More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0319 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0319  ribosomal protein S7  100 
 
 		 156 aa  313  6e-85  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000298761  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0454  30S ribosomal protein S7  71.79 
 
 		 156 aa  238  2.9999999999999997e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2328  30S ribosomal protein S7  72.44 
 
 		 155 aa  233  7e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000186286  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0862  30S ribosomal protein S7  71.52 
 
 		 155 aa  231  2.0000000000000002e-60  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.618723  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0401  30S ribosomal protein S7  71.79 
 
 		 156 aa  230  7.000000000000001e-60  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000162716  normal  0.0793455 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0763  30S ribosomal protein S7  72.44 
 
 		 156 aa  228  3e-59  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.438706  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0752  30S ribosomal protein S7  68.79 
 
 		 157 aa  228  3e-59  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.637103  normal  0.155777 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2636  30S ribosomal protein S7  71.15 
 
 		 156 aa  227  5e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.72727  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0245  30S ribosomal protein S7  71.15 
 
 		 156 aa  227  5e-59  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0896846  normal  0.195171 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3781  30S ribosomal protein S7  71.15 
 
 		 156 aa  227  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000664759  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3072  30S ribosomal protein S7  71.15 
 
 		 156 aa  227  5e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0565746  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3808  30S ribosomal protein S7  71.15 
 
 		 156 aa  227  5e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3750  30S ribosomal protein S7  71.15 
 
 		 156 aa  227  5e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.023964  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3474  30S ribosomal protein S7  71.15 
 
 		 156 aa  227  5e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0150358  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1920  30S ribosomal protein S7  71.15 
 
 		 156 aa  227  5e-59  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000398432  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3173  30S ribosomal protein S7  71.15 
 
 		 156 aa  227  5e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000883465  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04527  30S ribosomal protein S7  70.25 
 
 		 155 aa  227  6e-59  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000390925  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2328  30S ribosomal protein S7  68.59 
 
 		 156 aa  226  7e-59  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000157389  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0049  30S ribosomal protein S7  70.51 
 
 		 156 aa  225  1e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000574292  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3443  30S ribosomal protein S7  70.51 
 
 		 156 aa  226  1e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000140353  normal  0.136335 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2193  30S ribosomal protein S7  68.59 
 
 		 155 aa  226  1e-58  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.486436  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0323  30S ribosomal protein S7  70.51 
 
 		 156 aa  226  1e-58  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.282632  normal  0.0186203 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2763  30S ribosomal protein S7  70.51 
 
 		 156 aa  226  1e-58  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00114858  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0272  30S ribosomal protein S7  70.51 
 
 		 156 aa  226  1e-58  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.971221  normal  0.670435 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0263  30S ribosomal protein S7  70.51 
 
 		 156 aa  226  1e-58  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.470053  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0344  30S ribosomal protein S7  70.51 
 
 		 156 aa  226  1e-58  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.94658  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3648  30S ribosomal protein S7  70.51 
 
 		 156 aa  224  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000151904  hitchhiker  0.000000000898288 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0310  30S ribosomal protein S7  70.51 
 
 		 156 aa  224  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0015989  normal  0.294423 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2844  30S ribosomal protein S7  70.51 
 
 		 156 aa  224  2e-58  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.507183  normal  0.20992 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0046  30S ribosomal protein S7  70.51 
 
 		 156 aa  225  2e-58  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000296735  hitchhiker  6.48919e-23 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2103  30S ribosomal protein S7  67.95 
 
 		 155 aa  224  2e-58  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0715  30S ribosomal protein S7  67.95 
 
 		 156 aa  225  2e-58  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000287313  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1949  30S ribosomal protein S7  69.23 
 
 		 156 aa  224  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.740845  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0315  30S ribosomal protein S7  69.23 
 
 		 156 aa  224  4e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  decreased coverage  9.99875e-22  hitchhiker  0.000536681 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0927  30S ribosomal protein S7  67.31 
 
 		 156 aa  224  4e-58  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000491637  hitchhiker  0.000862524 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0601  30S ribosomal protein S7  68.79 
 
 		 156 aa  224  4e-58  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00129105  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1552  30S ribosomal protein S7  67.31 
 
 		 156 aa  223  6e-58  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00138461  normal  0.948328 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4766  30S ribosomal protein S7  66.67 
 
 		 156 aa  223  7e-58  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.256339  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2173  ribosomal protein S7  69.87 
 
 		 155 aa  223  8e-58  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.147945  normal  0.690329 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4280  30S ribosomal protein S7  68.15 
 
 		 157 aa  223  8e-58  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000700691  unclonable  0.00000000000287747 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1930  30S ribosomal protein S7  68.59 
 
 		 156 aa  222  1e-57  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2015  30S ribosomal protein S7  68.59 
 
 		 156 aa  222  1e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3447  30S ribosomal protein S7  68.59 
 
 		 156 aa  221  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0304282  normal  0.373801 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1908  30S ribosomal protein S7  67.31 
 
 		 156 aa  221  3e-57  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.049372 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3326  30S ribosomal protein S7  69.23 
 
 		 156 aa  221  3e-57  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0291  30S ribosomal protein S7  67.09 
 
 		 157 aa  221  4e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000126021  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3023  30S ribosomal protein S7  68.59 
 
 		 156 aa  220  4.9999999999999996e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0000569817  decreased coverage  0.00269493 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2954  30S ribosomal protein S7  68.59 
 
 		 156 aa  220  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0404513  hitchhiker  0.000060996 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3301  30S ribosomal protein S7  68.59 
 
 		 156 aa  220  4.9999999999999996e-57  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00000779893  hitchhiker  0.00480124 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2772  30S ribosomal protein S7  68.79 
 
 		 156 aa  220  4.9999999999999996e-57  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000143156  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1952  30S ribosomal protein S7  66.03 
 
 		 156 aa  220  6e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00000345641  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1360  30S ribosomal protein S7  64.74 
 
 		 156 aa  220  7e-57  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.600626 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3184  30S ribosomal protein S7  67.95 
 
 		 156 aa  219  8e-57  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0610715  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3342  30S ribosomal protein S7  68.59 
 
 		 156 aa  219  8e-57  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00383081  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3862  30S ribosomal protein S7  67.95 
 
 		 156 aa  219  8e-57  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0676  30S ribosomal protein S7  66.03 
 
 		 156 aa  219  8e-57  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.00139219  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0450  30S ribosomal protein S7  67.31 
 
 		 156 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0295757  unclonable  0.000000315052 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1200  30S ribosomal protein S7  66.03 
 
 		 156 aa  219  9.999999999999999e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.764609  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1834  30S ribosomal protein S7  66.03 
 
 		 156 aa  219  9.999999999999999e-57  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0342202  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1237  30S ribosomal protein S7  66.03 
 
 		 156 aa  219  9.999999999999999e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4753  30S ribosomal protein S7  67.31 
 
 		 156 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00430296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3913  30S ribosomal protein S7  67.31 
 
 		 156 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.240756  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00699  30S ribosomal protein S7  66.88 
 
 		 156 aa  219  9.999999999999999e-57  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.000258418  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0417  30S ribosomal protein S7  66.03 
 
 		 156 aa  219  9.999999999999999e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00230825  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5074  30S ribosomal protein S7  63.46 
 
 		 156 aa  219  9.999999999999999e-57  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.182809  normal  0.19105 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0483  30S ribosomal protein S7  67.31 
 
 		 156 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0139239  normal  0.0328546 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0480  30S ribosomal protein S7  67.31 
 
 		 156 aa  219  9.999999999999999e-57  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.037317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0833  30S ribosomal protein S7  67.31 
 
 		 156 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.628851  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0357  30S ribosomal protein S7  64.1 
 
 		 156 aa  218  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.720773  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2291  30S ribosomal protein S7  64.1 
 
 		 156 aa  218  1.9999999999999999e-56  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.379406 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1342  30S ribosomal protein S7  67.31 
 
 		 156 aa  218  1.9999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000656375  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08810  30S ribosomal protein S7  67.31 
 
 		 156 aa  219  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.517353  normal  0.0114228 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4694  30S ribosomal protein S7  68.15 
 
 		 156 aa  218  3e-56  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00127766  unclonable  0.0000000319623 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5083  30S ribosomal protein S7  68.79 
 
 		 157 aa  218  3e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000594669  normal  0.504343 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4008  30S ribosomal protein S7  66.88 
 
 		 156 aa  218  3e-56  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000190048  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06200  30S ribosomal protein S7  66.03 
 
 		 156 aa  218  3e-56  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3439  30S ribosomal protein S7  65.38 
 
 		 156 aa  218  3e-56  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000192356  decreased coverage  0.0000249886 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0227  30S ribosomal protein S7  67.52 
 
 		 156 aa  217  3.9999999999999997e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0195  30S ribosomal protein S7  67.52 
 
 		 156 aa  217  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0296111  hitchhiker  0.00000562021 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0190  30S ribosomal protein S7  67.52 
 
 		 156 aa  217  3.9999999999999997e-56  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0202713  decreased coverage  0.000349844 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0209  30S ribosomal protein S7  67.52 
 
 		 156 aa  217  3.9999999999999997e-56  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000277948  unclonable  0.00000838241 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0154  30S ribosomal protein S7  68.15 
 
 		 156 aa  217  5e-56  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00529705  decreased coverage  0.0000385897 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4550  30S ribosomal protein S7  66.88 
 
 		 156 aa  217  5e-56  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  unclonable  0.000000000147875  normal  0.0998132 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0195  30S ribosomal protein S7  67.52 
 
 		 156 aa  217  5e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0242327  hitchhiker  0.000000200344 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3799  30S ribosomal protein S7  67.52 
 
 		 157 aa  216  7e-56  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.0000000156972  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0252  30S ribosomal protein S7  67.52 
 
 		 157 aa  216  7e-56  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  hitchhiker  0.000000213878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1675  30S ribosomal protein S7  64.1 
 
 		 156 aa  216  7.999999999999999e-56  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.291204  hitchhiker  0.00290969 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0372  ribosomal protein S7  66.88 
 
 		 179 aa  216  8.999999999999998e-56  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000181403  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0180  30S ribosomal protein S7  67.52 
 
 		 156 aa  216  8.999999999999998e-56  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00000536383  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0622  ribosomal protein S7  66.67 
 
 		 156 aa  216  8.999999999999998e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0341393  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0697  30S ribosomal protein S7  67.95 
 
 		 156 aa  216  1e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  5.92672e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0802  30S ribosomal protein S7  64.97 
 
 		 157 aa  216  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.26449  normal  0.250065 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1064  30S ribosomal protein S7  65.38 
 
 		 156 aa  216  1e-55  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000327115  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03192  30S ribosomal protein S7  66.88 
 
 		 156 aa  215  2e-55  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000237344  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3810  30S ribosomal protein S7  66.88 
 
 		 156 aa  215  2e-55  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000103043  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1541  30S ribosomal protein S7  62.82 
 
 		 156 aa  215  2e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.584578  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00056  30S ribosomal protein S7  65.61 
 
 		 156 aa  215  2e-55  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3643  30S ribosomal protein S7  66.88 
 
 		 156 aa  215  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.0000228448  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0199  30S ribosomal protein S7  67.52 
 
 		 157 aa  215  2e-55  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000133398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0372  30S ribosomal protein S7  66.88 
 
 		 156 aa  215  2e-55  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000127849  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>