More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3405 on replicon NC_013201
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013201  Hmuk_3405  UspA domain protein  100 
 
 		 150 aa  292  1e-78  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3733  UspA domain protein  79.73 
 
 		 151 aa  238  2e-62  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.217159  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1573  UspA domain protein  63.95 
 
 		 149 aa  190  5e-48  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3164  UspA domain protein  47.62 
 
 		 156 aa  120  8e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1496  UspA domain protein  48.32 
 
 		 144 aa  111  3e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.828394 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3773  UspA domain protein  42.47 
 
 		 152 aa  108  2.0000000000000002e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0973  UspA domain protein  43.92 
 
 		 155 aa  104  4e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1603  UspA domain protein  40.28 
 
 		 208 aa  100  5e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1706  UspA domain protein  43.15 
 
 		 290 aa  100  6e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.873691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3096  UspA domain protein  38.19 
 
 		 207 aa  100  9e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.286  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1309  UspA domain protein  42.18 
 
 		 153 aa  99.8  1e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.678787 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0754  UspA domain protein  42.14 
 
 		 152 aa  99.4  2e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0606368  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2577  UspA domain protein  44.06 
 
 		 148 aa  95.5  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.987812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0252  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 		 148 aa  95.5  2e-19  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1224  UspA domain protein  41.22 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1467  UspA domain protein  39.58 
 
 		 180 aa  95.1  3e-19  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4249  UspA domain protein  42.76 
 
 		 133 aa  94.7  4e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1858  UspA domain protein  41.38 
 
 		 147 aa  92  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0965  UspA domain protein  40.28 
 
 		 152 aa  92  2e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3427  UspA domain protein  42.07 
 
 		 156 aa  92.4  2e-18  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2350  hypothetical protein  36.11 
 
 		 150 aa  90.9  5e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000004892  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3401  UspA domain protein  40.97 
 
 		 288 aa  90.5  8e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3817  UspA domain protein  42.76 
 
 		 415 aa  90.5  8e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.232363  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0780  UspA domain protein  34.27 
 
 		 142 aa  89  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0608906  normal  0.0365188 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0487  universal stress protein  33.56 
 
 		 150 aa  89  2e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1890  UspA domain protein  39.04 
 
 		 297 aa  89  2e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.108778  normal  0.382663 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1388  UspA domain protein  38.19 
 
 		 145 aa  89.4  2e-17  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.120958  normal  0.124251 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3418  UspA domain protein  41.38 
 
 		 133 aa  87  7e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_3017  UspA domain protein  40.85 
 
 		 281 aa  87  8e-17  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0308  UspA domain-containing protein  34.03 
 
 		 145 aa  87  8e-17  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2668  UspA domain protein  40.56 
 
 		 159 aa  87  9e-17  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3681  UspA domain protein  37.93 
 
 		 301 aa  86.7  9e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.429907  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1307  UspA domain protein  41.67 
 
 		 153 aa  86.7  1e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.476613  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1082  UspA domain protein  38.89 
 
 		 158 aa  85.5  2e-16  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.731229  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1606  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 145 aa  85.5  2e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.198066  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2355  UspA domain protein  36.81 
 
 		 159 aa  85.1  3e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1196  UspA domain-containing protein  35.17 
 
 		 142 aa  84  6e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.196709  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0833  UspA domain protein  37.06 
 
 		 169 aa  83.6  9e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.139589  normal  0.670884 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0432  UspA domain protein  36.81 
 
 		 144 aa  83.6  9e-16  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3529  universal stress protein  37.16 
 
 		 149 aa  83.2  0.000000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0176065  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1457  UspA domain-containing protein  33.1 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0224  UspA domain protein  37.5 
 
 		 151 aa  83.2  0.000000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.483112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1308  UspA domain protein  39.58 
 
 		 145 aa  82.4  0.000000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.437188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3831  UspA domain protein  36.91 
 
 		 300 aa  82  0.000000000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0656239  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1022  UspA domain-containing protein  32.41 
 
 		 145 aa  81.3  0.000000000000004  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.335236  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3527  universal stress protein  34.23 
 
 		 151 aa  80.5  0.000000000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2826  UspA domain protein  36.3 
 
 		 286 aa  80.5  0.000000000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.232825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4350  UspA domain protein  38.89 
 
 		 294 aa  80.5  0.000000000000008  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.252521  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2014  UspA domain protein  39.46 
 
 		 307 aa  79  0.00000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.494901 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0570  UspA domain protein  43.26 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.932953  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3089  UspA domain protein  37.76 
 
 		 280 aa  79  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1851  UspA domain-containing protein  34.46 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2933  UspA domain-containing protein  32.19 
 
 		 147 aa  79  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000000835821  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2851  universal stress protein  29.25 
 
 		 157 aa  78.2  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.113376  hitchhiker  0.00572798 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1862  UspA domain protein  43.24 
 
 		 141 aa  78.6  0.00000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0496809 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1658  UspA domain protein  34.67 
 
 		 287 aa  77.8  0.00000000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4244  UspA domain protein  38.46 
 
 		 283 aa  78.2  0.00000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.284447  n/a   
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5263  UspA domain protein  37.5 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.179366  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1589  UspA domain-containing protein  35.42 
 
 		 140 aa  76.3  0.0000000000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  decreased coverage  0.000251397  normal  0.0131871 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3403  UspA domain protein  40.85 
 
 		 301 aa  76.6  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0873  UspA domain protein  35.46 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00734386  normal  0.0430196 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3565  universal stress protein  32.19 
 
 		 156 aa  75.5  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0986618 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3055  UspA domain protein  35.42 
 
 		 142 aa  75.1  0.0000000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0825  universal stress protein  31.51 
 
 		 164 aa  75.1  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1382  UspA domain-containing protein  34.27 
 
 		 142 aa  74.3  0.0000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.378027 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0704  hypothetical protein  35.66 
 
 		 148 aa  74.3  0.0000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1182  UspA domain protein  31.94 
 
 		 148 aa  73.9  0.0000000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.146743 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2164  UspA domain protein  42.76 
 
 		 154 aa  73.9  0.0000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3813  UspA domain protein  37.06 
 
 		 283 aa  73.9  0.0000000000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1171  UspA domain protein  33.8 
 
 		 153 aa  73.2  0.000000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00282044 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0826  universal stress protein  30.43 
 
 		 165 aa  73.2  0.000000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1661  UspA domain protein  32.64 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0602  UspA domain-containing protein  34.97 
 
 		 147 aa  73.2  0.000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.491088  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2678  hypothetical protein  32.43 
 
 		 149 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.348095 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3602  UspA domain protein  30.61 
 
 		 151 aa  72.4  0.000000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3712  universal stress protein  31.71 
 
 		 307 aa  72  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2886  UspA domain-containing protein  33.33 
 
 		 148 aa  71.6  0.000000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0844522  normal  0.787665 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3734  UspA domain protein  37.59 
 
 		 138 aa  71.2  0.000000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.210471  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0574  UspA domain protein  33.12 
 
 		 303 aa  71.6  0.000000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0118  UspA domain-containing protein  36.05 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.385941 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3170  UspA domain protein  36.36 
 
 		 167 aa  70.9  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0228  UspA domain protein  35.86 
 
 		 144 aa  70.9  0.000000000006  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.115538 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2181  UspA domain protein  42.67 
 
 		 150 aa  70.9  0.000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.313206  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3147  universal stress protein  32.65 
 
 		 150 aa  70.1  0.00000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00251172  normal  0.0145111 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0848  hypothetical protein  29.66 
 
 		 142 aa  69.7  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.957853  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1861  UspA domain protein  34.25 
 
 		 145 aa  70.1  0.00000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0942342  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2552  UspA domain protein  31.94 
 
 		 147 aa  69.7  0.00000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.4459099999999997e-20 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4348  UspA domain protein  34.03 
 
 		 149 aa  68.9  0.00000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0947911  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0436  UspA domain-containing protein  31.33 
 
 		 151 aa  69.3  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0405998  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3176  UspA domain protein  38.51 
 
 		 291 aa  67.8  0.00000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1234  universal stress protein  30.71 
 
 		 152 aa  67.8  0.00000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1146  UspA domain protein  31.65 
 
 		 156 aa  67.8  0.00000000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1383  UspA domain protein  38.62 
 
 		 142 aa  66.2  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2717  UspA domain-containing protein  29.63 
 
 		 308 aa  66.6  0.0000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2084  UspA domain protein  33.57 
 
 		 140 aa  66.2  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3798  UspA domain protein  32.14 
 
 		 281 aa  65.9  0.0000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1165  UspA domain protein  32.14 
 
 		 152 aa  65.5  0.0000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000867886  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1659  UspA domain protein  37.41 
 
 		 147 aa  65.9  0.0000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.452952  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2256  UspA domain-containing protein  31.68 
 
 		 308 aa  65.9  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4254  UspA domain protein  40.26 
 
 		 149 aa  66.2  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>