More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0036 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0036  hypothetical protein  100 
 
 		 204 aa  403  1.0000000000000001e-112  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1541  hypothetical protein  41.18 
 
 		 193 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0551154 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3150  hypothetical protein  41.62 
 
 		 185 aa  149  2e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.942177  normal  0.360239 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1350  SNARE associated Golgi protein  41.94 
 
 		 187 aa  133  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00752365  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2408  inner membrane protein YohD  41.18 
 
 		 189 aa  129  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.425446  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2359  inner membrane protein YohD  41.18 
 
 		 189 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.84239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2516  inner membrane protein YohD  41.18 
 
 		 189 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2315  inner membrane protein YohD  41.18 
 
 		 189 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2404  hypothetical protein  41.18 
 
 		 189 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2736  hypothetical protein  39.25 
 
 		 188 aa  118  7e-26  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.629413  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3263  hypothetical protein  42.86 
 
 		 192 aa  116  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0121567 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02066  conserved inner membrane protein  42.18 
 
 		 192 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0907  hypothetical protein  42.18 
 
 		 192 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.339562  normal  0.188855 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1521  SNARE associated Golgi protein-like protein  42.18 
 
 		 192 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02024  hypothetical protein  42.18 
 
 		 192 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0835  hypothetical protein  42.18 
 
 		 192 aa  115  3.9999999999999997e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2426  hypothetical protein  42.18 
 
 		 192 aa  115  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1511  SNARE associated Golgi protein  42.18 
 
 		 192 aa  115  5e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2271  hypothetical protein  42.18 
 
 		 192 aa  115  5e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2742  DedA family protein  35.22 
 
 		 193 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1368  hypothetical protein  35.64 
 
 		 212 aa  109  3e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000019954  hitchhiker  0.00000047765 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5252  DedA family protein  35.05 
 
 		 220 aa  108  6e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2029  hypothetical protein  36.31 
 
 		 202 aa  105  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.21733  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0542  SNARE associated Golgi protein  31.32 
 
 		 188 aa  105  7e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00029156  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5989  hypothetical protein  32.32 
 
 		 196 aa  103  1e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2487  hypothetical protein  37.75 
 
 		 194 aa  104  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.35222  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5832  SNARE associated Golgi protein  34.78 
 
 		 189 aa  99.8  2e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0701046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1551  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  34.21 
 
 		 212 aa  99.8  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000813787 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69250  hypothetical protein  35.03 
 
 		 196 aa  98.6  6e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1607  phage integrase family site specific recombinase  31.82 
 
 		 201 aa  97.1  1e-19  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000335594  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2688  uncharacterized membrane-associated protein-like protein  32.81 
 
 		 206 aa  95.9  3e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.69909  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5041  hypothetical protein  35.03 
 
 		 214 aa  95.9  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.273824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0291  hypothetical protein  35.29 
 
 		 220 aa  95.5  5e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5127  hypothetical protein  35.67 
 
 		 214 aa  94  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1168  DedA family protein  30.98 
 
 		 203 aa  94  1e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.247815  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5218  DedA family protein  35.03 
 
 		 214 aa  93.6  2e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.488895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0935  DedA family protein  30.77 
 
 		 198 aa  93.2  3e-18  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.754047  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1006  DedA family protein  30.77 
 
 		 198 aa  92.4  4e-18  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.738671  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1474  DedA family protein  34.64 
 
 		 204 aa  92  5e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.313098  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0886  DedA family protein  33.33 
 
 		 198 aa  90.9  1e-17  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0679  conserved hypothetical integral membrane protein, DedA family  37.21 
 
 		 197 aa  89.4  3e-17  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6745  SNARE associated Golgi protein  31.14 
 
 		 189 aa  89  4e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1316  preprotein translocase, YajC subunit  29.12 
 
 		 179 aa  87.4  1e-16  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000599  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1045  DedA family protein  31.11 
 
 		 204 aa  86.7  2e-16  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.429498  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2869  SNARE associated Golgi protein  30.86 
 
 		 203 aa  86.3  3e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0399631 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0504  integral membrane protein  28.57 
 
 		 189 aa  86.3  3e-16  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5466  hypothetical protein  37.58 
 
 		 218 aa  85.5  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.939965  normal  0.0246648 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0298  hypothetical protein  33.76 
 
 		 184 aa  84  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0010  hypothetical protein  34.78 
 
 		 208 aa  75.9  0.0000000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.163704  normal  0.0549348 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0838  hypothetical protein  33.33 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0238  DedA family protein  25.13 
 
 		 211 aa  71.2  0.000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1443  membrane protein, DedA family  31.85 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.611046  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1159  hypothetical protein  31.85 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1400  integral membrane protein  25.62 
 
 		 189 aa  68.6  0.00000000006  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.965854  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1394  SNARE associated Golgi protein  28.19 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.527728  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2003  hypothetical protein  36.3 
 
 		 681 aa  67  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000248877  normal  0.0352178 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0626  SNARE associated Golgi protein  31.37 
 
 		 215 aa  67  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228359  decreased coverage  0.00442875 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0395  SNARE associated Golgi protein  27.78 
 
 		 197 aa  66.2  0.0000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0316  DedA family protein  29.94 
 
 		 207 aa  65.5  0.0000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.414992  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2255  SNARE associated Golgi protein  31.28 
 
 		 213 aa  65.5  0.0000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4765  phosphoesterase PA-phosphatase related  35.56 
 
 		 668 aa  64.3  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.000000123092  hitchhiker  0.00379907 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0402  SNARE associated Golgi protein  25.63 
 
 		 198 aa  64.3  0.000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1081  SNARE associated Golgi protein  31.88 
 
 		 217 aa  64.7  0.000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.831593 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0628  hypothetical protein  26.84 
 
 		 199 aa  64.3  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0887  integral membrane protein  21.81 
 
 		 187 aa  63.9  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2694  inner membrane protein YohD  35.77 
 
 		 182 aa  63.5  0.000000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0310  DedA family protein  28.66 
 
 		 207 aa  63.9  0.000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3549  hypothetical protein  27.82 
 
 		 220 aa  63.5  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.743945  normal  0.678489 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0232  phosphoesterase, PA-phosphatase related  31.54 
 
 		 457 aa  62.8  0.000000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1307  GTP-binding protein  25.79 
 
 		 189 aa  62.4  0.000000005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0416159  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2070  SNARE associated Golgi protein-related protein  31.65 
 
 		 215 aa  62  0.000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.000366664  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1164  SNARE associated Golgi protein  30.56 
 
 		 203 aa  61.6  0.000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2603  DedA family protein  30.57 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000431988  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3647  hypothetical protein  30.49 
 
 		 330 aa  61.6  0.000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2436  dedA family protein  30.57 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.243294  normal  0.259083 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2857  dedA family protein  30.57 
 
 		 201 aa  61.6  0.000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.121771  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2849  dedA family protein  30.05 
 
 		 201 aa  61.2  0.000000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00192016 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0127  hypothetical protein  31.29 
 
 		 237 aa  60.8  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5318  hypothetical protein  28.18 
 
 		 206 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.745456  normal  0.776913 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1530  hypothetical protein  28.48 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3851  phosphoesterase PA-phosphatase related  32 
 
 		 671 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.294206  normal  0.711383 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0360  hypothetical protein  28.48 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1215  hypothetical protein  24.73 
 
 		 187 aa  60.8  0.00000001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.758432  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1421  hypothetical protein  28.48 
 
 		 220 aa  60.8  0.00000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0915  hypothetical protein  28.49 
 
 		 206 aa  60.8  0.00000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00745427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4907  SNARE associated Golgi protein  29.7 
 
 		 227 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.703178 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2646  SNARE associated Golgi protein  29.53 
 
 		 218 aa  60.5  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00131391  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0480  dedA family protein  25.25 
 
 		 197 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5185  dedA protein  28.92 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4068  SNARE associated Golgi protein  26.87 
 
 		 220 aa  60.5  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.379921  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3567  putative inner membrane protein  28.57 
 
 		 220 aa  60.1  0.00000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1082  SNARE associated Golgi protein  32.93 
 
 		 205 aa  60.1  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.822354 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1699  phosphoesterase PA-phosphatase related protein  28.17 
 
 		 521 aa  60.1  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.422307  normal  0.249913 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02964  conserved inner membrane protein  28.57 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3583  inner membrane protein YqjA  27.82 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0452465  normal  0.251546 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3282  putative inner membrane protein  28.57 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.468138  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02915  hypothetical protein  28.57 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3487  inner membrane protein YqjA  27.82 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3521  hypothetical protein  27.82 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.946081  normal  0.0157563 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3393  putative inner membrane protein  28.57 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>