74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0709 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0709  flagellar biosynthetic protein FliO  100 
 
 
211 aa  429  1e-119  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.942573  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002824  flagellar biosynthesis protein FliO  33.33 
 
 
137 aa  67  0.0000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2163  flagellar biosynthesis protein, FliO  30.34 
 
 
163 aa  66.6  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3038  flagellar biosynthesis protein, FliO  38.1 
 
 
166 aa  63.5  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03152  hypothetical protein  31.68 
 
 
137 aa  62.8  0.000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2299  polar flagellar assembly protein FliO  35.05 
 
 
129 aa  61.2  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1971  flagellar protein FliO  28.7 
 
 
146 aa  59.7  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0391464  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3445  flagellar biosynthesis protein, FliO  29.91 
 
 
146 aa  60.1  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.934306 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3882  flagellar protein FliO  31.43 
 
 
151 aa  58.9  0.00000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.427745  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3222  flagellar biosynthesis protein, FliO  31.43 
 
 
187 aa  58.9  0.00000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.252328 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2173  flagellar biogenesis protein-like  34.45 
 
 
159 aa  58.2  0.00000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45780  flagellar protein FliO  32.69 
 
 
150 aa  58.2  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0485  flagellar biosynthesis protein, FliO  34.95 
 
 
153 aa  57.8  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.188569  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1964  flagellar biosynthesis protein, FliO  30.17 
 
 
163 aa  57.4  0.0000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1511  flagellar protein FliO  33.73 
 
 
209 aa  58.2  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.259812  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3918  flagellar biosynthesis protein FliO  31.53 
 
 
144 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0739  flagellar biosynthesis protein, FliO  38.37 
 
 
152 aa  57.4  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.548156  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1330  flagellar biosynthesis protein FliO  32.22 
 
 
150 aa  55.5  0.0000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.443294  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2813  flagellar biosynthesis protein, FliO  36.59 
 
 
143 aa  55.5  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.392806  normal  0.0850882 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2288  flagellar protein FliO  34.09 
 
 
124 aa  54.3  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.667143  normal  0.915972 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0041  flagellar biosynthesis protein FliO  31.53 
 
 
191 aa  53.9  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1985  flagellar biosynthesis protein, FliO  28.3 
 
 
149 aa  52.8  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.271247  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2909  flagellar biosynthesis protein FliO  34.34 
 
 
120 aa  52.4  0.000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0156  flagellar protein fliO  28.12 
 
 
206 aa  51.6  0.000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.517264 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1627  flagellar biosynthesis protein FliO  34.02 
 
 
124 aa  51.6  0.000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1706  flagellar protein FliO  37.88 
 
 
129 aa  51.2  0.00001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1969  flagellar biosynthesis protein, FliO  30.43 
 
 
142 aa  50.8  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.152772  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1882  flagellar biosynthetic protein FliO  30.43 
 
 
140 aa  50.4  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1167  flagellar biosynthetic protein FliO  29.57 
 
 
147 aa  50.1  0.00003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.481561  normal  0.0745006 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02878  polar flagellar assembly protein FliO  32.43 
 
 
120 aa  50.1  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0039  flagellar biosynthesis protein FliO  28.83 
 
 
186 aa  48.9  0.00005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1754  flagellar protein fliO  33.33 
 
 
136 aa  48.9  0.00006  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2584  flagellar biosynthesis protein FliO  27.27 
 
 
140 aa  48.9  0.00006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1865  flagellar protein FliO  27.22 
 
 
211 aa  48.1  0.00008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.511864  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0031  flagellar biosynthesis protein FliO  27.5 
 
 
221 aa  48.5  0.00008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0057  flagellar biosynthesis protein FliO  32.05 
 
 
180 aa  48.1  0.00008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0856  hypothetical protein  36.7 
 
 
139 aa  48.1  0.00009  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.0878754  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0031  flagellar biosynthesis protein FliO  27.22 
 
 
221 aa  48.1  0.00009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2687  flagellar protein FliO  27.22 
 
 
211 aa  48.1  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3495  flagellar protein FliO  27.22 
 
 
221 aa  48.1  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1665  hypothetical protein  35.9 
 
 
174 aa  47.8  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0242  flagellar protein FliO  27.22 
 
 
221 aa  48.1  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.682736  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0032  flagellar biosynthesis protein, FliO  32.05 
 
 
193 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0030  flagellar biosynthesis protein, FliO  32.05 
 
 
188 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0038  flagellar biosynthesis protein, FliO  32.05 
 
 
193 aa  48.1  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2538  flagellar biosynthesis protein FliO  29.7 
 
 
124 aa  47.4  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.600463  normal  0.973594 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2762  flagellar protein FliO  28.35 
 
 
164 aa  46.2  0.0003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1754  flagellar protein fliO  34.33 
 
 
136 aa  46.6  0.0003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2301  flagellar protein fliO  35.56 
 
 
178 aa  45.8  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1510  flagellar biosynthesis protein, FliO  30.91 
 
 
144 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.534381  normal  0.0796172 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0029  flagellar biosynthesis protein  31.58 
 
 
224 aa  45.8  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.241943  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1375  flagellar biosynthesis protein, FliO  32.18 
 
 
125 aa  45.8  0.0005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.679292  normal  0.145211 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5300  flagellar biosynthesis protein, FliO  26.96 
 
 
186 aa  45.8  0.0005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.592303  normal  0.104724 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2916  flagellar biosynthesis protein, FliO, putative  33.33 
 
 
173 aa  45.8  0.0005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.465826  normal  0.367308 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2401  flagellar biosynthesis protein FliO  35.56 
 
 
178 aa  45.4  0.0007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0376  flagellar FLIO transmembrane protein  29.17 
 
 
130 aa  44.3  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1191  flagellar biosynthesis protein, FliO  28.44 
 
 
136 aa  44.7  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1264  flagellar biosynthesis protein FliO  29.51 
 
 
125 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1141  flagellar biosynthesis protein FliO  29.51 
 
 
125 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0496709  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2136  flagellar biosynthesis protein FliO  29.51 
 
 
125 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.206958 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2194  flagellar biosynthesis protein FliO  29.51 
 
 
125 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.805426 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2141  flagellar biosynthesis protein FliO  29.51 
 
 
125 aa  44.7  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00267968 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2940  flagellar biosynthesis protein FliO  27.56 
 
 
208 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4356  flagellar assembly protein FliO  30.91 
 
 
144 aa  44.3  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.46476  normal  0.615031 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0977  flagellar biosynthesis protein, FliO  32.18 
 
 
162 aa  44.3  0.002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.40867  normal  0.0426342 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2158  hypothetical protein  23.08 
 
 
131 aa  43.5  0.002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0475421  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3682  flagellar biosynthesis protein FliO  32.73 
 
 
151 aa  43.9  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0729728  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4756  flagellar biosynthesis protein FliO  35.14 
 
 
127 aa  42.7  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.45659  normal  0.854749 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3679  flagellar biosynthesis protein FliO  35.14 
 
 
127 aa  42.7  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3057  flagellar biosynthesis protein, FliO  32.47 
 
 
125 aa  42.7  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.190988  normal  0.139869 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24140  Flagellar biosynthesis protein  29.25 
 
 
140 aa  42.4  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.452089  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0699  flagellar biosynthesis protein FliO  26.4 
 
 
128 aa  42.4  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.13505  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5882  flagellar biosynthesis protein, FliO  28.7 
 
 
149 aa  41.6  0.01  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.51063  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3435  flagellar biosynthesis protein FliO  25 
 
 
127 aa  41.2  0.01  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>