240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hneap_0005 on replicon NC_013422
Organism: Halothiobacillus neapolitanus c2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013422  Hneap_0005  LemA family protein  100 
 
 		 191 aa  391  1e-108  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.141685  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3325  LemA family protein  67.63 
 
 		 190 aa  246  2e-64  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0420769  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56810  putative lemA-like protein  61.05 
 
 		 190 aa  238  5e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0089  hypothetical protein  58.38 
 
 		 188 aa  226  1e-58  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2798  LemA family protein  55.79 
 
 		 190 aa  224  6e-58  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1608  LemA family protein  58.38 
 
 		 191 aa  209  2e-53  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0508234  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0548  hypothetical protein  49.18 
 
 		 189 aa  171  5e-42  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  6.49212e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2315  hypothetical protein  46.58 
 
 		 185 aa  140  8e-33  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1566  LemA family protein  44.44 
 
 		 183 aa  140  9.999999999999999e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1628  hypothetical protein  40.46 
 
 		 184 aa  138  3.9999999999999997e-32  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.301554  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4985  LemA family protein  45.96 
 
 		 183 aa  138  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2611  hypothetical protein  44.64 
 
 		 186 aa  137  1e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.286576 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4313  hypothetical protein  44.72 
 
 		 183 aa  137  1e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.90869 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3233  hypothetical protein  44.72 
 
 		 186 aa  135  3.0000000000000003e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.791063  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4208  hypothetical protein  44.1 
 
 		 183 aa  135  4e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.735662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2025  LemA family protein  40.74 
 
 		 195 aa  135  4e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1334  LemA family protein  41.67 
 
 		 188 aa  134  9.999999999999999e-31  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.000000195542  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0720  LemA family protein  42.31 
 
 		 183 aa  133  1.9999999999999998e-30  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.198372  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4376  hypothetical protein  42.94 
 
 		 184 aa  132  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.208442  normal  0.0458426 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2637  LemA family protein  41.21 
 
 		 184 aa  132  3.9999999999999996e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.980645  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1528  LemA family protein  43.56 
 
 		 196 aa  131  5e-30  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00267014  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2258  LemA family protein  37.78 
 
 		 181 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0639  hypothetical protein  41.25 
 
 		 182 aa  127  1.0000000000000001e-28  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0756  cytoplasmic membrane protein  41.76 
 
 		 186 aa  127  1.0000000000000001e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3741  LemA family protein  40.62 
 
 		 180 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2703  LemA family protein  40.85 
 
 		 180 aa  126  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.155911  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1586  hypothetical protein  39.26 
 
 		 188 aa  125  3e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.000121977  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2479  LemA family protein  43.6 
 
 		 201 aa  125  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.146939  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3638  LemA family protein  40 
 
 		 197 aa  125  3e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0753155 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0577  hypothetical protein  40.38 
 
 		 184 aa  125  4.0000000000000003e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0316568  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0906  LemA family protein  45.58 
 
 		 183 aa  125  4.0000000000000003e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1470  LemA  41.72 
 
 		 188 aa  124  7e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000134272  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0378  LemA family protein  41.45 
 
 		 185 aa  124  8.000000000000001e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  unclonable  0.000000000407408  decreased coverage  1.42653e-16 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0532  LemA family protein  40.99 
 
 		 183 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.258841 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0575  LemA family protein  40.49 
 
 		 183 aa  123  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.736042 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2974  LemA family protein  42.67 
 
 		 189 aa  123  2e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4440  hypothetical protein  40.11 
 
 		 197 aa  122  4e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1740  LemA family protein  43.02 
 
 		 201 aa  122  4e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0090  LemA family protein  45.95 
 
 		 184 aa  121  6e-27  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0244  LemA family protein  41.07 
 
 		 199 aa  120  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0464  LemA family protein  42.48 
 
 		 182 aa  119  1.9999999999999998e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.415614 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1494  LemA family protein  38.75 
 
 		 180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.389059  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3528  LemA-like protein  43.9 
 
 		 187 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.555314 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0398  hypothetical protein  38.75 
 
 		 180 aa  119  1.9999999999999998e-26  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.43647  normal  0.0383484 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000294  LemA protein  38.46 
 
 		 196 aa  119  3e-26  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0155737  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1210  LemA family protein  42.11 
 
 		 187 aa  118  6e-26  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1382  LemA family protein  38.12 
 
 		 180 aa  117  7.999999999999999e-26  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.617607  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1468  LemA family protein  40.24 
 
 		 195 aa  117  7.999999999999999e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.510116  normal  0.223754 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2124  LemA family protein  37.3 
 
 		 185 aa  117  7.999999999999999e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4520  LemA family protein  38.1 
 
 		 188 aa  116  1.9999999999999998e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.15394  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0276  LemA family protein  37.5 
 
 		 187 aa  116  1.9999999999999998e-25  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1229  LemA family protein  36.42 
 
 		 187 aa  115  3.9999999999999997e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0569306  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12740  hypothetical protein  44.97 
 
 		 186 aa  114  7.999999999999999e-25  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.250221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0076  hypothetical protein  39.38 
 
 		 185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.071632  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3704  LemA protein  36.07 
 
 		 192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.0429675 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5170  LemA family protein  40.72 
 
 		 195 aa  113  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.212302 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3304  hypothetical protein  46.2 
 
 		 193 aa  112  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.30627  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0241  LemA family protein  35.67 
 
 		 189 aa  112  3e-24  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1832  hypothetical protein  35.83 
 
 		 198 aa  111  5e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1607  LemA family protein  38.29 
 
 		 196 aa  111  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3645  LemA family protein  41.18 
 
 		 249 aa  110  1.0000000000000001e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3150  divalent cation transporter  37.91 
 
 		 196 aa  110  1.0000000000000001e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0283  LemA family protein  39.33 
 
 		 192 aa  109  3e-23  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.646513  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3383  LemA family protein  46.71 
 
 		 193 aa  108  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.796761  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3447  LemA family protein  46.05 
 
 		 193 aa  108  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1437  hypothetical protein  37.8 
 
 		 198 aa  107  8.000000000000001e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.323013  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0165  LemA family protein  35.58 
 
 		 182 aa  107  1e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.743151 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0874  LemA family protein  37.65 
 
 		 185 aa  105  3e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0938199  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1073  LemA family protein  37.5 
 
 		 194 aa  105  4e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.330043  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0893  hypothetical protein  33.94 
 
 		 190 aa  105  5e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0984123  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1068  hypothetical protein  43.42 
 
 		 192 aa  104  6e-22  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0360  hypothetical protein  36.46 
 
 		 196 aa  104  7e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.193957 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0955  LemA family protein  33.88 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0513  LemA family protein  37.33 
 
 		 184 aa  103  2e-21  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5847  LemA family protein  32.77 
 
 		 193 aa  102  3e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.871032 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_21021  hypothetical protein  35.29 
 
 		 188 aa  101  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.617296 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0033  LemA family protein  36.42 
 
 		 189 aa  101  8e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2260  LemA family protein  38.1 
 
 		 180 aa  99.8  2e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000506129 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1831  LemA family protein  38.62 
 
 		 187 aa  99  4e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00691191  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1788  LemA family protein  38.62 
 
 		 208 aa  99  4e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000175947  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1739  LemA family protein  35.93 
 
 		 187 aa  99  4e-20  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.572678  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0344  hypothetical protein  37.24 
 
 		 186 aa  98.6  5e-20  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.571878  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2159  LemA family protein  32.45 
 
 		 197 aa  98.2  6e-20  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2687  LemA family protein  37.67 
 
 		 189 aa  97.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.487448 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1289  hypothetical protein  33.73 
 
 		 208 aa  97.4  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0311306  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_35290  hypothetical protein  32.75 
 
 		 195 aa  97.4  1e-19  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.448083 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0552  LemA family protein  33.15 
 
 		 194 aa  97.1  1e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000000777562  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0012  LemA family protein  32.78 
 
 		 212 aa  96.7  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.417656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1256  LemA family protein  36.88 
 
 		 194 aa  96.3  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0145592  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2286  LemA family protein  36.09 
 
 		 185 aa  95.5  4e-19  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1403  LemA family protein  34.16 
 
 		 196 aa  95.5  4e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1185  hypothetical protein  33.99 
 
 		 185 aa  95.5  4e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0911033  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0070  LemA family protein  38.36 
 
 		 181 aa  95.5  4e-19  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0634  LemA protein  35.29 
 
 		 187 aa  94.7  7e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3602  LemA family protein  32.56 
 
 		 217 aa  94  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0415  hypothetical protein  34.3 
 
 		 197 aa  92.8  2e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.852272  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2032  LemA family protein  36.88 
 
 		 194 aa  93.2  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1824  LemA family protein  32.95 
 
 		 198 aa  92.8  3e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0438485  normal  0.915056 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1774  LemA family protein  37.24 
 
 		 201 aa  92.4  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.119013  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1371  hypothetical protein  34.46 
 
 		 194 aa  92.4  4e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000000117075  hitchhiker  0.000133503 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>