More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0007 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  100 
 
 		 257 aa  535  1e-151  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.645227  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0007  exodeoxyribonuclease III  55.34 
 
 		 255 aa  291  7e-78  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.454244  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5932  exodeoxyribonuclease III (xth)  53.94 
 
 		 258 aa  289  3e-77  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.342329  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0007  exodeoxyribonuclease III Xth  53.97 
 
 		 255 aa  289  3e-77  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.669681 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2145  exodeoxyribonuclease III Xth  53.94 
 
 		 258 aa  289  3e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.447148  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2163  exodeoxyribonuclease III Xth  53.94 
 
 		 258 aa  288  6e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.924471  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3070  exodeoxyribonuclease III  53.36 
 
 		 256 aa  286  2e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5454  exodeoxyribonuclease III  52.76 
 
 		 258 aa  284  9e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2055  exodeoxyribonuclease III Xth  52.36 
 
 		 271 aa  282  3.0000000000000004e-75  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2182  exodeoxyribonuclease III Xth  51.97 
 
 		 271 aa  281  1e-74  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1126  exodeoxyribonuclease III Xth  52.36 
 
 		 272 aa  279  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00222533  normal  0.38819 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0172  exodeoxyribonuclease III  51.36 
 
 		 255 aa  278  7e-74  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000298085 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1847  exodeoxyribonuclease III  51.55 
 
 		 258 aa  276  2e-73  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2467  exodeoxyribonuclease III  50.98 
 
 		 257 aa  276  2e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.184552 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2782  exodeoxyribonuclease III  53.15 
 
 		 258 aa  276  3e-73  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.554158  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2765  exodeoxyribonuclease III  51.16 
 
 		 322 aa  275  5e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2687  exodeoxyribonuclease III  51.16 
 
 		 258 aa  275  6e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1738  exodeoxyribonuclease III  51.16 
 
 		 258 aa  275  6e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1520  exodeoxyribonuclease III  51.16 
 
 		 258 aa  275  6e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.746689  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2247  exodeoxyribonuclease III  51.16 
 
 		 258 aa  275  6e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3071  exodeoxyribonuclease III  51.16 
 
 		 258 aa  275  6e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2631  exodeoxyribonuclease III  51.16 
 
 		 258 aa  275  6e-73  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.223347  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1246  exodeoxyribonuclease III Xth  51.36 
 
 		 254 aa  271  5.000000000000001e-72  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0137674 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1189  exodeoxyribonuclease III  50 
 
 		 265 aa  271  8.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.642421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3970  exodeoxyribonuclease III  52.38 
 
 		 258 aa  270  1e-71  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1114  exodeoxyribonuclease III Xth  51.34 
 
 		 258 aa  268  4e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1194  exodeoxyribonuclease III Xth  51.34 
 
 		 258 aa  268  5e-71  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.118144  normal  0.796496 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2418  exodeoxyribonuclease III  51.36 
 
 		 277 aa  266  2.9999999999999995e-70  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1297  exodeoxyribonuclease III  48.85 
 
 		 275 aa  265  5.999999999999999e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.295102  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1624  exodeoxyribonuclease III Xth  48.87 
 
 		 269 aa  265  5.999999999999999e-70  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1447  exodeoxyribonuclease III  50.57 
 
 		 258 aa  265  7e-70  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.529853  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1460  exodeoxyribonuclease III Xth  52.53 
 
 		 254 aa  265  8e-70  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.178949  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2435  exodeoxyribonuclease III  50.2 
 
 		 255 aa  264  1e-69  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.147349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1037  exodeoxyribonuclease III  50.39 
 
 		 264 aa  264  1e-69  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3648  exodeoxyribonuclease III  49.21 
 
 		 254 aa  263  2e-69  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1952  exodeoxyribonuclease III Xth  48.5 
 
 		 269 aa  263  2e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.520652  normal  0.0243221 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1478  exodeoxyribonuclease III Xth  49.21 
 
 		 258 aa  263  3e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.391852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0913  exodeoxyribonuclease III Xth  50 
 
 		 264 aa  262  4e-69  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1593  exodeoxyribonuclease III protein  49.25 
 
 		 269 aa  261  4.999999999999999e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.224473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2776  exodeoxyribonuclease III Xth  49.62 
 
 		 260 aa  262  4.999999999999999e-69  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0418103 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0685  hypothetical protein  48.83 
 
 		 256 aa  259  3e-68  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2283  exodeoxyribonuclease III Xth  50.2 
 
 		 267 aa  256  2e-67  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.703686  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1526  exodeoxyribonuclease III  48.45 
 
 		 258 aa  256  2e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.541899  normal  0.12165 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4997  exodeoxyribonuclease III  48.66 
 
 		 258 aa  256  4e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.541642  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2071  exodeoxyribonuclease III  49.81 
 
 		 256 aa  255  5e-67  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.663777 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2611  exodeoxyribonuclease III Xth  48.45 
 
 		 258 aa  254  9e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.458401 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0703  hypothetical protein  47.66 
 
 		 256 aa  253  2.0000000000000002e-66  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1637  exodeoxyribonuclease III Xth  47.69 
 
 		 261 aa  249  3e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0209  exodeoxyribonuclease III xth  46.67 
 
 		 237 aa  249  3e-65  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2983  exodeoxyribonuclease III  48.64 
 
 		 274 aa  249  3e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.385795  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03249  exodeoxyribonuclease III  48.26 
 
 		 259 aa  249  3e-65  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2484  exodeoxyribonuclease III (xth)  50.99 
 
 		 254 aa  246  4e-64  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.616331  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0357  exodeoxyribonuclease III Xth  48.83 
 
 		 257 aa  241  7e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.462834  normal  0.596536 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0178  exodeoxyribonuclease III  48.83 
 
 		 257 aa  241  7e-63  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1252  exodeoxyribonuclease III Xth  44.57 
 
 		 282 aa  239  4e-62  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0010877  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1820  exodeoxyribonuclease III  46.92 
 
 		 267 aa  239  4e-62  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.458905  hitchhiker  0.00350077 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4446  exodeoxyribonuclease III Xth  48.66 
 
 		 258 aa  236  2e-61  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.499589 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0701  exodeoxyribonuclease III Xth  45.59 
 
 		 288 aa  234  7e-61  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.60209 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3564  exodeoxyribonuclease III  43.24 
 
 		 261 aa  231  1e-59  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2607  exodeoxyribonuclease III  43.07 
 
 		 265 aa  229  2e-59  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0881671 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2559  exodeoxyribonuclease III  41.54 
 
 		 260 aa  226  2e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4594  exodeoxyribonuclease III Xth  44.57 
 
 		 268 aa  226  2e-58  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5112  exodeoxyribonuclease III  43.8 
 
 		 260 aa  224  8e-58  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.130446  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0988  exodeoxyribonuclease III  41 
 
 		 262 aa  218  7e-56  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1017  exodeoxyribonuclease III  41 
 
 		 262 aa  218  7e-56  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.869599 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05111  exodeoxyribonuclease III  37.55 
 
 		 281 aa  203  2e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05401  exodeoxyribonuclease III  37.74 
 
 		 281 aa  203  2e-51  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.889276  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0864  exodeoxyribonuclease III  37.79 
 
 		 279 aa  204  2e-51  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0873  exodeoxyribonuclease III  37.4 
 
 		 260 aa  202  4e-51  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06981  exodeoxyribonuclease III  40.46 
 
 		 279 aa  202  5e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1699  exodeoxyribonuclease III xth  42.26 
 
 		 282 aa  202  6e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0398069  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0485  exodeoxyribonuclease III  38.49 
 
 		 281 aa  201  8e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.229415  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1686  exodeoxyribonuclease III  39.85 
 
 		 262 aa  200  1.9999999999999998e-50  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2355  exodeoxyribonuclease III Xth  37.02 
 
 		 260 aa  196  3e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.936665  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05411  exodeoxyribonuclease III  37.79 
 
 		 275 aa  194  9e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.186769 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1721  exodeoxyribonuclease III Xth  39.37 
 
 		 265 aa  194  1e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.678022  decreased coverage  0.000653482 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05481  exodeoxyribonuclease III  35.21 
 
 		 281 aa  193  3e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1479  exodeoxyribonuclease III Xth  37.84 
 
 		 263 aa  192  4e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.688806 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1755  exodeoxyribonuclease III (xth)  37.69 
 
 		 266 aa  192  4e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1817  exodeoxyribonuclease III  37.26 
 
 		 275 aa  191  7e-48  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.170882  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2496  exodeoxyribonuclease III  38.26 
 
 		 267 aa  191  8e-48  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  hitchhiker  0.0083215  normal  0.338343 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04851  exodeoxyribonuclease III  38.17 
 
 		 277 aa  190  2e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.416527  normal  0.309597 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5283  exodeoxyribonuclease III Xth  41.09 
 
 		 269 aa  190  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.974803  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1677  exodeoxyribonuclease III Xth  37.26 
 
 		 263 aa  190  2.9999999999999997e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2804  exodeoxyribonuclease III  37.5 
 
 		 263 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.96481  normal  0.323562 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1402  exodeoxyribonuclease III  38.55 
 
 		 258 aa  188  5.999999999999999e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  0.632012 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2758  exodeoxyribonuclease III  38.85 
 
 		 276 aa  188  9e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.139698  normal  0.30939 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1736  exodeoxyribonuclease III Xth  37.8 
 
 		 265 aa  188  9e-47  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.956019  normal  0.890937 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3202  exodeoxyribonuclease III Xth  37.69 
 
 		 263 aa  187  1e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.840556  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4438  exodeoxyribonuclease III  36.96 
 
 		 263 aa  186  2e-46  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0661  exodeoxyribonuclease III  40 
 
 		 288 aa  187  2e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.984285  normal  0.57398 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1784  exodeoxyribonuclease III  38.26 
 
 		 266 aa  187  2e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.144543  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1810  exodeoxyribonuclease III xth  36.54 
 
 		 266 aa  185  8e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.962919 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3423  exodeoxyribonuclease III  38.91 
 
 		 255 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4240  exodeoxyribonuclease III Xth  38.93 
 
 		 262 aa  184  1.0000000000000001e-45  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.381888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3810  exodeoxyribonuclease III Xth  37.79 
 
 		 293 aa  184  1.0000000000000001e-45  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0156  exodeoxyribonuclease III  37.21 
 
 		 259 aa  184  2.0000000000000003e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15770  Exodeoxyribonuclease III  39.15 
 
 		 259 aa  183  2.0000000000000003e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.587593  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1154  exodeoxyribonuclease III Xth  35.88 
 
 		 263 aa  183  3e-45  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.311062  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2180  exodeoxyribonuclease III (xth)  37.6 
 
 		 256 aa  182  3e-45  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>