More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0065 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0065  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 593 aa  1209    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0432  hypothetical protein  46.8 
 
 		 580 aa  434  1e-120  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.744258  normal  0.621474 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2147  acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like  44.61 
 
 		 590 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2761  acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like protein  44.61 
 
 		 590 aa  432  1e-120  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.054979  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0320  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  45.76 
 
 		 565 aa  432  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0308  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  46.52 
 
 		 565 aa  427  1e-118  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2813  Acyl-coenzyme A synthetases/AMP-(fatty) acid ligases-like protein  44.79 
 
 		 609 aa  425  1e-118  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6091  Acyl-coenzyme A synthetase/AMP-(fatty) acid ligase-like  45.83 
 
 		 584 aa  423  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.316945  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2680  acyl-coenzyme A synthetase/AMP-(fatty) acid ligase-like protein  44.83 
 
 		 609 aa  416  9.999999999999999e-116  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3932  AMP-dependent synthetase and ligase  43.15 
 
 		 570 aa  407  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.297166  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4173  AMP-dependent synthetase and ligase  49.27 
 
 		 458 aa  384  1e-105  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2746  CoA ligase (AMP forming)  46.06 
 
 		 443 aa  345  1e-93  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.913246  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0802  AMP-binding protein  46.3 
 
 		 453 aa  334  3e-90  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2671  Beta-hydroxyacyl-(acyl-carrier-protein) dehydratase FabA/FabZ  40.33 
 
 		 569 aa  333  7.000000000000001e-90  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.669798  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1318  putative CoA ligase (AMP forming)  44.21 
 
 		 466 aa  301  2e-80  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0480  AMP-dependent synthetase and ligase  42.6 
 
 		 446 aa  300  5e-80  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.872653 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3987  hypothetical protein  39.39 
 
 		 448 aa  299  1e-79  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0350  peptide synthase  39.73 
 
 		 450 aa  285  2.0000000000000002e-75  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.693872  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0315  putative AMP-dependent synthetase and ligase family protein  39.29 
 
 		 435 aa  281  3e-74  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.529021  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03741  AMP-ligase  39.03 
 
 		 501 aa  251  2e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3878  AMP-dependent synthetase and ligase  31.16 
 
 		 565 aa  156  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.680679 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3920  AMP-dependent synthetase and ligase  34.33 
 
 		 561 aa  132  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0931  putative AMP-dependent synthetase and ligase  30.82 
 
 		 615 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4765  AMP-dependent synthetase and ligase  28.98 
 
 		 557 aa  124  5e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.652066  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3688  AMP-dependent synthetase and ligase  28.98 
 
 		 557 aa  124  5e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.458035 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4381  AMP-dependent synthetase and ligase  30.97 
 
 		 557 aa  119  9.999999999999999e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.432872  normal  0.130495 
 
 
-
 
NC_003296  RS00787  hypothetical protein  27.43 
 
 		 563 aa  118  3.9999999999999997e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0694  AMP-dependent synthetase and ligase  28.52 
 
 		 562 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0938067  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3060  AMP-dependent synthetase and ligase  29.25 
 
 		 568 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.36768  normal  0.993674 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0436  AMP-dependent synthetase and ligase  27.16 
 
 		 559 aa  115  3e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.595328 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5096  AMP-binding enzyme family protein  27.21 
 
 		 524 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0434  AMP-dependent synthetase and ligase  26.75 
 
 		 563 aa  112  3e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2751  AMP-binding enzyme family protein  27.45 
 
 		 591 aa  110  5e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.859274  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004067  putative surfactin synthetase  29.23 
 
 		 466 aa  108  4e-22  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1491  AMP-dependent synthetase and ligase  27.21 
 
 		 551 aa  106  1e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.969337  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2100  hypothetical protein  27.78 
 
 		 457 aa  102  2e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0893  putative AMP-binding protein  26.85 
 
 		 457 aa  97.8  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.639204  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3382  hypothetical protein  27.91 
 
 		 459 aa  95.5  2e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0322  hypothetical protein  27.1 
 
 		 454 aa  96.3  2e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00168086 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2105  aconitate hydratase  28.12 
 
 		 393 aa  92.8  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4599  hypothetical protein  26.7 
 
 		 454 aa  92  3e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000326637 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3891  hypothetical protein  26.29 
 
 		 459 aa  90.9  7e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4572  AMP-dependent synthetase and ligase  26.17 
 
 		 451 aa  89  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3889  AMP-dependent synthetase and ligase  26.1 
 
 		 453 aa  88.6  3e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.329532 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0437  AMP-binding enzyme  22.27 
 
 		 448 aa  87.8  5e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.219492  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3514  hypothetical protein  25.76 
 
 		 453 aa  85.5  0.000000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0971  3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase  24.02 
 
 		 518 aa  83.6  0.000000000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00727606  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0338  aconitate hydratase  27.67 
 
 		 454 aa  81.6  0.00000000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0347  hypothetical protein  27.67 
 
 		 454 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3679  hypothetical protein  27.67 
 
 		 454 aa  81.6  0.00000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.824748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0349  hypothetical protein  25.71 
 
 		 455 aa  81.3  0.00000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4220  non-ribosomal peptide synthetase  28.21 
 
 		 2628 aa  80.9  0.00000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.663079 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2176  trigger factor (TF)  24.54 
 
 		 518 aa  80.5  0.00000000000009  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.437953  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4077  AMP-dependent synthetase and ligase  27.66 
 
 		 563 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0347  hypothetical protein  26.89 
 
 		 454 aa  79.7  0.0000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000166165 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3602  AMP-dependent synthetase and ligase  28.88 
 
 		 563 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0344  aconitate hydratase  26.24 
 
 		 454 aa  78.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0339  aconitate hydratase  26.65 
 
 		 454 aa  79  0.0000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.53194  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0337  aconitate hydratase  26.65 
 
 		 454 aa  78.2  0.0000000000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4371  hypothetical protein  27.18 
 
 		 454 aa  75.9  0.000000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0443  hypothetical protein  26.24 
 
 		 454 aa  74.7  0.000000000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3742  amino acid adenylation domain protein  27.35 
 
 		 1358 aa  72.4  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.798811  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2266  amino acid adenylation  25.31 
 
 		 1369 aa  72.8  0.00000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.654953  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  27.48 
 
 		 5213 aa  71.2  0.00000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2870  amino acid adenylation domain-containing protein  26.88 
 
 		 3231 aa  70.9  0.00000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.812927 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0288  putative non-ribosomal peptide synthetase  25.42 
 
 		 3294 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1942  putative siderophore non-ribosomal peptide synthetase MbaJ  25.42 
 
 		 3290 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0873  putative non-ribosomal peptide synthetase  25.42 
 
 		 3294 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2086  putative siderophore related no-ribosomal peptide synthase  25.42 
 
 		 3287 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1625  putative non-ribosomal peptide synthetase  25.42 
 
 		 3297 aa  69.3  0.0000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0842979  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1927  putative siderophore non-ribosomal peptide synthetase MbaJ  25.42 
 
 		 3290 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3733  amino acid adenylation domain-containing protein  25.79 
 
 		 1779 aa  68.2  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.279948 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4085  amino acid adenylation domain-containing protein  26.83 
 
 		 2606 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0720  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  26.95 
 
 		 354 aa  65.9  0.000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.324133  normal  0.368954 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0740  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  26.95 
 
 		 354 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.104942 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0726  O-succinylbenzoic acid--CoA ligase  26.95 
 
 		 354 aa  65.1  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.141439  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3252  AMP-dependent synthetase and ligase  22.37 
 
 		 474 aa  65.1  0.000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  25.19 
 
 		 5953 aa  63.5  0.000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2099  hypothetical protein  38.1 
 
 		 124 aa  63.5  0.00000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4786  non-ribosomal peptide synthase  24.81 
 
 		 3219 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.303001  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03040  acyl-CoA synthetase (AMP-forming)/AMP-acid ligase II  27.32 
 
 		 392 aa  63.2  0.00000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2382  AMP-dependent synthetase and ligase  22.34 
 
 		 561 aa  63.5  0.00000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4039  amino acid adenylation domain-containing protein  25.65 
 
 		 3224 aa  62.8  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2648  acyl-CoA synthetases (AMP-forming)/AMP-acid ligases II  28.26 
 
 		 403 aa  62.4  0.00000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0392  O-succinylbenzoate-CoA ligase  25.07 
 
 		 498 aa  62.4  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.172525  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1765  AMP-dependent synthetase and ligase  28.27 
 
 		 514 aa  62.8  0.00000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.459624  normal  0.518074 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0115  acyl-coenzyme A synthetase-related protein  26.67 
 
 		 427 aa  62.4  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3284  AMP-dependent synthetase and ligase  29.32 
 
 		 385 aa  62.4  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1087  putative non-ribosomal peptide synthase  26.58 
 
 		 3235 aa  62  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4120  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  26.53 
 
 		 2720 aa  61.6  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0715236 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2971  AMP-dependent synthetase and ligase  26.02 
 
 		 955 aa  61.2  0.00000005  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  29.34 
 
 		 5328 aa  60.5  0.00000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2790  malonyl-CoA synthase  24.74 
 
 		 512 aa  60.5  0.00000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139685  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1089  putative non-ribosomal peptide synthase  26.2 
 
 		 5467 aa  60.1  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.993162 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2364  peptide synthetase, putative  32.62 
 
 		 3650 aa  59.7  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1674  AMP-dependent synthetase and ligase  24.72 
 
 		 482 aa  60.1  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  26.32 
 
 		 5596 aa  60.1  0.0000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1088  hypothetical protein  26.09 
 
 		 2187 aa  60.1  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3988  hypothetical protein  43.06 
 
 		 100 aa  58.5  0.0000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1615  amino acid adenylation domain-containing protein  24.81 
 
 		 3221 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0566356 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>