162 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0516 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0516  CheW protein  100 
 
 		 171 aa  352  1e-96  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.1773  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3632  twitching motility protein PilI  26.74 
 
 		 179 aa  79.7  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2902  putative CheW protein  29.89 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0129  CheW-like protein  29.84 
 
 		 178 aa  77.8  0.00000000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05340  twitching motility protein PilI  27.91 
 
 		 178 aa  73.6  0.000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0510  twitching motility protein PilI  27.91 
 
 		 178 aa  73.2  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0405  putative CheW protein  31.75 
 
 		 177 aa  72.4  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5306  CheW protein  27.75 
 
 		 179 aa  70.9  0.000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0138969  normal  0.218372 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5032  type IV pilus protein PilI  28.69 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5040  CheW protein  28.8 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0490  CheW-like protein  29.31 
 
 		 179 aa  67.8  0.00000000007  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4864  putative CheW protein  28.8 
 
 		 184 aa  67.8  0.00000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0316337 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4990  type IV pili signal transduction protein PilI  28.8 
 
 		 184 aa  67.4  0.00000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400912  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0474  CheW protein  26.53 
 
 		 184 aa  67.8  0.00000000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.304474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2099  CheW protein  37.62 
 
 		 176 aa  67.4  0.00000000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1816  type IV pili signal transducer  36.73 
 
 		 176 aa  67  0.0000000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0357  CheW protein  27.68 
 
 		 183 aa  66.6  0.0000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0717557  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0894  CheW protein  27.59 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1018  pilus biogenesis protein  27.59 
 
 		 176 aa  65.1  0.0000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.708664  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3769  putative CheW protein  27.59 
 
 		 181 aa  63.5  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3690  CheW protein  37.78 
 
 		 168 aa  59.3  0.00000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.158284  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1574  CheW protein  41.41 
 
 		 175 aa  58.9  0.00000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.10393 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1138  CheW-like protein  29.94 
 
 		 176 aa  57.8  0.00000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.659297 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01604  pilus biogenesis protein  29.44 
 
 		 176 aa  57.4  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.329291  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0690  purine-binding chemotaxis protein  28.97 
 
 		 466 aa  56.6  0.0000001  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  decreased coverage  0.00466397  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0903  CheW protein  37.37 
 
 		 175 aa  57  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.629976 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1244  CheW protein  32.98 
 
 		 175 aa  56.2  0.0000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.95901  normal  0.252697 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3969  CheW protein  37.38 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00946011 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1195  CheW protein  34.44 
 
 		 212 aa  55.1  0.0000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1830  CheW protein  30.53 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000569511  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3576  putative CheW protein  38.61 
 
 		 175 aa  55.1  0.0000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.510091  normal  0.211391 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3087  CheW protein  27.59 
 
 		 176 aa  55.1  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.166967 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2899  CheW protein  36.63 
 
 		 175 aa  53.5  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100159  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2676  CheW protein  33.33 
 
 		 212 aa  53.5  0.000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0640816  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2157  putative CheW protein  26.77 
 
 		 179 aa  53.5  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0332  purine-binding chemotaxis protein CheW  24.53 
 
 		 165 aa  52.8  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0258  CheW protein  34.62 
 
 		 152 aa  52.4  0.000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000534163  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0992  CheW protein  34.83 
 
 		 162 aa  52  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  decreased coverage  0.0071906  normal  0.764949 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03247  CheW protein  33.33 
 
 		 515 aa  51.6  0.000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2458  CheW protein  27.34 
 
 		 149 aa  51.6  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.211003  normal  0.0838028 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2771  CheW protein  36.96 
 
 		 212 aa  51.6  0.000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0420843  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2708  CheW protein  27.88 
 
 		 205 aa  51.2  0.000007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4624  CheW protein  31.01 
 
 		 177 aa  51.2  0.000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.696628  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1368  chemotaxis protein CheW  28.97 
 
 		 172 aa  50.8  0.000009  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1327  CheW protein  25.35 
 
 		 189 aa  50.4  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.893593  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3954  CheW protein  28.89 
 
 		 311 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1373  CheW-like protein  30.19 
 
 		 176 aa  50.4  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.135811  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0991  CheW protein  38.03 
 
 		 290 aa  50.4  0.00001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0500652  normal  0.823385 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1135  CheW protein  27.03 
 
 		 145 aa  50.1  0.00001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0206  CheW domain protein  26.88 
 
 		 164 aa  49.7  0.00002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00161643  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0671  CheW protein  29.32 
 
 		 180 aa  50.1  0.00002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0116901  normal  0.597773 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2398  CheW protein  28.7 
 
 		 192 aa  49.3  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.773649 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2076  CheW protein  22.7 
 
 		 170 aa  49.7  0.00002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0575  CheW protein  27.2 
 
 		 183 aa  48.9  0.00003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.426805  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2128  chemotaxis protein CheV  27.78 
 
 		 311 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.103105 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1763  CheW protein  36.78 
 
 		 191 aa  48.5  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3612  putative CheW protein  27.78 
 
 		 311 aa  48.5  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.296716  normal  0.145923 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2027  CheW protein  23.29 
 
 		 163 aa  48.5  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1646  response regulator receiver modulated CheW protein  27.78 
 
 		 311 aa  48.1  0.00005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1692  CheW protein  36.78 
 
 		 191 aa  48.5  0.00005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0484464  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1670  response regulator receiver modulated CheW protein  27.78 
 
 		 311 aa  47.8  0.00007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.75876 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0470  putative CheW protein  31.46 
 
 		 165 aa  47.8  0.00008  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.126414  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2186  CheW protein  37.66 
 
 		 194 aa  47.8  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1658  purine-binding chemotaxis protein CheW  23.87 
 
 		 165 aa  47.4  0.00009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0193462  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2102  CheW protein  27.21 
 
 		 150 aa  47  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0517911  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2621  CheW-like protein  33.33 
 
 		 182 aa  47.4  0.0001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3019  putative CheW protein  35.35 
 
 		 175 aa  47  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.42559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4169  putative CheW protein  25.42 
 
 		 182 aa  47  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2236  CheW protein  25.93 
 
 		 478 aa  47  0.0001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1492  chemotaxis protein CheW  27.16 
 
 		 444 aa  46.2  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3524  chemotaxis protein CheV, putative  27.78 
 
 		 308 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.010446  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3297  response regulator receiver:CheW-like protein  27.78 
 
 		 308 aa  46.2  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.307395  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3897  CheW protein  27.4 
 
 		 170 aa  46.2  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2380  CheW protein  20.65 
 
 		 177 aa  46.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3041  CheW protein  25.45 
 
 		 163 aa  46.2  0.0002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.0219579 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1474  chemotaxis protein CheV  25.17 
 
 		 309 aa  45.8  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0990  CheW protein  26.47 
 
 		 173 aa  45.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.519788  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0936  response regulator receiver modulated CheW protein  23.74 
 
 		 301 aa  45.8  0.0003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0562  CheW protein  34.72 
 
 		 181 aa  45.8  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.770084 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0357  CheW-like protein  20.27 
 
 		 159 aa  45.8  0.0003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.269886  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1207  CheW protein  25.61 
 
 		 164 aa  45.8  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.848506  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3468  CheW protein  25.37 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.406032  normal  0.213899 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0614  CheW protein  34.72 
 
 		 181 aa  45.1  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.349097  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2282  CheW protein  31.4 
 
 		 160 aa  45.4  0.0004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0124299  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1572  CheW protein  26.67 
 
 		 310 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0331  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.85 
 
 		 173 aa  45.1  0.0005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.337865  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1323  chemotaxis protein CheV, putative  29.49 
 
 		 314 aa  45.1  0.0005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2733  CheW protein  30 
 
 		 179 aa  45.1  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.013016  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0309  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.85 
 
 		 173 aa  45.1  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1643  CheW protein  25.47 
 
 		 161 aa  45.1  0.0005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1688  purine-binding chemotaxis protein CheW  28.85 
 
 		 173 aa  45.1  0.0005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1572  response regulator receiver modulated CheW protein  28.89 
 
 		 301 aa  44.7  0.0006  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004175  chemotaxis protein CheV  25.71 
 
 		 308 aa  44.7  0.0006  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0961  CheW protein  29.31 
 
 		 268 aa  44.7  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1838  CheW protein  22.58 
 
 		 177 aa  44.7  0.0007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00299326 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01282  hypothetical protein  25.71 
 
 		 308 aa  44.7  0.0007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1391  CheW protein  26.22 
 
 		 164 aa  44.3  0.0008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.896559  normal  0.172651 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1139  response regulator receiver:CheW-like protein  31.51 
 
 		 298 aa  43.9  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.455632 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1647  CheW protein  24.6 
 
 		 189 aa  43.9  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00542103 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3352  putative CheW protein  24.85 
 
 		 176 aa  43.9  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.318478  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>