224 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0592 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0592  protoporphyrinogen oxidase  100 
 
 
472 aa  956    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.916026  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0796  protoporphyrinogen oxidase  47.67 
 
 
476 aa  358  8e-98  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0027  protoporphyrinogen oxidase  41.02 
 
 
463 aa  324  2e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1666  protoporphyrinogen oxidase  41.34 
 
 
469 aa  323  4e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0570  protoporphyrinogen oxidase  42.89 
 
 
446 aa  316  7e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0724  protoporphyrinogen oxidase  42.89 
 
 
446 aa  316  7e-85  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00079892  hitchhiker  0.00000162097 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2694  protoporphyrinogen oxidase  41.83 
 
 
467 aa  302  1e-80  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.083794  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0014  protoporphyrinogen oxidase  36.25 
 
 
469 aa  288  1e-76  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000319808  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3551  protoporphyrinogen oxidase  37.15 
 
 
495 aa  282  7.000000000000001e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.0051763  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0144  protoporphyrinogen oxidase  35.91 
 
 
471 aa  272  1e-71  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000061855  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0012  protoporphyrinogen oxidase  37.04 
 
 
469 aa  269  1e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1574  protoporphyrinogen oxidase  33.11 
 
 
435 aa  259  5.0000000000000005e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.304554  normal  0.228585 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0521  protoporphyrinogen oxidase  37.17 
 
 
467 aa  256  5e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3367  protoporphyrinogen oxidase  34.89 
 
 
475 aa  246  4.9999999999999997e-64  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.55383  hitchhiker  0.000608505 
 
 
-
 
NC_002950  PG2159  protoporphyrinogen oxidase  34.19 
 
 
465 aa  244  1.9999999999999999e-63  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6103  protoporphyrinogen oxidase  34.82 
 
 
454 aa  242  1e-62  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.507474  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6497  protoporphyrinogen oxidase  33.79 
 
 
442 aa  241  2e-62  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.56742 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2218  protoporphyrinogen oxidase  34.68 
 
 
482 aa  237  4e-61  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.184801 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0772  protoporphyrinogen oxidase  34.34 
 
 
470 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.10101e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2286  protoporphyrinogen oxidase  32.92 
 
 
509 aa  233  4.0000000000000004e-60  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.932472  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1144  protoporphyrinogen oxidase  32.82 
 
 
441 aa  231  2e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0695  protoporphyrinogen oxidase  30.61 
 
 
491 aa  217  4e-55  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1744  protoporphyrinogen oxidase  30.69 
 
 
488 aa  211  3e-53  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2024  protoporphyrinogen oxidase  31.65 
 
 
490 aa  210  5e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.364182  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1467  protoporphyrinogen oxidase  28.88 
 
 
479 aa  194  4e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_31109  protoporphyrinogen oxidase  33.19 
 
 
520 aa  188  2e-46  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1406  protoporphyrinogen oxidase  31.41 
 
 
459 aa  182  9.000000000000001e-45  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.182407  normal  0.217442 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0651  protoporphyrinogen oxidase  28.6 
 
 
474 aa  182  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0462523  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4659  protoporphyrinogen oxidase  30.6 
 
 
476 aa  182  2e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000642175  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1154  protoporphyrinogen oxidase  27.91 
 
 
473 aa  179  1e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1001  protoporphyrinogen oxidase  27.7 
 
 
473 aa  178  2e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000915854  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0986  protoporphyrinogen oxidase  27.7 
 
 
473 aa  178  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0988  protoporphyrinogen oxidase  27.7 
 
 
473 aa  178  2e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000269776  n/a   
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32279  predicted protein  32.39 
 
 
472 aa  178  2e-43  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0286997 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1366  protoporphyrinogen oxidase  26.55 
 
 
482 aa  176  9e-43  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.409095  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0826  protoporphyrinogen oxidase  27.16 
 
 
473 aa  175  1.9999999999999998e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.981055  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1885  protoporphyrinogen oxidase  27.46 
 
 
466 aa  174  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000633111  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1919  protoporphyrinogen oxidase  27.46 
 
 
466 aa  174  2.9999999999999996e-42  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00206772  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1169  protoporphyrinogen oxidase  27.08 
 
 
473 aa  173  5.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0991  protoporphyrinogen oxidase  27.39 
 
 
473 aa  172  1e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1105  protoporphyrinogen oxidase  26.64 
 
 
473 aa  172  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1232  protoporphyrinogen oxidase  26.85 
 
 
473 aa  170  5e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2992  protoporphyrinogen oxidase  29.87 
 
 
460 aa  164  4.0000000000000004e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4200  protoporphyrinogen oxidase  26 
 
 
473 aa  163  5.0000000000000005e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1072  protoporphyrinogen oxidase  27.09 
 
 
456 aa  160  4e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2172  protoporphyrinogen oxidase  24.73 
 
 
466 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000233658  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2948  protoporphyrinogen oxidase  24.95 
 
 
463 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000866681  hitchhiker  0.00000000115848 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1774  protoporphyrinogen oxidase  25.11 
 
 
466 aa  156  6e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000300096  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2383  protoporphyrinogen oxidase  24.73 
 
 
463 aa  155  1e-36  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000492164  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1429  protoporphyrinogen oxidase  29.89 
 
 
473 aa  155  2e-36  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2517  protoporphyrinogen oxidase  25.69 
 
 
466 aa  153  5e-36  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000347009  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2212  protoporphyrinogen oxidase  24.31 
 
 
466 aa  152  1e-35  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.10551e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2828  protoporphyrinogen oxidase  28.57 
 
 
488 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2232  protoporphyrinogen oxidase  24.95 
 
 
466 aa  151  3e-35  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.142231  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2253  protoporphyrinogen oxidase  24.31 
 
 
466 aa  150  5e-35  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000489474  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2418  protoporphyrinogen oxidase  24.31 
 
 
466 aa  150  5e-35  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0259835  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2450  protoporphyrinogen oxidase  24.47 
 
 
466 aa  149  9e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0040978  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2091  protoporphyrinogen oxidase  25.58 
 
 
470 aa  149  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2262  protoporphyrinogen oxidase  30.04 
 
 
482 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.183756  normal  0.0939663 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2436  protoporphyrinogen oxidase  23.88 
 
 
466 aa  146  8.000000000000001e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.178032 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1381  UDP-galactopyranose mutase  28.51 
 
 
463 aa  144  4e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.399176  normal  0.525187 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1897  UDP-galactopyranose mutase  27.41 
 
 
477 aa  143  6e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.844174  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1335  protoporphyrinogen oxidase  27.64 
 
 
471 aa  139  8.999999999999999e-32  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.073104  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6719  Protoporphyrinogen oxidase  25.73 
 
 
479 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.141681  normal  0.278597 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0522  protoporphyrinogen oxidase  25.68 
 
 
470 aa  130  4.0000000000000003e-29  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0126038  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5174  protoporphyrinogen oxidase  27.75 
 
 
470 aa  128  2.0000000000000002e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  hitchhiker  0.00221395  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1553  protoporphyrinogen oxidase  26.69 
 
 
473 aa  124  3e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15660  protoporphyrinogen oxidase  26.62 
 
 
475 aa  122  1.9999999999999998e-26  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.517129  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6784  protoporphyrinogen oxidase  26 
 
 
488 aa  120  3.9999999999999996e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.429215 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24080  protoporphyrinogen oxidase  23.84 
 
 
482 aa  116  7.999999999999999e-25  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.143554  normal  0.0261132 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4343  protoporphyrinogen oxidase  25.99 
 
 
423 aa  114  4.0000000000000004e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.708266  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2186  protoporphyrinogen oxidase  27.85 
 
 
488 aa  111  3e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300515  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1586  protoporphyrinogen oxidase  27.55 
 
 
482 aa  110  4.0000000000000004e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.149602  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1890  protoporphyrinogen oxidase  26.84 
 
 
454 aa  107  3e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3672  protoporphyrinogen oxidase  27.19 
 
 
460 aa  107  6e-22  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0830935  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1893  protoporphyrinogen oxidase  30.16 
 
 
421 aa  104  3e-21  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12692  protoporphyrinogen oxidase  27.14 
 
 
452 aa  102  2e-20  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000133849  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1765  protoporphyrinogen oxidase  26.24 
 
 
493 aa  98.6  2e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000124321  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1794  protoporphyrinogen oxidase  27.02 
 
 
419 aa  98.6  2e-19  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1831  protoporphyrinogen oxidase  25.21 
 
 
447 aa  97.4  4e-19  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1986  protoporphyrinogen oxidase  24.94 
 
 
463 aa  96.7  8e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.0102446  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1547  protoporphyrinogen oxidase  26.6 
 
 
479 aa  96.7  8e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.361545  normal  0.242049 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2264  protoporphyrinogen oxidase  25.54 
 
 
475 aa  93.6  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.929823  n/a   
 
 
-
 
NC_006692  CNG03820  protoporphyrinogen oxidase, putative  27.27 
 
 
589 aa  91.3  3e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55152  mitochondrial protoporphyrinogen oxidase  25.72 
 
 
553 aa  90.5  6e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1533  protoporphyrinogen oxidase  29.64 
 
 
469 aa  90.1  7e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2213  protoporphyrinogen oxidase  27.41 
 
 
451 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2259  protoporphyrinogen oxidase  27.41 
 
 
451 aa  88.6  2e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.685145  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2482  protoporphyrinogen oxidase  27.55 
 
 
453 aa  87.8  3e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.43311 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2202  protoporphyrinogen oxidase  27.41 
 
 
451 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.294018  normal  0.368539 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2493  protoporphyrinogen oxidase  26.31 
 
 
476 aa  85.1  0.000000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000052803 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3918  protoporphyrinogen oxidase  28.01 
 
 
454 aa  85.5  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.475237  normal  0.5349 
 
 
-
 
NC_002620  TC0121  protoporphyrinogen oxidase  22.77 
 
 
424 aa  84.3  0.000000000000004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.138132  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03920  protoporphyrinogen oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G08440)  26.71 
 
 
602 aa  84  0.000000000000006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.556614 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2486  protoporphyrinogen oxidase  28.33 
 
 
462 aa  80.1  0.00000000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.493936 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3928  protoporphyrinogen oxidase  26.5 
 
 
477 aa  80.1  0.00000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0218  amine oxidase  25.27 
 
 
399 aa  79  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000747133  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1475  protoporphyrinogen oxidase  26.77 
 
 
469 aa  77.4  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0850035  hitchhiker  0.000274844 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0933  amine oxidase  23.28 
 
 
400 aa  76.6  0.0000000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0942  amine oxidase  22.63 
 
 
449 aa  73.2  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.15931  normal  0.877558 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>