22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0018 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0018  putative Tfp pilus assembly protein  100 
 
 		 210 aa  424  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0022  PilX protein  32.09 
 
 		 195 aa  69.3  0.00000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0026  PilX protein  31.55 
 
 		 195 aa  67.4  0.0000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2273  type IV pilus assembly protein PilX  46.55 
 
 		 182 aa  64.3  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2559  Tfp pilus assembly protein PilX-like  28.57 
 
 		 213 aa  55.5  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0751732  normal  0.24266 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2824  putative transmembrane protein  27.23 
 
 		 221 aa  55.5  0.0000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.766928  normal  0.597534 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3226  Tfp pilus assembly protein PilX  40.16 
 
 		 164 aa  52.4  0.000005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5193  type 4 fimbrial biogenesis protein PilX  40.32 
 
 		 195 aa  52.4  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.516522  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2662  putative transmembrane protein  39.73 
 
 		 208 aa  50.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.116202  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3826  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  42.86 
 
 		 263 aa  50.8  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.240858  normal  0.179379 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0503  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  39.29 
 
 		 257 aa  48.9  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0492  Tfp pilus assembly protein PilX-like protein  42.22 
 
 		 208 aa  47.8  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0716  Tfp pilus assembly protein PilX  32.09 
 
 		 188 aa  47  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.644759 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0869  PilX protein  38.78 
 
 		 177 aa  47  0.0002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.255829  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60300  type 4 fimbrial biogenesis protein PilX  35.71 
 
 		 199 aa  46.6  0.0003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000472809 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0725  hypothetical protein  39.29 
 
 		 220 aa  45.8  0.0004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0673  hypothetical protein  29.01 
 
 		 189 aa  45.1  0.0009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.515222 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0211  Tfp pilus assembly protein PilX  53.57 
 
 		 165 aa  42.7  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.807484  normal  0.0360944 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2519  hypothetical protein  28.87 
 
 		 202 aa  42.7  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0718  type IV pilus assembly protein PilX  45.16 
 
 		 164 aa  42.4  0.005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0736  hypothetical protein  37.29 
 
 		 163 aa  42.4  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.539036  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0666  hypothetical protein  33.96 
 
 		 170 aa  41.6  0.01  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>