36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0064 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013422  Hneap_0064  membrane protein-like protein  100 
 
 
232 aa  455  1e-127  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0433  hypothetical protein  50.39 
 
 
218 aa  132  3.9999999999999996e-30  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.910046  normal  0.683603 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0321  hypothetical protein  43.66 
 
 
224 aa  114  1.0000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.828531 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2745  transmembrane protein  38.76 
 
 
219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0432526  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3933  transmembrane protein  36.82 
 
 
236 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.756729  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2760  membrane protein-like protein  45.24 
 
 
217 aa  112  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.578263  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2812  membrane protein-like protein  45.83 
 
 
214 aa  112  6e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2679  membrane protein-like protein  46.28 
 
 
214 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2146  membrane protein-like  45.24 
 
 
345 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6090  membrane protein-like  46.34 
 
 
217 aa  111  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.255495  normal  0.570567 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0309  putative transmembrane protein  43.85 
 
 
224 aa  108  6e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.817023  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4172  transmembrane protein  39.53 
 
 
221 aa  105  5e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0915  hypothetical protein  45.38 
 
 
236 aa  105  5e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1378  putative transmembrane protein  42.52 
 
 
226 aa  103  3e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0568923  hitchhiker  0.00578013 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3981  transmembrane protein  33.86 
 
 
214 aa  90.5  2e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2670  putative transmembrane protein  37.41 
 
 
214 aa  82.4  0.000000000000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.735807  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1317  transmembrane protein  31.65 
 
 
230 aa  68.9  0.00000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.995439  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0803  hypothetical protein  27.59 
 
 
231 aa  67.8  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0947  putative transmembrane protein  27.59 
 
 
246 aa  67.4  0.0000000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.972023  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2750  hypothetical protein  36.14 
 
 
195 aa  61.2  0.00000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.436057  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0437  hypothetical protein  35.9 
 
 
181 aa  60.5  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.725176  normal  0.529075 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5095  hypothetical protein  32.63 
 
 
181 aa  57.4  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3921  hypothetical protein  36.36 
 
 
183 aa  55.8  0.0000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0435  hypothetical protein  28.88 
 
 
181 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4380  hypothetical protein  36.36 
 
 
185 aa  55.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00449702  normal  0.102332 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3888  hypothetical protein  28.04 
 
 
194 aa  52.8  0.000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.15727 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4802  DNA gyrase subunit B  29.35 
 
 
193 aa  50.4  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0892  putative inner membrane protein  31.17 
 
 
185 aa  48.9  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.700064  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4571  hypothetical protein  26.87 
 
 
187 aa  48.5  0.00008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3601  hypothetical protein  30 
 
 
213 aa  48.1  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.59706  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0481  ketosynthase  30.65 
 
 
204 aa  47.8  0.0002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.912251 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0970  DNA gyrase subunit B  28.78 
 
 
179 aa  45.8  0.0006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000531887  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0693  hypothetical protein  27.16 
 
 
234 aa  44.7  0.001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.218429  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4076  hypothetical protein  29.33 
 
 
213 aa  44.7  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS00790  hypothetical protein  29.35 
 
 
205 aa  44.7  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0114  hypothetical protein  31.31 
 
 
144 aa  43.1  0.003  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>