More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0127 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0127  OmpA/MotB domain protein  100 
 
 
364 aa  736    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2110  OmpA/MotB domain-containing protein  40.22 
 
 
304 aa  185  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.396031  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1579  OmpA family domain-containing protein  39.59 
 
 
333 aa  170  3e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0659118  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1814  OmpA/MotB  34.5 
 
 
321 aa  156  4e-37  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0898802  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0239  OmpA/MotB domain-containing protein  36.77 
 
 
317 aa  155  7e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7144  OmpA family protein  36.36 
 
 
332 aa  154  2e-36  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3583  OmpA/MotB domain-containing protein  35.19 
 
 
485 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.333267 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0594  OmpA/MotB domain-containing protein  33.21 
 
 
479 aa  146  5e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.867579  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0452  OmpA/MotB domain-containing protein  34.71 
 
 
481 aa  144  2e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0951  OmpA/MotB domain-containing protein  34.15 
 
 
485 aa  143  4e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.212652 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0901  OmpA/MotB domain-containing protein  34.49 
 
 
485 aa  143  6e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0916  OmpA/MotB domain-containing protein  34.15 
 
 
485 aa  142  6e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.901686 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0915  OmpA/MotB domain-containing protein  34.15 
 
 
485 aa  142  7e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.836858  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2418  OmpA/MotB domain protein  34.62 
 
 
337 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.609181  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2070  OmpA/MotB domain protein  32.9 
 
 
350 aa  140  3e-32  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  decreased coverage  0.00000257303  normal  0.403865 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2043  OmpA/MotB domain protein  33.77 
 
 
349 aa  140  4.999999999999999e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0433092  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0236  OmpA/MotB  37.28 
 
 
334 aa  140  4.999999999999999e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.906907  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2084  OmpA/MotB domain-containing protein  34.21 
 
 
337 aa  139  7.999999999999999e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000772765  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  33.57 
 
 
487 aa  136  5e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0150  OmpA/MotB domain-containing protein  33.21 
 
 
487 aa  136  5e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0697  outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (LipO)protein  32.98 
 
 
484 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0145  OmpA/MotB domain-containing protein  33.57 
 
 
487 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2320  OmpA/MotB domain protein  32.33 
 
 
331 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0285  hypothetical protein  32.86 
 
 
364 aa  131  1.0000000000000001e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000131916  decreased coverage  0.000000274042 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0698  Outer membrane protein-related peptidoglycan-associated (lipo)protein  33.11 
 
 
481 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0632  OmpA/MotB domain-containing protein  31.27 
 
 
481 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0736  OmpA/MotB domain-containing protein  30.43 
 
 
497 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5600  OmpA/MotB domain protein  50.47 
 
 
537 aa  117  3e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.372086  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1209  OmpA/MotB domain-containing protein  45.6 
 
 
369 aa  113  5e-24  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.469659  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0482  OmpA family outer membrane protein  46.61 
 
 
620 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.83961  normal  0.790259 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1255  Outer membrane protein and related peptidoglycan-associated (lipo)proteins-like  44.14 
 
 
422 aa  108  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.201684  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0509  surface antigen protein  44.36 
 
 
218 aa  107  2e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0324571  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1411  OmpA/MotB domain-containing protein  31.91 
 
 
326 aa  107  3e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.271833  normal  0.902662 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2454  outer membrane protein  51.82 
 
 
402 aa  107  4e-22  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4592  OmpA/MotB domain-containing protein  50.47 
 
 
296 aa  105  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3949  OmpA/MotB family outer membrane protein  44.07 
 
 
407 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.243665  normal  0.26275 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2141  outer membrane protein  37.4 
 
 
510 aa  104  2e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.496848  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0711  ompA family protein  45.61 
 
 
215 aa  103  7e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0433789  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1059  ompA family protein  45.61 
 
 
215 aa  103  7e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1615  ompA family protein  45.61 
 
 
215 aa  103  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.180495  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2984  ompA family protein  45.61 
 
 
215 aa  103  7e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00790258  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2302  ompA family protein  45.61 
 
 
215 aa  103  7e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2008  outer membrane protein  40.98 
 
 
509 aa  102  7e-21  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.206588  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1054  ompA family protein  45.61 
 
 
215 aa  103  7e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4073  OmpA/MotB domain-containing protein  45.59 
 
 
319 aa  102  8e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.68736  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1212  ompA family protein  45.61 
 
 
316 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0857  ompA family protein  45.61 
 
 
261 aa  101  2e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0087  OmpA/MotB domain protein  36.6 
 
 
638 aa  101  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.706049 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4115  OmpA/MotB domain protein  42.86 
 
 
525 aa  100  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1016  OmpA/MotB domain protein  45.61 
 
 
217 aa  100  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000464743  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3482  OmpA/MotB family outer membrane protein  45.61 
 
 
217 aa  100  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000110424  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2185  outer membrane protein  42.06 
 
 
694 aa  99.8  7e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.138653 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1731  OmpA/MotB domain protein  44.64 
 
 
623 aa  98.6  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.134193  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1805  outer membrane protein OmpA  50 
 
 
321 aa  99  1e-19  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04793  OmpA family protein  49.51 
 
 
241 aa  99  1e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188001  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2738  OmpA/MotB domain protein  34.19 
 
 
241 aa  99  1e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00260572  hitchhiker  0.0000108242 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2441  OmpA/MotB domain-containing protein  43.86 
 
 
215 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000422184  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1570  OmpA/MotB domain-containing protein  45.13 
 
 
498 aa  98.2  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00583575 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2795  outer membrane protein  44.95 
 
 
266 aa  98.2  2e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2436  OmpA/MotB domain-containing protein  43.86 
 
 
215 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0140056  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0858  OmpA/MotB domain-containing protein  42.98 
 
 
214 aa  98.6  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000645517  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1825  OmpA/MotB  43.86 
 
 
215 aa  98.2  2e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000764276  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0697  OmpA/MotB domain-containing protein  47.79 
 
 
487 aa  97.4  3e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2189  OmpA/MotB domain protein  44.74 
 
 
209 aa  97.1  4e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.406433 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2349  OmpA/MotB domain-containing protein  44.74 
 
 
215 aa  97.1  4e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0905515  normal  0.139964 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2483  OmpA/MotB domain-containing protein  44.74 
 
 
232 aa  97.4  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.421874  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3975  OmpA/MotB domain protein  45.45 
 
 
1026 aa  97.1  5e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0116692  normal  0.107099 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3363  OmpA/MotB domain-containing protein  42.86 
 
 
261 aa  96.7  6e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0019  OmpA/MotB domain-containing protein  49 
 
 
510 aa  96.7  6e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0746655  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4033  OmpA/MotB domain protein  45.1 
 
 
374 aa  96.3  7e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.659004  normal  0.277798 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1995  OmpA/MotB domain-containing protein  41.67 
 
 
388 aa  96.3  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000000205838  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0360  OmpA domain-containing protein  47.52 
 
 
429 aa  96.3  8e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00108723  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5767  OmpA/MotB family protein  43.86 
 
 
214 aa  96.3  8e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00312455  normal  0.42403 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2593  OmpA/MotB domain protein  44.74 
 
 
209 aa  96.3  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.199586 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0926  OmpA/MotB family protein  31.47 
 
 
310 aa  95.5  1e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2190  OmpA/MotB domain-containing protein  42.11 
 
 
217 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.000129773  normal  0.4125 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6933  OmpA/MotB domain protein  44.64 
 
 
630 aa  94.7  2e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2532  OmpA/MotB  46.6 
 
 
319 aa  94.7  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  unclonable  0.0000000000651702  n/a   
 
 
 
NC_008825  Mpe_A2050  outer membrane protein  48.04 
 
 
235 aa  94.7  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3770  OmpA/MotB domain-containing protein  45.54 
 
 
440 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3804  OmpA/MotB domain protein  43.48 
 
 
543 aa  94.4  3e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4347  OmpA/MotB domain protein  47.52 
 
 
206 aa  94  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5155  OmpA/MotB domain protein  46.53 
 
 
187 aa  93.6  5e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.688009  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4193  OmpA/MotB family outer membrane protein  47.52 
 
 
248 aa  93.6  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1591  OmpA/MotB  41.48 
 
 
227 aa  93.6  5e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.237315  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1502  OmpA/MotB domain protein  38.19 
 
 
263 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0641332  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4205  OmpA/MotB domain protein  33.82 
 
 
427 aa  93.2  7e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4220  OmpA/MotB domain-containing protein  38.19 
 
 
263 aa  93.2  7e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.956448  normal  0.667838 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2380  hypothetical protein  42.11 
 
 
209 aa  92.8  8e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.074872  hitchhiker  0.00369317 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1221  OmpA/MotB  46.08 
 
 
240 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2377  outer membrane protein/peptidoglycan-associated (lipo)proteins  48.04 
 
 
427 aa  92.8  8e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.07612e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0675  OmpA  42.98 
 
 
212 aa  92.4  9e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1865  OmpA family protein  43.69 
 
 
241 aa  92.4  1e-17  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4325  OmpA/MotB domain protein  46.53 
 
 
206 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3747  OmpA/MotB family outer membrane protein  44.76 
 
 
542 aa  92  1e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.598443  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3279  OmpA/MotB domain-containing protein  47.52 
 
 
219 aa  92  1e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.209932  normal  0.606856 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1793  OmpA/MotB domain-containing protein  43.69 
 
 
241 aa  92.4  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.224575  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1563  OmpA/MotB domain protein  44.66 
 
 
231 aa  92  1e-17  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.398665  normal  0.301983 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5762  OmpA/MotB domain-containing protein  44.23 
 
 
420 aa  92  1e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4115  OmpA/MotB domain-containing protein  39.86 
 
 
262 aa  92.4  1e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>