More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0227 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_3069  HAD family hydrolase  49.31 
 
 
720 aa  653    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0227  sucrose-phosphate synthase  100 
 
 
784 aa  1593    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0132674  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0708  sucrose-phosphate synthase  51.04 
 
 
722 aa  699    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2312  sucrose-phosphate synthase  49.45 
 
 
723 aa  671    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.407263 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3516  sucrose-phosphate synthase  48.97 
 
 
716 aa  676    Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2912  sucrose-phosphate synthase  48.87 
 
 
718 aa  642    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1794  sucrose-phosphate synthase  47.23 
 
 
724 aa  634  1e-180  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.399032  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2267  sucrose-phosphate phosphatase  46 
 
 
721 aa  604  1.0000000000000001e-171  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0311712  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2610  sucrose-phosphate synthase, glycosyltransferase region  45.39 
 
 
725 aa  602  1e-170  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1551  sucrose phosphate synthase  43.53 
 
 
714 aa  546  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1267  sucrose-phosphate synthase  43.53 
 
 
714 aa  546  1e-154  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.327347 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0650  sucrose-phosphate synthase  40.95 
 
 
735 aa  522  1e-147  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238518  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0808  HAD family hydrolase  41.12 
 
 
709 aa  520  1e-146  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2315  sucrose-phosphate synthase  41.67 
 
 
709 aa  491  1e-137  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2689  sucrose-phosphate synthase  40.4 
 
 
707 aa  465  1e-129  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.288748  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_30171  sucrose phosphate synthase  41.36 
 
 
707 aa  465  1e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.169301 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_21951  sucrose phosphate synthase  38.72 
 
 
702 aa  460  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.269726  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1322  sucrose-phosphate synthase  38 
 
 
708 aa  456  1e-127  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.435001  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3967  sucrose-phosphate phosphatase subfamily protein  36.64 
 
 
729 aa  455  1.0000000000000001e-126  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.205238  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_19021  sucrose phosphate synthase  43.56 
 
 
470 aa  416  9.999999999999999e-116  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.756574  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_19201  sucrose phosphate synthase  45.35 
 
 
469 aa  413  1e-114  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.8791  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3683  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  36.08 
 
 
762 aa  415  1e-114  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_19011  sucrose phosphate synthase  45.87 
 
 
469 aa  414  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.799465  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1803  sucrose-phosphate synthase  45.1 
 
 
469 aa  411  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_18491  sucrose phosphate synthase  46.4 
 
 
466 aa  402  9.999999999999999e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.179299 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0284  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  36.28 
 
 
688 aa  353  5.9999999999999994e-96  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.533678  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0143  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IIB  34.66 
 
 
684 aa  347  5e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.279801  normal  0.574504 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0200  HAD family hydrolase  35.53 
 
 
684 aa  346  1e-93  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.70537 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18210  Sucrose-phosphate synthase  31.97 
 
 
496 aa  234  6e-60  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.338675  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0446  sucrose-phosphate synthase  33.04 
 
 
479 aa  224  4.9999999999999996e-57  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1867  sucrose-phosphate synthase  32.66 
 
 
472 aa  216  9.999999999999999e-55  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0533  sucrose synthase  29.89 
 
 
423 aa  184  7e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1752  Sucrose synthase  29.08 
 
 
806 aa  176  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353077  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0177  Sucrose synthase  30.6 
 
 
792 aa  174  6.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3776  Sucrose synthase  28.77 
 
 
805 aa  172  2e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2283  sucrose synthase, glycosyl transferase, group 1  27.25 
 
 
806 aa  166  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.356959  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1751  glycosyl transferase group 1  29.07 
 
 
453 aa  165  3e-39  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3275  glycosyl transferase group 1  28.99 
 
 
448 aa  162  2e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.37662  normal  0.10693 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3068  sucrose synthase  28.26 
 
 
795 aa  159  2e-37  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3916  Sucrose synthase  27.79 
 
 
803 aa  157  6e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.067328 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3753  sucrose synthase, glycosyl transferase, group 1  26.1 
 
 
805 aa  156  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.115007 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2266  sucrose synthase  26.88 
 
 
794 aa  156  2e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.856509  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3106  glycosyl transferase group 1  30.12 
 
 
435 aa  155  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1552  sucrose synthase, putative  28.14 
 
 
814 aa  155  4e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1268  Sucrose synthase  28.29 
 
 
793 aa  154  5e-36  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.209481  normal  0.340227 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5640  glycosyl transferase, group 1  28.63 
 
 
438 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.172665 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3257  glycosyl transferase group 1  27.94 
 
 
426 aa  149  2.0000000000000003e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4390  glycosyl transferase, group 1  28.67 
 
 
419 aa  148  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.907942  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  28.11 
 
 
424 aa  148  5e-34  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6388  glycosyl transferase group 1  28.42 
 
 
438 aa  147  6e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.570684  normal  0.371052 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1795  phosphoheptose isomerase  29.44 
 
 
650 aa  144  7e-33  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5593  glycosyl transferase group 1  27.82 
 
 
440 aa  144  7e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.420787 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1748  glycosyl transferase group 1  32.6 
 
 
402 aa  144  9e-33  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0115341 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3301  glycosyl transferase, group 1  27.49 
 
 
422 aa  142  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.758108  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6048  glycosyl transferase group 1  27.41 
 
 
439 aa  143  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0604596 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1373  glycosyl transferase, group 1  27.41 
 
 
439 aa  142  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6456  glycosyl transferase, group 1  27.41 
 
 
439 aa  142  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.338178  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2924  glycosyl transferase group 1  29.19 
 
 
477 aa  142  3e-32  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5452  glycosyl transferase group 1  28.87 
 
 
438 aa  142  3e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.490154  hitchhiker  0.00474748 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0998  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.57 
 
 
499 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2262  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.57 
 
 
495 aa  139  3.0000000000000003e-31  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.333753  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3028  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.1 
 
 
498 aa  137  5e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.220926  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1977  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.12 
 
 
443 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.26927  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1287  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.12 
 
 
443 aa  137  6.0000000000000005e-31  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1377  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.64 
 
 
443 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.233611  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0215  sucrose synthase  26.84 
 
 
809 aa  137  7.000000000000001e-31  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.413159  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3157  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.64 
 
 
443 aa  137  7.000000000000001e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5045  glycosyl transferase group 1  26.03 
 
 
422 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.022612 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5250  glycosyl transferase group 1  28.05 
 
 
430 aa  135  3.9999999999999996e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.01095 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3727  glycosyl transferase group 1  27.98 
 
 
672 aa  133  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.121085  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3411  glycosyl transferase, group 1  28.14 
 
 
425 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00000000163553  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3803  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 
437 aa  131  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4880  glycosyl transferase group 1  27.75 
 
 
437 aa  131  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.240257  normal  0.0389994 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4553  group 1 glycosyl transferase  26.09 
 
 
423 aa  130  7.000000000000001e-29  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0151  glycosyl transferase group 1  25.47 
 
 
434 aa  130  8.000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2973  UDP-N-acetylglucosamine  33.41 
 
 
417 aa  128  4.0000000000000003e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1762  glycosyl transferase, group 1  31.49 
 
 
406 aa  127  6e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.379632 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0331  glycosyl transferase, group 1  30.72 
 
 
482 aa  127  6e-28  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0890  glycosyl transferase, group 1  30.14 
 
 
405 aa  127  9e-28  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0223562  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0073  glycosyl transferase, group 1  31.45 
 
 
448 aa  126  2e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_874  glycosyl transferase, group 1  29.89 
 
 
405 aa  124  5e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.285682  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11330  glycosyltransferase  29.17 
 
 
403 aa  123  9.999999999999999e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.902273 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0398  glycosyl transferase group 1  30.73 
 
 
448 aa  123  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.348364  hitchhiker  0.00367672 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2913  putative glycosyltransferase  30.14 
 
 
434 aa  123  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0740  putative glycosyl transferase  26.91 
 
 
442 aa  123  9.999999999999999e-27  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.053122  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0713  glycosyl transferase, group 1  28.47 
 
 
405 aa  123  9.999999999999999e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0559363  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6162  glycosyl transferase group 1  29.33 
 
 
434 aa  121  3.9999999999999996e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.189514 
 
 
-
 
NC_002936  DET1002  glycosyl transferase, group 1 family protein  28.35 
 
 
405 aa  120  7e-26  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00183695  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1573  glycosyl transferase group 1  28.21 
 
 
420 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.539919  normal  0.0199703 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7902  glycosyltransferase  29.08 
 
 
406 aa  119  3e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2249  glycosyl transferase group 1  27.66 
 
 
423 aa  117  1.0000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.143292  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0653  UDP-N-acetylglucosamine  31.03 
 
 
443 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.119521  hitchhiker  0.000107829 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2209  glycosyl transferase group 1  27.6 
 
 
421 aa  115  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0688071 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2637  glycosyl transferase, group 1  28.09 
 
 
421 aa  115  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.731543  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0898  hypothetical protein  28.5 
 
 
407 aa  114  5e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4050  glycosyl transferase, group 1  29.05 
 
 
458 aa  115  5e-24  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2087  UDP-N-acetylglucosamine  31.03 
 
 
424 aa  114  8.000000000000001e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5953  UDP-N-acetylglucosamine  30.14 
 
 
443 aa  114  1.0000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31920  UDP-N-acetylglucosamine: 1L-myo-inositol-1-phosphate 1-alpha-D-N-acetylglucosaminyltransferase  30.11 
 
 
420 aa  112  2.0000000000000002e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1310  group 1 glycosyl transferase  26.23 
 
 
426 aa  111  5e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>