18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0206 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0206  outer membrane efflux protein  100 
 
 		 454 aa  900    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.00461371  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1145  outer membrane efflux protein  27.37 
 
 		 442 aa  113  7.000000000000001e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.284786  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_18540  outer membrane efflux protein  30.28 
 
 		 426 aa  108  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.134625  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4566  outer membrane efflux protein  27.81 
 
 		 449 aa  99.4  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2385  outer membrane efflux protein  29.58 
 
 		 421 aa  95.9  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00190513  normal  0.103604 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2098  outer membrane efflux protein  29.58 
 
 		 421 aa  95.9  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1739  outer membrane efflux protein  28.83 
 
 		 400 aa  92.4  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.329774 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1332  outer membrane efflux protein  31.3 
 
 		 441 aa  92  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.592234  normal  0.169457 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1652  hypothetical protein  27.19 
 
 		 431 aa  89.7  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.166276  normal  0.447974 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1748  putative outer membrane protein  28.96 
 
 		 395 aa  81.6  0.00000000000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.617475  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2620  Outer membrane efflux protein  25.84 
 
 		 432 aa  79.7  0.00000000000009  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.612539 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2671  putative outer membrane protein  28.36 
 
 		 423 aa  78.6  0.0000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.121149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0141  outer membrane efflux protein  26.73 
 
 		 412 aa  77.4  0.0000000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0006  Outer membrane protein-like  23.88 
 
 		 397 aa  75.1  0.000000000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00129905  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2211  outer membrane efflux protein  23.4 
 
 		 431 aa  65.1  0.000000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.603801 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2718  hypothetical protein  21.08 
 
 		 389 aa  59.7  0.00000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.057627  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3244  hypothetical protein  23.99 
 
 		 417 aa  51.6  0.00003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.875703  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2151  outer membrane efflux protein  22.43 
 
 		 419 aa  46.2  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>