More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0538 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0538  Radical SAM domain protein  100 
 
 		 227 aa  468  1.0000000000000001e-131  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0128544  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1280  radical SAM domain-containing protein  64.45 
 
 		 226 aa  281  6.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.281332  normal  0.805859 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2024  hypothetical protein  60.19 
 
 		 217 aa  275  4e-73  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4533  radical activating enzyme  62.09 
 
 		 215 aa  273  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2226  putative radical activating enzyme  63.33 
 
 		 227 aa  270  9e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2019  hypothetical protein  59.72 
 
 		 217 aa  270  2e-71  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51680  radical activating enzyme  61.14 
 
 		 264 aa  268  4e-71  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000920323  hitchhiker  0.00150868 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0779  Radical SAM domain protein  58.9 
 
 		 223 aa  262  4e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.141038  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01567  radical activating enzyme  60.48 
 
 		 213 aa  261  6e-69  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1225  radical SAM domain protein  61.14 
 
 		 215 aa  260  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.879338 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4193  radical SAM domain-containing protein  61.14 
 
 		 215 aa  260  1e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1254  radical SAM domain-containing protein  61.14 
 
 		 215 aa  260  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.04187  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4399  radical SAM family protein  59.72 
 
 		 215 aa  259  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.102594  normal  0.8927 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4050  radical SAM family protein  58.49 
 
 		 212 aa  259  3e-68  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3116  Radical SAM domain protein  58.8 
 
 		 233 aa  256  1e-67  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.353505  normal  0.670144 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2526  putative radical activating enzyme  60 
 
 		 216 aa  256  1e-67  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0292086  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3990  radical SAM domain-containing protein  60.48 
 
 		 215 aa  254  6e-67  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1418  radical SAM family protein  59.24 
 
 		 215 aa  254  7e-67  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3969  radical SAM domain protein  59.24 
 
 		 215 aa  254  9e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0978763  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2336  radical SAM family protein  56.67 
 
 		 212 aa  252  3e-66  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000650219  normal  0.0607632 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1071  radical activating enzyme  58.1 
 
 		 217 aa  251  1e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0749004  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0952  radical SAM domain-containing protein  58.1 
 
 		 217 aa  249  2e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0717091  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1232  radical activating enzyme family protein  59.52 
 
 		 215 aa  248  5e-65  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.248382  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0569  Radical SAM domain protein  56.87 
 
 		 232 aa  246  2e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.241409  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2711  radical SAM family protein  57.89 
 
 		 234 aa  246  2e-64  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0178  radical SAM domain-containing protein  57.14 
 
 		 213 aa  246  2e-64  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.866793  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2016  queuosine biosynthesis protein  57.14 
 
 		 213 aa  246  2e-64  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.708443  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2203  radical activating enzyme  56.07 
 
 		 216 aa  245  3e-64  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000727675 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0148  radical SAM domain-containing protein  57.14 
 
 		 213 aa  241  6e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0069  radical SAM domain protein  57.82 
 
 		 214 aa  237  9e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0070  Radical SAM domain protein  57.82 
 
 		 214 aa  237  9e-62  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.457092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0896  radical SAM domain-containing protein  51.79 
 
 		 245 aa  229  4e-59  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.116029 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0736  radical activating enzyme  49.55 
 
 		 244 aa  223  2e-57  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.114676  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0724  radical SAM family protein  50 
 
 		 244 aa  222  4e-57  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36610  Radical SAM protein  56.25 
 
 		 193 aa  219  1.9999999999999999e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.506067  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3107  radical SAM family protein  47.6 
 
 		 210 aa  201  9.999999999999999e-51  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1985  radical SAM domain-containing protein  47.6 
 
 		 215 aa  194  8.000000000000001e-49  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0430  radical activating enzyme, putative  46.92 
 
 		 223 aa  192  3e-48  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2562  Radical SAM domain protein  46.38 
 
 		 210 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  decreased coverage  0.00464069  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2467  radical SAM domain-containing protein  45.85 
 
 		 210 aa  188  5.999999999999999e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1298  radical SAM family protein  45.89 
 
 		 210 aa  187  9e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0505  radical activating enzyme, putative  45.97 
 
 		 226 aa  187  1e-46  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.759738  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2658  Radical SAM domain protein  45.41 
 
 		 210 aa  186  3e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0802797  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3632  Radical SAM domain protein  47.39 
 
 		 211 aa  184  1.0000000000000001e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.597891 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1879  Radical SAM domain protein  45.24 
 
 		 223 aa  179  4e-44  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00268762 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1979  radical SAM domain-containing protein  45.75 
 
 		 223 aa  178  4.999999999999999e-44  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2280  Radical SAM domain protein  43.6 
 
 		 223 aa  176  3e-43  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.28532  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1702  Radical SAM domain protein  45.5 
 
 		 222 aa  176  3e-43  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.86531  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1766  Radical SAM domain protein  43.52 
 
 		 220 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.988544  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0497  radical SAM domain-containing protein  42.65 
 
 		 212 aa  166  4e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0196  Radical SAM domain protein  38.18 
 
 		 225 aa  160  2e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00186135  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1450  Radical SAM domain protein  39.34 
 
 		 209 aa  160  2e-38  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4643  radical SAM family Fe-S protein  40.99 
 
 		 226 aa  157  2e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.726839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2209  radical SAM domain-containing protein  41.09 
 
 		 202 aa  147  1.0000000000000001e-34  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2832  radical SAM family protein  38.16 
 
 		 234 aa  143  2e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.641503  normal  0.195448 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0267  radical SAM domain-containing protein  38.73 
 
 		 202 aa  141  8e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.953431  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1617  hypothetical protein  40.2 
 
 		 202 aa  137  1e-31  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0283  Radical SAM domain protein  37.25 
 
 		 202 aa  124  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.173391  normal  0.103255 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1950  Radical SAM domain protein  36 
 
 		 253 aa  117  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0569  Radical SAM domain protein  32.26 
 
 		 220 aa  103  3e-21  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1687  Radical SAM domain protein  31.46 
 
 		 208 aa  92.8  4e-18  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1091  radical SAM domain-containing protein  34.55 
 
 		 216 aa  92.8  4e-18  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.598204 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0949  radical SAM domain-containing protein  32.88 
 
 		 216 aa  92.4  5e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  hitchhiker  0.00254529  hitchhiker  0.000124279 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0034  radical SAM domain-containing protein  32.88 
 
 		 216 aa  92.4  5e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0591  Radical SAM domain protein  29.88 
 
 		 258 aa  86.3  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0707  Radical SAM domain protein  31.22 
 
 		 227 aa  86.3  4e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.654115  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0634  radical SAM domain-containing protein  31.43 
 
 		 204 aa  85.5  6e-16  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1974  radical SAM domain-containing protein  30.52 
 
 		 210 aa  84.7  0.000000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2341  Radical SAM domain protein  28.9 
 
 		 280 aa  83.2  0.000000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0635  radical SAM domain-containing protein  30.73 
 
 		 195 aa  82.4  0.000000000000006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3058  Radical SAM domain protein  31.25 
 
 		 258 aa  81.6  0.000000000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4124  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 230 aa  81.6  0.000000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0642  radical SAM domain-containing protein  33.03 
 
 		 216 aa  81.3  0.00000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1392  Radical SAM domain protein  27.82 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1943  Radical SAM domain protein  31.82 
 
 		 260 aa  77.4  0.0000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.228441  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1057  hypothetical protein  30.09 
 
 		 197 aa  76.3  0.0000000000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.0622294 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1098  radical SAM domain-containing protein  31.38 
 
 		 246 aa  76.3  0.0000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4183  radical SAM domain-containing protein  31.09 
 
 		 235 aa  75.5  0.0000000000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.0000810213  normal  0.603742 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2045  radical SAM family protein  29.36 
 
 		 235 aa  74.3  0.000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1783  putative organic radical activating protein  32.75 
 
 		 225 aa  73.6  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.644545  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0862  radical SAM domain-containing protein  28.21 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0080  hypothetical protein  28.23 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.557073  normal  0.147757 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1878  Radical SAM domain protein  41.67 
 
 		 192 aa  72.8  0.000000000004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.315788  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1008  radical SAM domain-containing protein  29.44 
 
 		 246 aa  72  0.000000000006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1959  radical SAM family protein  35.1 
 
 		 235 aa  71.2  0.00000000001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4051  radical SAM family protein  27.64 
 
 		 246 aa  68.6  0.00000000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2837  radical SAM domain-containing protein  31.28 
 
 		 243 aa  68.6  0.00000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02622  hypothetical protein  27.51 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000486823  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0912  conserved hypothetical protein  27.51 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000203902  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2910  hypothetical protein  27.51 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000863859  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3080  hypothetical protein  27.51 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000477114  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02584  hypothetical protein  27.51 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000638386  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1753  radical SAM family protein  31.25 
 
 		 251 aa  68.6  0.00000000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.55771 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0088  hypothetical protein  28.16 
 
 		 193 aa  68.6  0.00000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4033  hypothetical protein  27.51 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.0000000488158  normal  0.75822 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2918  hypothetical protein  27.51 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000008  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  3.7449199999999994e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3790  7-cyano-7-deazaguanosine (preQ0) biosynthesis protein QueE  26.45 
 
 		 242 aa  68.6  0.00000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0935  hypothetical protein  27.51 
 
 		 223 aa  68.6  0.00000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000274693  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7690  hypothetical protein  27.55 
 
 		 235 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.273315  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3109  radical SAM domain protein  27.51 
 
 		 223 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000108893  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>