109 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0029 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0029  Ketohexokinase  100 
 
 		 420 aa  865    Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.892362  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1488  PfkB  38.25 
 
 		 401 aa  260  3e-68  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2848  ketohexokinase  45.52 
 
 		 290 aa  245  9e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0113  PfkB domain protein  46.42 
 
 		 290 aa  236  6e-61  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.245631  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0921  ketohexokinase  45.55 
 
 		 292 aa  219  6e-56  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0283  PfkB domain protein  43.15 
 
 		 292 aa  197  3e-49  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.686629  normal  0.98072 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_10054  conserved hypothetical protein  32.13 
 
 		 317 aa  125  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2334  PfkB domain protein  27.04 
 
 		 314 aa  76.3  0.0000000000009  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0161012  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0114  Rieske (2Fe-2S) domain protein  37.5 
 
 		 108 aa  68.2  0.0000000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.225812  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2849  Rieske (2Fe-2S) protein  32.74 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_36053  predicted protein  31.33 
 
 		 393 aa  65.9  0.000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.630596  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4302  PfkB domain protein  26.41 
 
 		 297 aa  64.3  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0980  ribokinase-like domain-containing protein  27.24 
 
 		 300 aa  63.2  0.000000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.167032 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3386  ribokinase-like domain-containing protein  28.8 
 
 		 298 aa  61.2  0.00000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.139536 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0103  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.19 
 
 		 153 aa  59.3  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3198  ferredoxin, 2Fe-2S  33.94 
 
 		 112 aa  58.9  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0027175  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3141  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  33.06 
 
 		 120 aa  58.5  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3650  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  40.79 
 
 		 130 aa  57.8  0.0000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.27405 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0692  carbohydrate kinase  26.05 
 
 		 304 aa  57.4  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.19709  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1935  hypothetical protein  33.66 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.455363  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5489  ferredoxin subunits of nitrite reductase and ring-hydroxylating dioxygenase  32.48 
 
 		 119 aa  56.2  0.0000009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.121832  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3370  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  27.03 
 
 		 104 aa  55.8  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0252226 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2812  PfkB  26.3 
 
 		 321 aa  55.5  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4829  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.45 
 
 		 119 aa  55.1  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.642068 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2495  Rieske (2Fe-2S) domain protein  36.45 
 
 		 151 aa  55.1  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.746892 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1238  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.06 
 
 		 109 aa  54.3  0.000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.724379  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2129  putative sugar kinase  26.23 
 
 		 298 aa  53.9  0.000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.101939  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3654  PfkB  25 
 
 		 300 aa  53.5  0.000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.349862 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2838  putative sugar kinase  24.3 
 
 		 299 aa  53.5  0.000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5912  hypothetical protein  32.08 
 
 		 155 aa  53.1  0.000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1805  PfkB  23.59 
 
 		 318 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.512756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0676  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  41.67 
 
 		 123 aa  52.8  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0130  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.65 
 
 		 149 aa  52.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1648  PfkB  23.76 
 
 		 297 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.46421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1340  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  36.89 
 
 		 116 aa  52  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000041033 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1755  PfkB domain protein  26.62 
 
 		 304 aa  52  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1856  PfkB family kinase  23.05 
 
 		 315 aa  51.2  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0158072  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01838  rieske  33.72 
 
 		 113 aa  51.2  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.318103  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0022  PfkB domain protein  21.18 
 
 		 291 aa  51.2  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1870  PfkB domain protein  24.1 
 
 		 315 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0114143  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2216  ribokinase, putative  23.91 
 
 		 312 aa  50.8  0.00004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.442783  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3574  Rieske (2Fe-2S) region  35.58 
 
 		 117 aa  51.2  0.00004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.556915  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1996  PfkB family kinase  24.1 
 
 		 315 aa  50.8  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1498  PfkB domain protein  27.3 
 
 		 300 aa  50.8  0.00004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0972  iron-sulfur cluster-binding protein, Rieske family  32.95 
 
 		 110 aa  50.8  0.00005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00000277135  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0036  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.71 
 
 		 111 aa  50.8  0.00005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1099  Fructokinase  26.2 
 
 		 303 aa  50.4  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01741  predicted kinase  23.74 
 
 		 315 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4013  ribokinase-like domain-containing protein  32.46 
 
 		 315 aa  50.4  0.00006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1419  PfkB family kinase  23.4 
 
 		 315 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.997387  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01729  hypothetical protein  23.74 
 
 		 315 aa  50.4  0.00006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1094  ribokinase-like domain-containing protein  26.09 
 
 		 296 aa  50.1  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.495819  normal  0.168418 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2704  PfkB domain protein  26 
 
 		 317 aa  50.1  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2496  kinase, pfkB family  22.55 
 
 		 310 aa  50.1  0.00008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1860  ribokinase-like domain-containing protein  23.74 
 
 		 315 aa  49.7  0.00009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  decreased coverage  0.00000390561 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0858  Rieske (2Fe-2S) region  32.63 
 
 		 120 aa  49.3  0.0001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1174  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  35.53 
 
 		 142 aa  49.7  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0020  PfkB domain protein  20.85 
 
 		 291 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2057  PfkB family kinase  24.91 
 
 		 315 aa  48.9  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.124987  normal  0.010035 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1736  PfkB domain protein  25.29 
 
 		 304 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2008  Rieske (2Fe-2S) region  31.52 
 
 		 119 aa  48.1  0.0003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0992  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.03 
 
 		 105 aa  48.1  0.0003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0130458  hitchhiker  0.00000000116756 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0908  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.91 
 
 		 130 aa  48.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.313285  normal  0.0276254 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4801  Rieske (2Fe-2S) region  30.43 
 
 		 105 aa  47.8  0.0004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0146102  hitchhiker  0.00629459 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2167  hypothetical protein  36.14 
 
 		 149 aa  47.8  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3193  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.61 
 
 		 111 aa  47.8  0.0004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.242192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2817  PfkB domain protein  25.68 
 
 		 295 aa  47  0.0006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.575722  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2872  PfkB  27.68 
 
 		 332 aa  46.6  0.0008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.626247 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3555  PfkB domain protein  26.72 
 
 		 284 aa  46.6  0.0009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4690  Rieske (2Fe-2S) domain protein  29.67 
 
 		 114 aa  46.6  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000178918 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1043  hypothetical protein  33.77 
 
 		 138 aa  46.2  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0922873  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4226  Rieske (2Fe-2S) protein  35.9 
 
 		 133 aa  46.6  0.001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.40748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62360  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  31.62 
 
 		 115 aa  45.8  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0816  benzene/toluene monooxygenase ferredoxin subunit  34.21 
 
 		 111 aa  45.8  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2541  benzene/toluene monooxygenase ferredoxin subunit  35.14 
 
 		 111 aa  46.2  0.001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.558987 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0350  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  32.43 
 
 		 217 aa  46.2  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0559  Rieske (2Fe-2S) domain protein  31 
 
 		 156 aa  45.8  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0973  Rieske (2Fe-2S) domain protein  32.91 
 
 		 130 aa  46.6  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0515815 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3084  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.48 
 
 		 138 aa  45.8  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.325284  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1710  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  32.35 
 
 		 131 aa  45.1  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0741905  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0671  PfkB  25.28 
 
 		 309 aa  45.8  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.506953 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0460  PfkB  26.03 
 
 		 308 aa  45.1  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.413409  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4554  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  28.57 
 
 		 105 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000741211 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5427  Rieske family iron-sulfur cluster-binding protein  33.33 
 
 		 107 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3592  PfkB domain protein  26.03 
 
 		 311 aa  45.1  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0720957  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3692  carbohydrate kinase, PfkB/ribokinase  25.1 
 
 		 292 aa  44.7  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.429219  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3042  PfkB  26.46 
 
 		 308 aa  45.1  0.003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0270  Fructokinase  26.77 
 
 		 328 aa  44.7  0.003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1649  ribokinase-like domain-containing protein  24 
 
 		 308 aa  44.3  0.004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0416676  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3427  ribokinase-like domain-containing protein  25.1 
 
 		 292 aa  44.3  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.820196 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2306  PfkB family kinase  25.27 
 
 		 319 aa  44.3  0.004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4688  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  29.67 
 
 		 105 aa  44.7  0.004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0626972  hitchhiker  0.0000000488951 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2407  ribokinase-like domain-containing protein  25.27 
 
 		 319 aa  44.7  0.004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2483  PfkB domain protein  24.14 
 
 		 302 aa  44.3  0.004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2385  PfkB domain-containing protein  22.79 
 
 		 297 aa  43.9  0.005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.790997  normal  0.420761 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3656  Rieske (2Fe-2S) region  31.13 
 
 		 105 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.747877  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4711  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.13 
 
 		 105 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.938131  normal  0.140067 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5589  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.13 
 
 		 105 aa  43.5  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00587987 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2190  Rieske (2Fe-2S) domain-containing protein  31.96 
 
 		 132 aa  43.5  0.007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0622882 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2919  Rieske (2Fe-2S) domain protein  34.62 
 
 		 134 aa  43.5  0.007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00744341  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>