243 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0555 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0555  beta-lactamase domain protein  100 
 
 
316 aa  656    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000575755  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4039  Beta-lactamase-like  53.25 
 
 
337 aa  342  5.999999999999999e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1621  Beta-lactamase-like  42.28 
 
 
334 aa  246  4e-64  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.683443  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0095  beta-lactamase domain-containing protein  34.32 
 
 
315 aa  168  1e-40  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.631738  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1103  putative hydrolase  33.33 
 
 
312 aa  165  1.0000000000000001e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0197828  normal  0.352936 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1819  metallo-beta-lactamase family protein  32.65 
 
 
333 aa  141  1.9999999999999998e-32  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2257  metallo-beta-lactamase family protein  30.23 
 
 
323 aa  136  4e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.36851 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3350  metallo-beta-lactamase family protein  31.4 
 
 
342 aa  125  7e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0582  beta-lactamase domain protein  29.59 
 
 
321 aa  124  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2083  Beta-lactamase-like  28.66 
 
 
323 aa  121  1.9999999999999998e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0080  beta-lactamase domain protein  26.86 
 
 
319 aa  110  4.0000000000000004e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2819  beta-lactamase domain protein  26.99 
 
 
342 aa  98.6  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2305  beta-lactamase-like protein  32.84 
 
 
314 aa  98.6  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0142167 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1965  beta-lactamase domain-containing protein  32.82 
 
 
320 aa  97.4  3e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.995598  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1782  beta-lactamase domain-containing protein  31.53 
 
 
315 aa  95.1  1e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.378951 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2112  beta-lactamase domain protein  32.65 
 
 
310 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0940782  normal  0.404443 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1776  beta-lactamase domain-containing protein  31.63 
 
 
310 aa  95.5  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.639229  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1735  beta-lactamase domain protein  32.14 
 
 
310 aa  94.7  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.593356  normal  0.313323 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5751  beta-lactamase domain-containing protein  28.84 
 
 
321 aa  94.4  2e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.0502881 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5976  beta-lactamase domain protein  29.72 
 
 
315 aa  94  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.133077  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4160  SoxH protein-like  28.24 
 
 
312 aa  92.4  8e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.671969  normal  0.539982 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1041  beta lactamase precursor  32.71 
 
 
318 aa  92  1e-17  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.215964  normal  0.327704 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3399  hypothetical protein  30.39 
 
 
327 aa  91.3  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0521141 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0298  metallo-beta-lactamase family protein  31.66 
 
 
349 aa  90.9  3e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0185877  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1231  beta-lactamase domain protein  26.86 
 
 
318 aa  89.7  6e-17  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0606732 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0543  beta-lactamase domain protein  27.11 
 
 
305 aa  88.2  2e-16  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0255834  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1673  beta-lactamase domain protein  29.26 
 
 
318 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2278  Beta-lactamase-like  29.44 
 
 
318 aa  87  3e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0244  beta-lactamase domain protein  28.04 
 
 
315 aa  87  4e-16  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0816903 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3948  beta-lactamase domain-containing protein  26.03 
 
 
352 aa  87  4e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.288018  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1597  beta-lactamase domain protein  28.64 
 
 
318 aa  86.3  7e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.789295  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1026  Beta-lactamase-like  28.64 
 
 
312 aa  85.9  9e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0150  beta-lactamase domain-containing protein  28.25 
 
 
332 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3167  beta-lactamase domain protein  27.91 
 
 
302 aa  84.3  0.000000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6284  beta-lactamase domain-containing protein  25.82 
 
 
312 aa  84  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0941559  normal  0.0655244 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2427  beta lactamase precursor  28.3 
 
 
287 aa  84.3  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.662224  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3770  beta-lactamase domain-containing protein  29.52 
 
 
312 aa  83.6  0.000000000000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2056  Beta-lactamase-like  27.15 
 
 
340 aa  83.2  0.000000000000006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.000527783  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2733  beta-lactamase domain-containing protein  27.78 
 
 
325 aa  80.9  0.00000000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.49685 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1512  Beta-lactamase-like  26.32 
 
 
298 aa  80.5  0.00000000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000011498  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2531  beta-lactamase domain protein  28.44 
 
 
312 aa  80.1  0.00000000000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3085  beta-lactamase domain-containing protein  32.82 
 
 
307 aa  79  0.00000000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1902  beta-lactamase domain-containing protein  25.66 
 
 
287 aa  79.3  0.00000000000009  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.392348  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2678  beta-lactamase domain protein  32.82 
 
 
307 aa  79  0.0000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.304007  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2589  hypothetical protein  24.91 
 
 
364 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0926452  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1880  Beta-lactamase-like  25.62 
 
 
367 aa  78.2  0.0000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000360179  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5952  putative metallo-beta-lactamase family protein  29.38 
 
 
308 aa  77.4  0.0000000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.229311 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1961  beta-lactamase domain-containing protein  31.05 
 
 
309 aa  77  0.0000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.141309  normal  0.452196 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2858  beta-lactamase domain protein  30.17 
 
 
337 aa  77.4  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1247  beta-lactamase domain-containing protein  25.27 
 
 
364 aa  77  0.0000000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.352248  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3125  beta-lactamase domain-containing protein  28.9 
 
 
313 aa  77  0.0000000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.265077  normal  0.697397 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2501  beta-lactamase domain protein  27.66 
 
 
322 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.541242 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0471  beta-lactamase domain protein  28.33 
 
 
346 aa  76.3  0.0000000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2107  beta-lactamase domain protein  27.66 
 
 
309 aa  76.3  0.0000000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0505  beta-lactamase domain protein  23.44 
 
 
310 aa  75.1  0.000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3516  beta-lactamase domain-containing protein  27.44 
 
 
299 aa  74.7  0.000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0323096  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0069  beta-lactamase-like  25 
 
 
362 aa  73.9  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2623  beta-lactamase-like  26.17 
 
 
316 aa  73.2  0.000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.533019 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0326  beta-lactamase domain protein  24.11 
 
 
308 aa  72.8  0.000000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.315816  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6499  beta-lactamase domain protein  26.43 
 
 
319 aa  72.8  0.000000000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.735445 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0911  beta-lactamase domain protein  26.2 
 
 
330 aa  72.4  0.000000000009  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.289048  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1656  Rhodanese domain protein  26.15 
 
 
438 aa  71.2  0.00000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.613289  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0225  SoxH protein-like  22.68 
 
 
378 aa  71.2  0.00000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.986095  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01180  Zn-dependent hydrolase, glyoxylase family protein  25.45 
 
 
294 aa  71.2  0.00000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.837421  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2363  beta-lactamase domain-containing protein  28.36 
 
 
351 aa  69.7  0.00000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4662  beta-lactamase domain protein  28.38 
 
 
313 aa  69.3  0.00000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3260  beta-lactamase domain-containing protein  27.86 
 
 
275 aa  68.6  0.0000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2500  beta-lactamase domain protein  26.56 
 
 
315 aa  68.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.397877 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0725  beta-lactamase domain-containing protein  27.32 
 
 
334 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0290049 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4154  beta-lactamase domain-containing protein  28.31 
 
 
317 aa  68.9  0.0000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1934  beta-lactamase domain-containing protein  23.44 
 
 
347 aa  68.2  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1871  Beta-lactamase-like  24.77 
 
 
309 aa  67.8  0.0000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2106  beta-lactamase domain protein  26.56 
 
 
315 aa  68.2  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.105061  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1435  beta-lactamase-like  23.05 
 
 
316 aa  66.2  0.0000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.388274  normal 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3814  beta-lactamase domain-containing protein  24.42 
 
 
316 aa  66.2  0.0000000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.360876  normal  0.263273 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0809  beta-lactamase domain-containing protein  27.71 
 
 
318 aa  65.1  0.000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.951581  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0353  beta-lactamase-like  26.38 
 
 
309 aa  64.7  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.586247  normal  0.377188 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1940  beta-lactamase domain-containing protein  24.07 
 
 
319 aa  64.7  0.000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.386829  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1700  Beta-lactamase-like  23.88 
 
 
382 aa  63.9  0.000000004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2189  hypothetical protein  24.44 
 
 
323 aa  62.8  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.887609  normal  0.357247 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3034  beta-lactamase domain-containing protein  27.27 
 
 
275 aa  62.4  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.641137 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0338  beta-lactamase-like protein  22.78 
 
 
319 aa  62.4  0.00000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.549324 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4217  Beta-lactamase-like  21.86 
 
 
319 aa  61.2  0.00000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4097  beta-lactamase-like  22.16 
 
 
310 aa  61.2  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0427  hypothetical protein  22.22 
 
 
319 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000673109  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1030  beta-lactamase domain protein  24.24 
 
 
312 aa  61.2  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.932178  normal  0.324338 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0583  beta-lactamase domain protein  26.18 
 
 
297 aa  60.8  0.00000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.000802552  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01746  hypothetical protein  23.14 
 
 
319 aa  60.1  0.00000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.286797  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7214  beta-lactamase domain protein  21.85 
 
 
319 aa  60.5  0.00000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.223112  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1888  hypothetical protein  26.09 
 
 
321 aa  60.1  0.00000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.717917 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3721  beta-lactamase domain-containing protein  24.05 
 
 
339 aa  60.1  0.00000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.383554 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2060  metallo-beta-lactamase family protein  25.36 
 
 
318 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3232  metallo-beta-lactamase family protein  25.36 
 
 
318 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0666  beta-lactamase-like  23.77 
 
 
329 aa  59.7  0.00000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.257894  normal  0.323841 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3217  metallo-beta-lactamase family protein  25.36 
 
 
318 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1925  metallo-beta-lactamase family protein  25.36 
 
 
318 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0966006  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0852  metallo-beta-lactamase family protein  25.36 
 
 
318 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4551  beta-lactamase domain-containing protein  21.4 
 
 
332 aa  59.7  0.00000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2684  metallo-beta-lactamase family protein  25.36 
 
 
318 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3178  metallo-beta-lactamase family protein  25.36 
 
 
318 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>