More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0628 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0628  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 
334 aa  693    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1970  NAD-dependent epimerase/dehydratase  73.46 
 
 
326 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3117  NAD-dependent epimerase/dehydratase  72.45 
 
 
326 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2973  NAD-dependent epimerase/dehydratase  72.45 
 
 
326 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1237  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  69.37 
 
 
335 aa  506  9.999999999999999e-143  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  decreased coverage  0.000000110601  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0370  NAD-dependent epimerase/dehydratase  69.57 
 
 
326 aa  494  1e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1462  NAD-dependent epimerase/dehydratase  66.97 
 
 
333 aa  479  1e-134  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0408  NAD-dependent epimerase/dehydratase  67.59 
 
 
326 aa  461  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.253997 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0524  NAD-dependent epimerase/dehydratase  64.63 
 
 
332 aa  437  1e-121  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1975  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  61.68 
 
 
336 aa  427  1e-118  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3722  NAD-dependent epimerase/dehydratase  63.33 
 
 
335 aa  421  1e-117  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4083  NAD-dependent epimerase/dehydratase  61.08 
 
 
336 aa  419  1e-116  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1513  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  59.63 
 
 
323 aa  411  1e-114  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0751  NAD-dependent epimerase/dehydratase  62.73 
 
 
323 aa  410  1e-113  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.566643 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0394  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  59.01 
 
 
323 aa  406  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.286083  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_12401  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  59.7 
 
 
333 aa  401  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.509931  hitchhiker  0.00693738 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2406  NAD-dependent epimerase/dehydratase  59.88 
 
 
334 aa  395  1e-109  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.225556  normal  0.379661 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2586  NAD-dependent epimerase/dehydratase  56.59 
 
 
334 aa  395  1e-109  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000232422 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01131  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  58.97 
 
 
335 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.434009 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2645  NAD-dependent epimerase/dehydratase  58.72 
 
 
326 aa  387  1e-106  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4859  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.83 
 
 
336 aa  364  1e-99  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.417628  normal  0.311096 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4078  NAD-dependent epimerase/dehydratase  54.68 
 
 
328 aa  353  2e-96  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.347226 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_14111  nucleoside-diphosphate-sugar epimerase  52.12 
 
 
335 aa  353  2.9999999999999997e-96  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0611432  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1583  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.64 
 
 
330 aa  352  4e-96  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4320  NAD-dependent epimerase/dehydratase  51.71 
 
 
327 aa  324  1e-87  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0884  NAD-dependent epimerase/dehydratase  50.45 
 
 
328 aa  323  3e-87  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3560  NAD-dependent epimerase/dehydratase  53.85 
 
 
335 aa  318  1e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1432  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.7 
 
 
328 aa  196  6e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06090  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  38.1 
 
 
330 aa  193  3e-48  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.262708  normal  0.550779 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2855  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.78 
 
 
313 aa  185  9e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1075  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 
327 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0167  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.65 
 
 
328 aa  181  2e-44  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2222  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.44 
 
 
345 aa  178  1e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2395  NAD-dependent epimerase/dehydratase  37.3 
 
 
313 aa  178  1e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4278  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.23 
 
 
312 aa  176  4e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0211938  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6347  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  36.59 
 
 
330 aa  175  9e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.378586  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1139  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.29 
 
 
328 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.123868  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  36.01 
 
 
314 aa  174  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1133  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.06 
 
 
313 aa  170  3e-41  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1063  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.89 
 
 
329 aa  170  4e-41  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2232  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  32.8 
 
 
318 aa  169  8e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0231  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  33.23 
 
 
318 aa  166  5e-40  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.592131  normal  0.59425 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4211  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  34.29 
 
 
331 aa  166  5e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.315212 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1710  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.02 
 
 
326 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6288  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.71 
 
 
342 aa  165  1.0000000000000001e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3097  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.65 
 
 
322 aa  163  3e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.675955 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0415  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  34.71 
 
 
324 aa  163  3e-39  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.021137  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0632  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  33.87 
 
 
340 aa  161  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0204  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.29 
 
 
333 aa  161  1e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2799  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  34.07 
 
 
336 aa  160  3e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0141685  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13818  dTDP-glucose-4,6-dehydratase  34.94 
 
 
326 aa  158  1e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5776  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.71 
 
 
324 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0021  UDP-glucose 4-epimerase  32.4 
 
 
308 aa  157  2e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0249065  hitchhiker  0.00904837 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0056  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  34.7 
 
 
318 aa  157  2e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1144  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  32.69 
 
 
298 aa  157  3e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0956  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  32.7 
 
 
344 aa  157  3e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.417373  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1217  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  34.7 
 
 
308 aa  156  4e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1853  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.29 
 
 
319 aa  156  4e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.669064  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4724  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  33.02 
 
 
330 aa  155  7e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8193  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  34.49 
 
 
338 aa  155  1e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4331  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  34.08 
 
 
331 aa  155  1e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5169  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.85 
 
 
325 aa  155  1e-36  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6490  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  34.25 
 
 
325 aa  154  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  33.86 
 
 
336 aa  154  2e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3281  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.6 
 
 
319 aa  153  4e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.711314 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0833  UDP-galactose-4-epimerase  32.59 
 
 
319 aa  152  5e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.030089  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4425  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  33.97 
 
 
336 aa  151  1e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1447  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  32.81 
 
 
329 aa  151  1e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2040  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.6 
 
 
316 aa  152  1e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.68178  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2336  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  32.42 
 
 
357 aa  151  2e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.930883  normal  0.268504 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1572  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  31.21 
 
 
330 aa  150  3e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1316  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.35 
 
 
310 aa  150  3e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.368791  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0590  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  31.73 
 
 
307 aa  150  4e-35  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2042  NAD-dependent epimerase/dehydratase  35.11 
 
 
322 aa  150  4e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0017259  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0894  NAD dependent epimerase/dehydratase family  32.3 
 
 
331 aa  150  4e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0494  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.99 
 
 
296 aa  150  4e-35  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.417633  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3176  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32 
 
 
329 aa  149  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5840  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  32.24 
 
 
352 aa  149  5e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.481427 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3742  NAD-dependent epimerase/dehydratase  32.82 
 
 
320 aa  149  6e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.283521  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2631  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  32.22 
 
 
360 aa  149  7e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0690  NAD dependent epimerase/dehydratase family  33.97 
 
 
345 aa  149  7e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.595947  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3491  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.56 
 
 
315 aa  149  8e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1121  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  32.61 
 
 
330 aa  149  8e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0479  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.45 
 
 
321 aa  149  9e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0507  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.45 
 
 
321 aa  149  9e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1863  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.65 
 
 
341 aa  149  9e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0199822 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0488  NAD-dependent epimerase/dehydratase family protein  35.45 
 
 
321 aa  149  9e-35  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0907  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.62 
 
 
321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0418  UDP-glucose 4-epimerase (NAD-dependent epimerase)  35.45 
 
 
321 aa  148  1.0000000000000001e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4443  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  33.76 
 
 
336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4288  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  33.87 
 
 
336 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.954612  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0795  NAD dependent epimerase/dehydratase family protein  34.08 
 
 
344 aa  148  1.0000000000000001e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1314  dTDP-glucose 4,6-dehydratase  31.75 
 
 
307 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0422  UDP-glucose 4-epimerase (NAD-dependent epimerase)  34.95 
 
 
321 aa  148  2.0000000000000003e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2302  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.34 
 
 
324 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00284498  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0934  NAD-dependent epimerase/dehydratase  34.62 
 
 
321 aa  148  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5084  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.54 
 
 
323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.059052  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4619  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.54 
 
 
323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000781919 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0029  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.41 
 
 
308 aa  147  3e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.497032 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0378  NAD-dependent epimerase/dehydratase  30.48 
 
 
302 aa  146  4.0000000000000006e-34  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>