 
 
410 aa  245  9.999999999999999e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  37.22 
 
 
404 aa  245  9.999999999999999e-64  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5332  ABC transporter related  38.64 
 
 
681 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0305255 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>