More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0325 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0325  Ribosomal protein L25/L23  100 
 
 
97 aa  195  2.0000000000000003e-49  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000179883  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0758  50S ribosomal protein L23  61.54 
 
 
99 aa  113  7.999999999999999e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000156644  normal  0.0173378 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1944  50S ribosomal protein L23  54.84 
 
 
113 aa  111  3e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2968  50S ribosomal protein L23  55.91 
 
 
111 aa  109  1.0000000000000001e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.307651  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2738  ribosomal protein L25/L23  54.35 
 
 
96 aa  105  1e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217238  normal  0.259663 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2167  Ribosomal protein L25/L23  52.08 
 
 
98 aa  103  1e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00207145  normal  0.264777 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2686  50S ribosomal protein L23  54.44 
 
 
104 aa  102  1e-21  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0258195  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1676  50S ribosomal protein L23  58.62 
 
 
97 aa  101  3e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62104  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1231  50S ribosomal protein L23  57.47 
 
 
97 aa  101  4e-21  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244915  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1194  50S ribosomal protein L23  57.47 
 
 
97 aa  101  4e-21  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0856  50S ribosomal protein L23  56.38 
 
 
98 aa  101  4e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.483725  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1958  50S ribosomal protein L23  57.47 
 
 
97 aa  100  5e-21  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0171198  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1616  50S ribosomal protein L23  54.02 
 
 
98 aa  100  6e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.129787 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0962  50S ribosomal protein L23  54.64 
 
 
98 aa  100  9e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000402083  hitchhiker  0.00000137402 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1842  50S ribosomal protein L23  55.91 
 
 
97 aa  99  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00948056  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0496  50S ribosomal protein L23  51.65 
 
 
100 aa  98.2  3e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  hitchhiker  0.0000003402  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0435  50S ribosomal protein L23  50 
 
 
100 aa  98.6  3e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  hitchhiker  0.00486251  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0988  50S ribosomal protein L23  56.32 
 
 
97 aa  98.2  4e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137365  normal  0.02544 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1334  50S ribosomal protein L23  57.47 
 
 
97 aa  97.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.212671  normal  0.17449 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1432  50S ribosomal protein L23  57.47 
 
 
97 aa  97.8  4e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11483  normal  0.0319487 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0871  50S ribosomal protein L23  59.34 
 
 
100 aa  97.4  5e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0321  50S ribosomal protein L23  54.26 
 
 
100 aa  96.3  1e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.11411e-18  hitchhiker  0.000000647477 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  52.87 
 
 
98 aa  95.9  1e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0586  50S ribosomal protein L23  55.79 
 
 
100 aa  95.5  2e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108369  normal  0.186609 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04519  50S ribosomal protein L23  58.24 
 
 
99 aa  95.5  2e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000251996  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0329  50S ribosomal protein L23  50.52 
 
 
97 aa  95.9  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0285  50S ribosomal protein L23  55.79 
 
 
100 aa  95.5  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000248684  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0499  50S ribosomal protein L23  50.52 
 
 
97 aa  95.9  2e-19  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.173851  hitchhiker  0.00000000336824 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0460  50S ribosomal protein L23P  51.52 
 
 
99 aa  95.9  2e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1793  50S ribosomal protein L23  51.72 
 
 
98 aa  95.5  2e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.346044  normal  0.0641385 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3913  50S ribosomal protein L23  55.79 
 
 
100 aa  95.5  2e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.78804e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3336  50S ribosomal protein L23  51.06 
 
 
101 aa  95.1  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.000000112822  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2855  50S ribosomal protein L23  51.69 
 
 
94 aa  94.7  4e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0878449  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0201  50S ribosomal protein L23  55.79 
 
 
101 aa  94.4  5e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000118285  hitchhiker  0.00000000127878 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3522  ribosomal protein L25/L23  53.06 
 
 
99 aa  94.4  5e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000457129  hitchhiker  0.00000622944 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  52.87 
 
 
98 aa  94  6e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03169  50S ribosomal protein L23  54.74 
 
 
100 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000759178  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0395  Ribosomal protein L25/L23  54.74 
 
 
100 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000225919  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0395  50S ribosomal protein L23  54.74 
 
 
100 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000080861  hitchhiker  0.00030352 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3613  50S ribosomal protein L23  54.74 
 
 
100 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000847098  hitchhiker  0.00309782 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3512  50S ribosomal protein L23  54.74 
 
 
100 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000392959  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03120  hypothetical protein  54.74 
 
 
100 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000565358  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3801  50S ribosomal protein L23  54.74 
 
 
100 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000749996  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3703  50S ribosomal protein L23  54.74 
 
 
100 aa  93.6  8e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225733  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4641  50S ribosomal protein L23  54.74 
 
 
100 aa  93.6  8e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0287124  normal  0.0460173 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1852  50S ribosomal protein L23  52.69 
 
 
95 aa  93.6  9e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.0000651916  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0839  50S ribosomal protein L23  52.13 
 
 
99 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.225205  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0339  50S ribosomal protein L23  52.69 
 
 
95 aa  93.6  9e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000150967  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08870  50S ribosomal protein L23  52.13 
 
 
99 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.679116  hitchhiker  0.00894178 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  51.72 
 
 
98 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0233  50S ribosomal protein L23  54.74 
 
 
101 aa  92.8  1e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0700  50S ribosomal protein L23  49.43 
 
 
97 aa  92.8  1e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000143862  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3749  50S ribosomal protein L23  54.74 
 
 
100 aa  92.8  1e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000048697  hitchhiker  0.00429034 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3634  50S ribosomal protein L23  54.74 
 
 
100 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000793915  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3634  50S ribosomal protein L23  54.74 
 
 
100 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00980054  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3707  50S ribosomal protein L23  54.74 
 
 
100 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000802937  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0668  50S ribosomal protein L23  49.43 
 
 
97 aa  92.8  1e-18  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142276  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3805  50S ribosomal protein L23  54.74 
 
 
100 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000686351  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3742  50S ribosomal protein L23  54.74 
 
 
100 aa  93.2  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.344368  normal  0.0150111 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0325  50S ribosomal protein L23  54.74 
 
 
100 aa  93.2  1e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000118373  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4542  50S ribosomal protein L23  54.74 
 
 
100 aa  92.8  1e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000172317  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1356  ribosomal protein L25/L23  54.02 
 
 
103 aa  92.8  1e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.385939  normal  0.0499735 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0201  50S ribosomal protein L23  54.74 
 
 
101 aa  92.8  1e-18  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000698801  unclonable  0.0000000000184888 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0196  50S ribosomal protein L23  54.74 
 
 
101 aa  92.8  1e-18  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000848979  decreased coverage  0.000284829 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  51.72 
 
 
98 aa  93.2  1e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0407  50S ribosomal protein L23  54.74 
 
 
100 aa  93.2  1e-18  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00180319  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0202  50S ribosomal protein L23  54.74 
 
 
101 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000000251497  unclonable  0.00000770372 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0628  ribosomal protein L23  50.52 
 
 
99 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.0000267442  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4546  50S ribosomal protein L23  50.52 
 
 
99 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.215144  normal  0.061023 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0407  50S ribosomal protein L23P  52.13 
 
 
101 aa  92.4  2e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000028308  normal  0.141179 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5077  50S ribosomal protein L23  50.52 
 
 
99 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000053863  normal  0.27163 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2322  50S ribosomal protein L23  53.19 
 
 
98 aa  92.4  2e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.00000334931  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0198  50S ribosomal protein L23  54.74 
 
 
101 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000795974  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3757  50S ribosomal protein L23  54.74 
 
 
101 aa  92.4  2e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000228479  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4168  50S ribosomal protein L23  54.74 
 
 
101 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000463544  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4054  50S ribosomal protein L23  54.74 
 
 
101 aa  92.4  2e-18  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000001282  unclonable  0.00000000000566696 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0186  50S ribosomal protein L23  53.19 
 
 
100 aa  91.7  3e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000102577  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1910  50S ribosomal protein L23  51.72 
 
 
98 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000483337  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0935  50S ribosomal protein L23  51.09 
 
 
94 aa  92  3e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000134151  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3326  50S ribosomal protein L23  51.09 
 
 
94 aa  92  3e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  5.23257e-16 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1681  50S ribosomal protein L23  52.87 
 
 
102 aa  92  3e-18  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0570438  hitchhiker  0.0000115816 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3820  50S ribosomal protein L23  54.74 
 
 
100 aa  91.3  4e-18  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000460172  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3999  50S ribosomal protein L23  54.74 
 
 
100 aa  91.3  4e-18  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000101961  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06270  50S ribosomal protein L23  52.04 
 
 
99 aa  90.9  5e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0219554  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0585  50S ribosomal protein L23  51.69 
 
 
98 aa  90.9  5e-18  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.720688 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0351  50S ribosomal protein L23  51.72 
 
 
98 aa  90.9  5e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0278  50S ribosomal protein L23  50.57 
 
 
98 aa  90.9  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0248  50S ribosomal protein L23  50.57 
 
 
98 aa  90.5  7e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.529844  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0721  50S ribosomal protein L23  54.26 
 
 
97 aa  90.5  7e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000131875  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0628  50S ribosomal protein L23  50.56 
 
 
94 aa  90.1  8e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000116587  hitchhiker  0.000000000000956309 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0172  50S ribosomal protein L23  54.74 
 
 
100 aa  90.1  8e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000000000243767  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0215  50S ribosomal protein L23  53.68 
 
 
100 aa  90.5  8e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000957762  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0703  50S ribosomal protein L23  55.06 
 
 
95 aa  90.1  9e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000032639  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1069  50S ribosomal protein L23  46.74 
 
 
94 aa  90.1  9e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000947106  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4315  50S ribosomal protein L23  52.13 
 
 
99 aa  89.7  1e-17  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000209174  unclonable  0.0000000000539649 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2172  50S ribosomal protein L23  53.68 
 
 
100 aa  89.7  1e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000267938  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0150  50S ribosomal protein L23  54.74 
 
 
100 aa  89.7  1e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000125205  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4688  50S ribosomal protein L23  53.19 
 
 
99 aa  89  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000001343  unclonable  0.0000000169741 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0423  50S ribosomal protein L23P  51.09 
 
 
98 aa  88.6  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0123777  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0578  Ribosomal protein L25/L23  52.87 
 
 
102 aa  89.4  2e-17  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>