222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0707 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0707  flagellar motor switch protein FliM  100 
 
 
347 aa  703    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4358  flagellar motor switch protein FliM  52.01 
 
 
322 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.319653  normal  0.671935 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1546  flagellar motor switch protein FliM  52.01 
 
 
322 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0457141  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3684  flagellar motor switch protein FliM  52.32 
 
 
322 aa  370  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0180941  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1328  flagellar motor switch protein FliM  54.27 
 
 
326 aa  370  1e-101  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.112804  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1508  flagellar motor switch protein FliM  52.01 
 
 
322 aa  368  1e-101  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0916886 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3920  flagellar motor switch protein FliM  52.01 
 
 
322 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.498992  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2815  flagellar motor switch protein FliM  54.18 
 
 
323 aa  361  1e-98  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0529041 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1969  flagellar motor switch protein FliM  51.08 
 
 
322 aa  358  7e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.172319  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3447  flagellar motor switch protein FliM  50.77 
 
 
322 aa  358  9e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1165  flagellar motor switch protein FliM  50 
 
 
324 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.383583  normal  0.0400809 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0975  flagellar motor switch protein FliM  54.15 
 
 
395 aa  352  5e-96  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.331091  normal  0.0558363 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3884  flagellar motor switch protein FliM  54.83 
 
 
323 aa  352  7e-96  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0592815  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45800  flagellar motor switch protein FliM  54.83 
 
 
323 aa  352  8e-96  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.379881  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1373  flagellar motor switch protein FliM  53.63 
 
 
341 aa  347  2e-94  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0494415  normal  0.271207 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1987  flagellar motor switch protein FliM  54.26 
 
 
332 aa  347  3e-94  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.728173  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3437  flagellar motor switch protein FliM  52.76 
 
 
324 aa  345  8e-94  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1509  flagellar motor switch protein FliM  50.93 
 
 
354 aa  342  7e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.361496  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2175  flagellar motor switch protein FliM  53.53 
 
 
333 aa  340  2e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0487  flagellar motor switch protein FliM  53.5 
 
 
381 aa  340  2e-92  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.10052  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1368  flagellar motor switch protein FliM  51.72 
 
 
342 aa  340  2.9999999999999998e-92  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06192  flagellar motor switch protein FliM  50.47 
 
 
337 aa  339  5e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.148716  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00974  flagellar motor switch protein FliM  50.47 
 
 
337 aa  339  5e-92  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0848002  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3221  flagellar motor switch protein FliM  51.57 
 
 
343 aa  338  5.9999999999999996e-92  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1289  flagellar motor switch protein FliM  51.26 
 
 
343 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.846811  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1356  flagellar motor switch protein FliM  51.26 
 
 
343 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1349  flagellar motor switch protein FliM  51.26 
 
 
343 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0743857  normal  0.319073 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2290  flagellar motor switch protein FliM  53.35 
 
 
342 aa  337  1.9999999999999998e-91  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3061  flagellar motor switch protein FliM  51.42 
 
 
342 aa  336  2.9999999999999997e-91  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.438117  normal  0.957867 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1444  flagellar motor switch protein FliM  51.42 
 
 
342 aa  335  5e-91  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.397318  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2929  flagellar motor switch protein FliM  51.42 
 
 
342 aa  335  9e-91  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2919  flagellar motor switch protein FliM  51.42 
 
 
342 aa  335  9e-91  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.786666  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1709  flagellar motor switch protein FliM  51.7 
 
 
349 aa  334  1e-90  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02880  flagellar motor switch protein FliM  50.95 
 
 
352 aa  333  4e-90  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2301  flagellar motor switch protein FliM  50.63 
 
 
343 aa  331  1e-89  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03154  flagellar motor switch protein FliM  51.57 
 
 
348 aa  330  2e-89  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3040  flagellar motor switch protein FliM  50.79 
 
 
352 aa  330  2e-89  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1189  flagellar motor switch protein FliM  50.79 
 
 
342 aa  330  2e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002822  flagellar motor switch protein FliM  51.39 
 
 
348 aa  330  2e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3059  flagellar motor switch protein FliM  53.04 
 
 
341 aa  330  2e-89  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0661453  normal  0.103892 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2569  flagellar motor switch protein FliM  50.79 
 
 
343 aa  329  3e-89  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1625  flagellar motor switch protein FliM  52.4 
 
 
342 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1873  flagellar motor switch protein FliM  47.95 
 
 
334 aa  322  8e-87  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.424816  normal  0.31491 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2165  flagellar motor switch protein FliM  43.71 
 
 
336 aa  311  1e-83  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4754  flagellar motor switch protein FliM  46.98 
 
 
335 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.767087 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3677  flagellar motor switch protein FliM  46.98 
 
 
335 aa  303  3.0000000000000004e-81  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1607  flagellar motor switch protein FliM  47.3 
 
 
334 aa  293  3e-78  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.337396  normal  0.0569703 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0766  flagellar motor switch protein FliM  45.37 
 
 
338 aa  291  1e-77  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.749684  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1971  flagellar motor switch protein FliM  45.86 
 
 
335 aa  291  1e-77  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.182445  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1352  flagellar motor switch protein FliM  44.27 
 
 
326 aa  290  4e-77  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0158  flagellar motor switch protein FliM  43.4 
 
 
332 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.350257 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1432  flagellar motor switch protein FliM  42.47 
 
 
339 aa  285  5.999999999999999e-76  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3777  flagellar motor switch protein FliM  43.4 
 
 
332 aa  285  8e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.494544  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0378  flagellar motor switch protein FliM  43.31 
 
 
335 aa  283  4.0000000000000003e-75  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0240  flagellar motor switch protein FliM  43.3 
 
 
332 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.840494  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0030  flagellar motor switch protein FliM  43.57 
 
 
332 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0040  flagellar motor switch protein FliM  43.57 
 
 
332 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0029  flagellar motor switch protein FliM  43.3 
 
 
332 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0029  flagellar motor switch protein FliM  43.3 
 
 
332 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0059  flagellar motor switch protein FliM  43.57 
 
 
332 aa  282  5.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3224  flagellar motor switch protein FliM  43.57 
 
 
332 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.0816696 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0032  flagellar motor switch protein FliM  43.4 
 
 
332 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2938  flagellar motor switch protein FliM  42.14 
 
 
332 aa  282  7.000000000000001e-75  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2764  flagellar motor switch protein FliM  42.99 
 
 
332 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0027  flagellar motor switch protein FliM  43.08 
 
 
332 aa  281  1e-74  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0979661  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3497  flagellar motor switch protein FliM  42.99 
 
 
332 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1867  flagellar motor switch protein FliM  42.99 
 
 
332 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2685  flagellar motor switch protein FliM  42.99 
 
 
332 aa  281  1e-74  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0041  flagellar motor switch protein FliM  43.4 
 
 
332 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.215724  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0043  flagellar motor switch protein FliM  43.26 
 
 
332 aa  280  2e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2907  flagellar motor switch protein FliM  46.42 
 
 
336 aa  279  6e-74  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0557  flagellar motor switch protein FliM  40 
 
 
329 aa  275  7e-73  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0208748  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5884  flagellar motor switch protein FliM  42.68 
 
 
337 aa  273  2.0000000000000002e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.579106  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4388  flagellar motor switch protein FliM  40 
 
 
334 aa  273  4.0000000000000004e-72  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5298  flagellar motor switch protein FliM  44.06 
 
 
336 aa  272  7e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.206495 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3800  flagellar motor switch protein FliM  39.69 
 
 
334 aa  268  8.999999999999999e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.506275  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3074  flagellar motor switch protein FliM  39.69 
 
 
334 aa  268  8.999999999999999e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0244027  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1120  flagellar motor switch protein FliM  39.46 
 
 
334 aa  266  2.9999999999999995e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0645  flagellar motor switch protein FliM  39.75 
 
 
334 aa  260  2e-68  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1023  flagellar motor switch protein FliM  38.46 
 
 
334 aa  260  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0572  flagellar motor switch protein  39.1 
 
 
333 aa  258  1e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4175  flagellar motor switch protein FliM  41.25 
 
 
333 aa  256  6e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1962  flagellar motor switch protein FliM  40 
 
 
338 aa  255  8e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2536  flagellar motor switch protein FliM  40.95 
 
 
334 aa  254  1.0000000000000001e-66  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.440846  normal  0.682623 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2954  flagellar motor switch protein FliM  40.82 
 
 
333 aa  254  2.0000000000000002e-66  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1266  flagellar motor switch protein FliM  40.63 
 
 
334 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2192  flagellar motor switch protein FliM  40.63 
 
 
334 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.886457  normal  0.814379 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2134  flagellar motor switch protein FliM  40.63 
 
 
334 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.08804 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1143  flagellar motor switch protein FliM  40.63 
 
 
334 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.166858  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2139  flagellar motor switch protein FliM  40.63 
 
 
334 aa  250  2e-65  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002967 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24160  flagellar motor switch protein  38.87 
 
 
350 aa  250  3e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.171633  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1547  flagellar motor switch protein FliM  39.81 
 
 
343 aa  249  4e-65  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2045  flagellar motor switch protein FliM  41.27 
 
 
334 aa  249  5e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0461254  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1239  flagellar motor switch protein FliM  41.27 
 
 
334 aa  249  5e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.300377  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2721  flagellar motor switch protein FliM  41.27 
 
 
334 aa  249  5e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.048647  normal  0.245443 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1697  flagellar motor switch protein FliM  41.27 
 
 
334 aa  249  5e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0329875 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2178  flagellar motor switch protein FliM  41.27 
 
 
334 aa  249  5e-65  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00044374  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1703  flagellar motor switch protein FliM  41.27 
 
 
334 aa  249  6e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0313377  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1884  flagellar motor switch protein FliM  38.32 
 
 
337 aa  249  6e-65  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2582  flagellar motor switch protein FliM  37.72 
 
 
337 aa  246  3e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>