76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0418 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0418  protein of unknown function DUF107  100 
 
 		 150 aa  294  3e-79  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1881  hypothetical protein  48.2 
 
 		 150 aa  130  6e-30  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0471447  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4268  hypothetical protein  43.48 
 
 		 153 aa  127  6e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1445  hypothetical protein  46.32 
 
 		 148 aa  123  9e-28  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155103  normal  0.203788 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2736  hypothetical protein  43.26 
 
 		 153 aa  120  6e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.355478  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4844  hypothetical protein  45.59 
 
 		 147 aa  117  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0069  hypothetical protein  42.75 
 
 		 155 aa  114  3.9999999999999997e-25  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.473003  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0074  hypothetical protein  42.75 
 
 		 155 aa  113  7.999999999999999e-25  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3306  protein of unknown function DUF107  38.73 
 
 		 153 aa  111  4.0000000000000004e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.471898  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3608  protein of unknown function DUF107  39.72 
 
 		 151 aa  110  5e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3111  hypothetical protein  41.43 
 
 		 147 aa  108  2.0000000000000002e-23  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1360  hypothetical protein  47.45 
 
 		 148 aa  108  2.0000000000000002e-23  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0257829 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68830  hypothetical protein  36.91 
 
 		 150 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2216  hypothetical protein  45.59 
 
 		 148 aa  107  8.000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  decreased coverage  0.00884783  normal  0.106638 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4304  hypothetical protein  38.93 
 
 		 149 aa  106  1e-22  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2705  hypothetical protein  43.26 
 
 		 151 aa  104  4e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0863  hypothetical protein  44.93 
 
 		 149 aa  99.8  1e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.627651 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6549  protein of unknown function DUF107  40.71 
 
 		 144 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3025  protein of unknown function DUF107  41.38 
 
 		 151 aa  97.1  8e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4540  hypothetical protein  44.76 
 
 		 153 aa  97.1  8e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01653  nodulation protein nfed, C-terminal only  41.55 
 
 		 144 aa  95.5  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1099  hypothetical protein  40.85 
 
 		 151 aa  94.4  5e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0930  hypothetical protein  47.06 
 
 		 148 aa  94.4  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0945  protein of unknown function DUF107  42.86 
 
 		 149 aa  94  6e-19  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.665646  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5956  hypothetical protein  40.69 
 
 		 156 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.755267  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1033  protein of unknown function DUF107  37.86 
 
 		 149 aa  90.9  5e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3721  hypothetical protein  37.5 
 
 		 152 aa  90.9  6e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3217  protein of unknown function DUF107  40.14 
 
 		 151 aa  88.6  3e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0137  hypothetical protein  36.17 
 
 		 143 aa  87.4  5e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01316  hypothetical protein  32.87 
 
 		 153 aa  85.5  3e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0592  nodulation efficiency family protein  38.93 
 
 		 152 aa  84  7e-16  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.685146 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0537  nodulation efficiency family protein  38.17 
 
 		 152 aa  83.6  9e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00439  conserved inner membrane protein  37.88 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00444  hypothetical protein  37.88 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0423  nodulation efficiency family protein  37.12 
 
 		 152 aa  82  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004151  putative activity regulator of membrane protease YbbK  29.37 
 
 		 153 aa  82  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0156  hypothetical protein  35.2 
 
 		 138 aa  82.4  0.000000000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.867378  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3122  protein of unknown function DUF107  37.88 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3128  hypothetical protein  37.88 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000772435 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0567  nodulation efficiency family protein  37.88 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0527  nodulation efficiency family protein  37.88 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1152  hypothetical protein  36.73 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.243195  hitchhiker  0.000000302368 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3074  protein of unknown function DUF107  39.84 
 
 		 147 aa  81.3  0.000000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.091218 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5110  hypothetical protein  38.52 
 
 		 151 aa  80.1  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  decreased coverage  0.000397496  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0549  inner membrane protein YbbJ  37.4 
 
 		 150 aa  78.6  0.00000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0964  hypothetical protein  38.46 
 
 		 150 aa  79.3  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.634862  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0572  regulator of membrane protease activity  30.5 
 
 		 147 aa  75.5  0.0000000000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1267  hypothetical protein  35.21 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.132196 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2220  hypothetical protein  29.85 
 
 		 153 aa  71.6  0.000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0134246 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3025  nodulation efficiency protein D  35.21 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3163  hypothetical protein  35.21 
 
 		 149 aa  72  0.000000000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0554  inner membrane protein YbbJ  38.17 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0608  hypothetical protein  38.17 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0564  inner membrane protein YbbJ  38.17 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0547  inner membrane protein YbbJ  38.17 
 
 		 150 aa  71.2  0.000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0496  hypothetical protein  34.51 
 
 		 149 aa  62.8  0.000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.41983  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0281  membrane protein  28.87 
 
 		 150 aa  56.2  0.0000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4420  hypothetical protein  28.06 
 
 		 151 aa  55.5  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0062  hypothetical protein  31.69 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0560345  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0062  hypothetical protein  31.69 
 
 		 140 aa  53.9  0.0000007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.351134  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0609  protein of unknown function DUF107  27.15 
 
 		 154 aa  53.5  0.0000009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2365  hypothetical protein  31.08 
 
 		 157 aa  52.8  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4889  hypothetical protein  23.78 
 
 		 145 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0908212  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2246  protein of unknown function DUF107  27.86 
 
 		 143 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0353999 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0138  protein of unknown function DUF107  28.1 
 
 		 151 aa  49.3  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4833  SURF1 domain-containing protein  22.38 
 
 		 143 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.511856 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2311  protein of unknown function DUF107  30.71 
 
 		 143 aa  48.9  0.00002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00380708  hitchhiker  0.000930423 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4625  hypothetical protein  21.68 
 
 		 145 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.165584 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2128  hypothetical protein  28.57 
 
 		 165 aa  48.1  0.00003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.639111 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4711  hypothetical protein  24.82 
 
 		 145 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.396133 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0728  hypothetical protein  24.82 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1329  hypothetical protein  25.19 
 
 		 136 aa  43.5  0.0009  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.259806  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2063  hypothetical protein  30.7 
 
 		 142 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00757659  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3436  hypothetical protein  23.39 
 
 		 152 aa  42.7  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0488184  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3244  hypothetical protein  29.46 
 
 		 142 aa  42.4  0.002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00265616  normal  0.45038 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0087  hypothetical protein  23.13 
 
 		 150 aa  42  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>