261 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0264 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0264  cytochrome c class I  100 
 
 		 112 aa  221  2e-57  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.453378  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1968  cytochrome c class I  49.55 
 
 		 238 aa  92.8  1e-18  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000548419  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0123  cytochrome c class I  53.68 
 
 		 418 aa  89.4  1e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.266844  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0149  cytochrome c class I  42.27 
 
 		 287 aa  82.8  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.481052  normal  0.118184 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3091  cytochrome c class I  50 
 
 		 273 aa  83.2  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.994793  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2881  cytochrome c, class I  46.59 
 
 		 103 aa  79  0.00000000000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2365  cytochrome c class I  38.18 
 
 		 107 aa  71.2  0.000000000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.956584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1873  putative cytochrome c  37.5 
 
 		 102 aa  69.3  0.00000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.490249  normal  0.677809 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0751  cytochrome c, class I  42.24 
 
 		 112 aa  67.4  0.00000000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000617346  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0629  cytochrome c, class I  42.86 
 
 		 102 aa  64.3  0.0000000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  decreased coverage  0.000000000291429  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3049  cytochrome c, class I  37.17 
 
 		 113 aa  63.2  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000419911  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3958  cytochrome c, class I  39.56 
 
 		 108 aa  60.5  0.000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.990396  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3716  cytochrome c, class I  39.47 
 
 		 206 aa  60.5  0.000000009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000156417  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0283  cytochrome c family protein  41.41 
 
 		 318 aa  59.3  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00014  cytochrome c4 cytochrome C, class I in atlantica  42.34 
 
 		 207 aa  59.3  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0335  cytochrome c, class I  37.27 
 
 		 96 aa  58.5  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.906933 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3611  cytochrome c class I  39.47 
 
 		 217 aa  57.8  0.00000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00161979  hitchhiker  0.0000000311228 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002765  cytochrome c553  39.13 
 
 		 104 aa  57  0.00000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.38085  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0346  cytochrome c, class I  40.52 
 
 		 217 aa  57  0.00000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0101877 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1922  cytochrome c family protein  37.39 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0013  cytochrome c, class I  40.54 
 
 		 229 aa  55.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.741785  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2793  cytochrome c, class I  42.45 
 
 		 379 aa  55.8  0.0000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0531198  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1085  cytochrome c class I  32.74 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.032196  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2630  cytochrome c, class I  40.43 
 
 		 220 aa  55.5  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.930488  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1032  cytochrome c family protein  32.74 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3416  cytochrome c family protein  32.74 
 
 		 105 aa  55.1  0.0000003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2807  cytochrome c class I  39.32 
 
 		 217 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.988864 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1833  cytochrome c554  36.75 
 
 		 107 aa  54.3  0.0000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4666  cytochrome c  35.4 
 
 		 207 aa  53.9  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2249  cytochrome c class I  36.17 
 
 		 119 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.802822 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2409  cytochrome c-552  42.68 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0281  cytochrome c class I  37.61 
 
 		 217 aa  53.1  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.174718  normal  0.337626 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0624  cytochrome c, class I  35.14 
 
 		 211 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3327  cytochrome c, class I  25.45 
 
 		 206 aa  52.8  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  unclonable  0.000000098516 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2170  cytochrome c class I  34.57 
 
 		 221 aa  52.8  0.000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0615  cytochrome c, class I  26.36 
 
 		 218 aa  52.4  0.000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0359  cytochrome c class I  36.75 
 
 		 217 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0594  cytochrome c class I  26.36 
 
 		 218 aa  52.8  0.000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3908  cytochrome c, class I  36.94 
 
 		 207 aa  52  0.000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2727  cytochrome c, class I  36.75 
 
 		 217 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3907  cytochrome c, class I  35.14 
 
 		 207 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0045605  normal  0.272938 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3999  cytochrome c, class I  35.14 
 
 		 207 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.898029  normal  0.022349 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4451  cytochrome c class I  36.05 
 
 		 168 aa  52.8  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.676804  normal  0.145709 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03219  hypothetical protein  37.39 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0380  cytochrome c, class I  36.75 
 
 		 217 aa  52.4  0.000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4111  cytochrome c, class I  35.14 
 
 		 207 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.148177  normal  0.590499 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0091  cytochrome c, class I  36.94 
 
 		 206 aa  52.4  0.000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.00000000145105  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1068  cytochrome c family protein  32.08 
 
 		 206 aa  52  0.000003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.230608  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4347  cytochrome c class I  36.04 
 
 		 207 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000000000402028  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0051  cytochrome c class I  36.04 
 
 		 207 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00284279  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4292  cytochrome c class I  36.04 
 
 		 207 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.0000000136847  unclonable  0.00000000000512206 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0210  cytochrome c, class I  36.04 
 
 		 200 aa  52  0.000003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.478667  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4487  cytochrome c class I  36.04 
 
 		 207 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000352733  normal  0.0165724 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2369  cytochrome c, class I  35.11 
 
 		 119 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.166553  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0094  cytochrome c, class I  38.74 
 
 		 206 aa  51.6  0.000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00310871  decreased coverage  0.00000781089 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1071  cytochrome c, class I  33.64 
 
 		 105 aa  51.2  0.000004  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.0930552  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0057  cytochrome c class I  37.84 
 
 		 206 aa  50.8  0.000005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.53791  hitchhiker  0.00143417 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0952  cytochrome c, class I  33.33 
 
 		 192 aa  51.2  0.000005  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000198815  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04432  cytochrome C4  38.46 
 
 		 252 aa  50.8  0.000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3008  cytochrome c, class I  36.54 
 
 		 196 aa  50.1  0.000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1587  cytochrome c, class I  26.61 
 
 		 220 aa  50.1  0.00001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0500716  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3147  cytochrome c, class I  34.17 
 
 		 219 aa  49.7  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1543  cytochrome c-553  32.08 
 
 		 102 aa  50.1  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.31178  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3479  cytochrome c, class I  35.9 
 
 		 217 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5672  cytochrome c, class I  34.04 
 
 		 119 aa  49.7  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2702  cytochrome c, class I  34.51 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.482609  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3036  cytochrome c family protein  35.65 
 
 		 265 aa  50.1  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0623  cytochrome c family protein  39.74 
 
 		 208 aa  49.7  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.000405798  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2377  cytochrome c, class I  32.32 
 
 		 224 aa  49.7  0.00001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000176036  hitchhiker  0.0000215746 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3398  cytochrome c, class I  35.65 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389658  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003031  cytochrome c4  34.62 
 
 		 203 aa  50.1  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1295  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 276 aa  50.1  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.669902 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2099  cytochrome c class I  34.26 
 
 		 127 aa  48.9  0.00002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.149898 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0543  cytochrome c family protein  39.74 
 
 		 208 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0572  cytochrome c family protein  37.18 
 
 		 208 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3769  cytochrome c family protein  37.18 
 
 		 208 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2353  cytochrome c class I  32.98 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.398781 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0567  cytochrome c family protein  37.18 
 
 		 208 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2676  hypothetical protein  32.99 
 
 		 269 aa  49.3  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.543217 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1718  cytochrome c, class I  32.98 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.507301  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2330  cytochrome c, class I  32.98 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0100  cytochrome c class I  38.74 
 
 		 206 aa  49.3  0.00002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0084  glutamate racemase 2  34.21 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.0000295238  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0011  cytochrome c class I  31.08 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.159983  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2027  cytochrome c, class IC  32.76 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2034  sulfide dehydrogenase (flavocytochrome), cytochrome c subunit  34.18 
 
 		 98 aa  48.5  0.00003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.738809 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0076  cytochrome c4 precursor  35.14 
 
 		 227 aa  48.5  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.699547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3569  cytochrome c, class I  37.72 
 
 		 202 aa  48.5  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.697012  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8118  cytochrome c class I  35.45 
 
 		 270 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0808523  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001915  cytochrome c4  32.29 
 
 		 205 aa  48.1  0.00004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.352914  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0947  cytochrome c class I  32.98 
 
 		 119 aa  48.1  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.745275  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0308  cytochrome c class I  35.04 
 
 		 217 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.618372  normal  0.165447 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0519  cytochrome c family protein  37.18 
 
 		 208 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.135917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0299  cytochrome c, class I  35.04 
 
 		 217 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.194352  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3607  cytochrome c family protein  37.18 
 
 		 208 aa  48.1  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0102183  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0934  cytochrome c class I  35 
 
 		 117 aa  47.8  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0908  cytochrome c, class I  32.46 
 
 		 121 aa  47.8  0.00005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.413276  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0089  cytochrome c class I  39.13 
 
 		 205 aa  47.8  0.00005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3284  cytochrome c, class I  33.68 
 
 		 219 aa  47.8  0.00005  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0528  cytochrome c family protein  34.62 
 
 		 204 aa  47.8  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000129168  normal  0.22493 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>