More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0073 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0073  glutamate racemase  100 
 
 		 286 aa  577  1.0000000000000001e-163  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2265  glutamate racemase  88.43 
 
 		 288 aa  456  1e-127  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1276  glutamate racemase  45.04 
 
 		 271 aa  238  9e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.696646  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1240  glutamate racemase  44.05 
 
 		 282 aa  236  4e-61  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1755  glutamate racemase  46.47 
 
 		 266 aa  233  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000954192  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1063  glutamate racemase  45.04 
 
 		 263 aa  233  3e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1257  glutamate racemase  44.66 
 
 		 256 aa  231  1e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.402225  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0624  glutamate racemase  46.96 
 
 		 270 aa  229  4e-59  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000306047  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1956  glutamate racemase  46.25 
 
 		 277 aa  223  3e-57  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.201101  normal  0.864089 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1080  glutamate racemase  50 
 
 		 292 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.878635  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2114  glutamate racemase  46.54 
 
 		 287 aa  222  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41440  glutamate racemase  44.57 
 
 		 263 aa  222  7e-57  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.420201  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1943  glutamate racemase  44.57 
 
 		 303 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0952  glutamate racemase  44 
 
 		 271 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.44485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2235  glutamate racemase  45.77 
 
 		 287 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.682473  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0764  glutamate racemase  45.8 
 
 		 265 aa  219  3e-56  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1112  glutamate racemase  47.32 
 
 		 275 aa  219  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0736  glutamate racemase  46.22 
 
 		 265 aa  217  1e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2233  glutamate racemase  42.8 
 
 		 272 aa  217  2e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491949  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3138  glutamate racemase  44.84 
 
 		 295 aa  217  2e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.478139  normal  0.0235103 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2221  glutamate racemase  45.25 
 
 		 285 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0226254  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4745  glutamate racemase  44.3 
 
 		 263 aa  216  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.13389  normal  0.141854 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4214  glutamate racemase  45.45 
 
 		 254 aa  216  4e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5881  glutamate racemase  45.38 
 
 		 285 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0777  glutamate racemase  44.96 
 
 		 265 aa  216  4e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2196  glutamate racemase  45.38 
 
 		 285 aa  216  4e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.626892  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2103  glutamate racemase  44.35 
 
 		 282 aa  215  5.9999999999999996e-55  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.447396  normal  0.629875 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0621  glutamate racemase  44.96 
 
 		 290 aa  215  7e-55  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.158475  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1934  glutamate racemase  44.96 
 
 		 290 aa  215  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0524  glutamate racemase  44.96 
 
 		 290 aa  215  8e-55  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1779  glutamate racemase  43.93 
 
 		 280 aa  213  1.9999999999999998e-54  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.63205 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4453  glutamate racemase  44.96 
 
 		 265 aa  213  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1140  glutamate racemase  40.86 
 
 		 268 aa  212  4.9999999999999996e-54  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1411  glutamate racemase  44.22 
 
 		 284 aa  212  5.999999999999999e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.426181  normal  0.11306 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0796  glutamate racemase  44.57 
 
 		 290 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1799  glutamate racemase  44.57 
 
 		 290 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2060  glutamate racemase  44.57 
 
 		 290 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1088  glutamate racemase  44.57 
 
 		 290 aa  211  1e-53  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2022  glutamate racemase  42.11 
 
 		 288 aa  210  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5311  glutamate racemase  41.11 
 
 		 265 aa  207  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5525  glutamate racemase  46.3 
 
 		 286 aa  203  2e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61660  glutamate racemase  39.92 
 
 		 265 aa  204  2e-51  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.106056 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0754  glutamate racemase  45.16 
 
 		 268 aa  202  6e-51  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2274  glutamate racemase  39.69 
 
 		 270 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0643046  hitchhiker  0.00406767 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1295  glutamate racemase  45.5 
 
 		 276 aa  198  9e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.0764463 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1521  glutamate racemase  48.83 
 
 		 272 aa  195  6e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00432739  normal  0.0343831 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1451  glutamate racemase  44.36 
 
 		 279 aa  193  2e-48  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00367617  normal  0.1291 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2893  glutamate racemase  37.86 
 
 		 260 aa  193  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04380  Glutamate racemase  37.45 
 
 		 263 aa  193  3e-48  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2651  glutamate racemase  43.68 
 
 		 296 aa  192  5e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.589508  normal  0.507569 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2572  glutamate racemase  37.45 
 
 		 260 aa  188  9e-47  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1687  glutamate racemase  37.25 
 
 		 259 aa  188  1e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2867  glutamate racemase  47.88 
 
 		 291 aa  187  1e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2354  glutamate racemase  47.88 
 
 		 291 aa  187  1e-46  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0496334  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2541  glutamate racemase  43.84 
 
 		 272 aa  185  6e-46  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114878 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1360  glutamate racemase  43.38 
 
 		 269 aa  182  6e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2085  glutamate racemase  43.41 
 
 		 271 aa  182  8.000000000000001e-45  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2045  glutamate racemase  40.75 
 
 		 281 aa  181  1e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.36787  normal  0.0203699 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0518  glutamate racemase  43.93 
 
 		 276 aa  180  2e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000716913  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3213  glutamate racemase  42.17 
 
 		 301 aa  179  4e-44  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3114  glutamate racemase  45.66 
 
 		 269 aa  176  5e-43  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2832  glutamate racemase  38.67 
 
 		 275 aa  175  6e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0609148  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06670  glutamate racemase  38.59 
 
 		 264 aa  174  9.999999999999999e-43  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  hitchhiker  0.00000549454  normal  0.0772332 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1411  glutamate racemase  38.28 
 
 		 272 aa  172  5e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.093968  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2597  glutamate racemase  42.49 
 
 		 271 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1848  glutamate racemase  37.85 
 
 		 281 aa  169  5e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00000532867  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1488  glutamate racemase  42.04 
 
 		 296 aa  168  9e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.044045  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1508  glutamate racemase  37.16 
 
 		 273 aa  168  9e-41  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0538  glutamate racemase  40 
 
 		 261 aa  168  1e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000109629  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2884  glutamate racemase  40.57 
 
 		 272 aa  167  1e-40  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.297231 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2038  glutamate racemase  34.12 
 
 		 267 aa  166  4e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00710975  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3247  glutamate racemase  38.77 
 
 		 266 aa  165  8e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3204  glutamate racemase  33.98 
 
 		 267 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.685477  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3790  glutamate racemase  35.29 
 
 		 270 aa  163  3e-39  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0490998  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2602  glutamate racemase  33.46 
 
 		 264 aa  162  6e-39  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0547  glutamate racemase  35.58 
 
 		 276 aa  161  1e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.77942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08350  glutamate racemase  37.82 
 
 		 310 aa  160  2e-38  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0479  glutamate racemase  37.05 
 
 		 265 aa  160  2e-38  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.553791  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4589  glutamate racemase  32.81 
 
 		 269 aa  159  5e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.547606  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4603  glutamate racemase  32.81 
 
 		 269 aa  159  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.171271  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4623  glutamate racemase  32.81 
 
 		 269 aa  159  5e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000438915  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0632  glutamate racemase  32.81 
 
 		 269 aa  159  5e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000756048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4328  glutamate racemase  32.81 
 
 		 267 aa  159  5e-38  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4379  glutamate racemase  32.81 
 
 		 269 aa  158  9e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.119134  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4220  glutamate racemase  32.81 
 
 		 269 aa  158  9e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.328787  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4717  glutamate racemase  32.81 
 
 		 269 aa  158  9e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000252581  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4573  glutamate racemase  32.81 
 
 		 269 aa  158  9e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4236  glutamate racemase  32.81 
 
 		 269 aa  158  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2202  glutamate racemase  38.62 
 
 		 282 aa  158  1e-37  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2517  glutamate racemase  40.6 
 
 		 269 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4404  glutamate racemase  36.06 
 
 		 295 aa  157  2e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2810  glutamate racemase  37.6 
 
 		 308 aa  157  2e-37  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3764  glutamate racemase  35.25 
 
 		 282 aa  157  2e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.030559 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1058  glutamate racemase  38.13 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.213351  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20070  glutamate racemase  37.34 
 
 		 270 aa  156  3e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.189885  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0275  glutamate racemase  36.75 
 
 		 278 aa  156  3e-37  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.147503  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2724  glutamate racemase  36.97 
 
 		 266 aa  156  3e-37  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0664  glutamate racemase  37.89 
 
 		 259 aa  156  3e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1088  glutamate racemase  37.5 
 
 		 266 aa  156  3e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.105005 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0449  glutamate racemase  33.19 
 
 		 267 aa  157  3e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>