More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0383 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_0420  GTP-binding protein TypA  69.19 
 
 
606 aa  868  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.710155 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1124  GTP-binding protein TypA/BipA  53.62 
 
 
600 aa  660  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.143451  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4394  GTP-binding protein  72.37 
 
 
607 aa  916  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4098  GTP-binding protein  72.37 
 
 
607 aa  916  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00590  GTPase  70.87 
 
 
609 aa  897  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0948  GTP-binding protein  65.57 
 
 
602 aa  812  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2046  GTP-binding protein TypA/BipA  53.29 
 
 
600 aa  653  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0433299  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1757  GTP-binding protein TypA/BipA  54.71 
 
 
602 aa  667  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0028  GTP-binding protein TypA/BipA  71.71 
 
 
607 aa  900  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0053  GTP-binding protein TypA  53.63 
 
 
602 aa  653  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2658  GTP-binding protein TypA  52.07 
 
 
614 aa  646  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0030836  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3304  GTP-binding protein TypA  54.71 
 
 
608 aa  649  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0293  GTP-binding protein TypA  69.41 
 
 
607 aa  892  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0644132  hitchhiker  1.10369e-05 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4880  GTP-binding protein TypA  69.9 
 
 
607 aa  890  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000131447 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3915  GTP-binding protein TypA  69.19 
 
 
609 aa  885  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4256  GTP-binding protein  72.37 
 
 
607 aa  916  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.953086 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4145  GTP-binding protein  72.37 
 
 
607 aa  916  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.342274 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4188  GTP-binding protein TypA  71.71 
 
 
607 aa  900  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.428207  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5096  GTP-binding protein TypA  68.7 
 
 
606 aa  860  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2150  GTP-binding protein TypA  55.72 
 
 
606 aa  666  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  5.61063e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3782  GTP-binding protein TypA  52.56 
 
 
614 aa  650  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00018087  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0032  GTP-binding protein TypA/BipA  71.71 
 
 
607 aa  900  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1063  GTP-binding protein TypA/BipA  65.24 
 
 
602 aa  807  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1748  GTP-binding protein TypA  63.08 
 
 
608 aa  780  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846744  normal  0.0136263 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2993  GTP-binding protein TypA  56.23 
 
 
608 aa  692  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0818072  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0312  GTP-binding protein TypA  70.39 
 
 
603 aa  895  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0308  GTP-binding protein TypA  70.56 
 
 
609 aa  897  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.196053  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5850  GTP-binding protein TypA/BipA  68.86 
 
 
605 aa  872  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0948932  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0738  GTP-binding protein TypA  70.13 
 
 
606 aa  868  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1224  GTP-binding protein TypA  61.09 
 
 
605 aa  747  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3553  GTP-binding protein TypA  71.22 
 
 
607 aa  907  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.718809  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  63.08 
 
 
608 aa  775  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  63.25 
 
 
608 aa  776  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  63.25 
 
 
608 aa  776  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0307  GTP-binding protein TypA  70.56 
 
 
609 aa  897  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0237117  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  54.55 
 
 
614 aa  662  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  4.78233e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  63.08 
 
 
608 aa  775  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1918  putative GTP-binding elongation factor protein  58.02 
 
 
610 aa  706  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.23891  normal  0.145014 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0153  GTP-binding protein TypA  64.37 
 
 
605 aa  813  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.143377  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0077  GTP-binding protein TypA  53.8 
 
 
602 aa  655  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4094  GTP-binding protein TypA  70.77 
 
 
607 aa  897  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0413  GTP-binding protein TypA  70.56 
 
 
603 aa  897  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4138  GTP-binding protein TypA  67.98 
 
 
606 aa  850  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.781613  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2976  GTP-binding protein TypA  53.97 
 
 
608 aa  647  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.393631  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1191  GTP-binding protein TypA  51.08 
 
 
615 aa  635  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0472002  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0380  GTP-binding protein TypA  70.84 
 
 
615 aa  897  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  2.38787e-05  hitchhiker  1.36232e-06 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0637  GTP-binding protein TypA  50.57 
 
 
614 aa  641  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  1.55128e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4918  GTP-binding protein TypA  68.7 
 
 
606 aa  865  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0262  GTP-binding protein TypA  54.36 
 
 
607 aa  638  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.263497  normal  0.0373567 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0821  GTP-binding protein TypA/BipA  55.21 
 
 
608 aa  655  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1169  GTP-binding protein TypA  51.08 
 
 
615 aa  635  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0173416  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0260  GTP-binding protein typA/bipA (tyrosine phosphorylated protein A)  53.88 
 
 
608 aa  638  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.181812  normal  0.792051 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  56.81 
 
 
599 aa  677  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  4.75691e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2316  GTP-binding protein TypA  69.72 
 
 
609 aa  887  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2746  GTP-binding protein TypA  55.59 
 
 
607 aa  672  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.163334  normal  0.214192 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4642  GTP-binding protein TypA  69.36 
 
 
603 aa  892  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.787157  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0204  GTP-binding protein TypA  75 
 
 
605 aa  954  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.672165  normal  0.152752 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0969  GTP-binding protein TypA  54.64 
 
 
613 aa  666  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2751  GTP-binding protein TypA  56.16 
 
 
611 aa  690  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45830  small GTP-binding protein TypA  68.75 
 
 
606 aa  862  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1516  GTP-binding protein TypA  53.57 
 
 
602 aa  652  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0732  GTP-binding protein TypA  52.41 
 
 
616 aa  637  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1250  GTP-binding protein TypA  56.23 
 
 
609 aa  691  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0809475  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4156  GTP-binding tyrosin phosphorylated protein  52.29 
 
 
621 aa  637  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0435584  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3148  GTP-binding protein TypA  75.17 
 
 
605 aa  946  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.284484  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1471  GTP-binding protein TypA  54.33 
 
 
605 aa  650  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.885287  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2726  GTP-binding protein TypA  53.88 
 
 
610 aa  658  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  4.16376e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3971  GTP-binding protein TypA  52.73 
 
 
614 aa  653  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1217  GTP-binding protein TypA  63.08 
 
 
606 aa  775  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3958  GTP-binding protein TypA  71.5 
 
 
607 aa  900  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.41781  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03705  hypothetical protein  72.37 
 
 
607 aa  916  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2472  GTP-binding protein TypA  54.46 
 
 
603 aa  678  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0692  GTP-binding protein TypA  53.5 
 
 
604 aa  643  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2287  GTP-binding protein TypA  54.02 
 
 
599 aa  652  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001903  GTP-binding protein TypA/BipA  71.08 
 
 
609 aa  894  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00233609  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4267  GTP-binding protein TypA  54.06 
 
 
615 aa  643  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0798314 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0383  GTP-binding protein TypA  100 
 
 
613 aa  1246  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4502  GTP-binding protein TypA  69.74 
 
 
607 aa  893  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.622829  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1843  GTP-binding protein TypA  54.68 
 
 
614 aa  676  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0491  GTP-binding protein TypA  56.55 
 
 
601 aa  673  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.65728e-05 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4219  GTP-binding protein TypA  70.39 
 
 
607 aa  897  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4155  GTP-binding protein TypA  71.99 
 
 
607 aa  904  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.785099  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1181  GTP-binding protein TypA  52.73 
 
 
614 aa  653  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.15687  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2740  GTP-binding protein TypA  61.72 
 
 
605 aa  767  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4059  GTP-binding protein TypA  52.56 
 
 
614 aa  652  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124295  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3441  GTP-binding protein TypA  56.72 
 
 
600 aa  687  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0213  GTP-binding protein TypA  54.74 
 
 
608 aa  648  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02547  GTP-binding protein TypA  68.85 
 
 
609 aa  864  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.404241  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1126  GTP-binding protein TypA  63.08 
 
 
606 aa  773  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.563047 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1639  GTP-binding protein TypA  62.42 
 
 
608 aa  768  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.787477  normal  0.0390195 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4347  GTP-binding protein  72.37 
 
 
607 aa  916  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1722  GTP-binding protein TypA  64.57 
 
 
608 aa  789  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0487  GTP-binding protein TypA  68.69 
 
 
609 aa  870  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1429  GTP-binding protein TypA  61.92 
 
 
608 aa  767  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1704  GTP-binding protein TypA  56.81 
 
 
606 aa  700  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.5376e-06 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0552  GTP-binding elongation factor protein  68.52 
 
 
609 aa  867  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0788  GTP-binding protein TypA  69.28 
 
 
615 aa  878  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.0236333 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4290  GTP-binding protein  72.7 
 
 
607 aa  920  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.40714  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4336  GTP-binding protein  72.7 
 
 
607 aa  920  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0312  GTP-binding protein TypA  70.39 
 
 
603 aa  895  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>