More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3313 on replicon NC_013201
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013201  Hmuk_3313  periplasmic solute binding protein  100 
 
 		 362 aa  739    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2570  periplasmic solute binding protein  65.54 
 
 		 360 aa  465  9.999999999999999e-131  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.796894  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1191  periplasmic solute binding protein  51.85 
 
 		 350 aa  326  3e-88  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  unclonable  0.0000000411642  hitchhiker  0.00000625153 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1011  periplasmic solute binding protein  33.63 
 
 		 357 aa  189  5e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.932798  normal  0.91735 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0963  periplasmic solute binding protein  31.21 
 
 		 320 aa  152  5.9999999999999996e-36  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  hitchhiker  0.000541493  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1633  periplasmic solute binding protein  29.12 
 
 		 353 aa  134  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1215  periplasmic solute binding protein  29.34 
 
 		 309 aa  124  2e-27  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0851  periplasmic solute binding protein  30.32 
 
 		 337 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2645  periplasmic solute binding protein  28.01 
 
 		 317 aa  120  3.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2005  periplasmic solute binding protein  32.11 
 
 		 463 aa  107  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.218401  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0895  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  28.57 
 
 		 514 aa  107  3e-22  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00479451  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0580  periplasmic solute binding protein  25.09 
 
 		 328 aa  106  7e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2791  periplasmic solute binding protein  26.04 
 
 		 314 aa  106  8e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000435611  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2025  putative adhesion lipoprotein  24.53 
 
 		 316 aa  103  4e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3284  putative adhesion lipoprotein  24.21 
 
 		 316 aa  103  7e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2103  adhesion lipoprotein  23.9 
 
 		 316 aa  102  9e-21  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0547  periplasmic solute binding protein  25.8 
 
 		 318 aa  102  9e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.624279  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2139  periplasmic solute binding protein  33.67 
 
 		 333 aa  101  2e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000485962  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1526  periplasmic solute binding protein  23.97 
 
 		 316 aa  100  3e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2136  putative adhesion lipoprotein  23.58 
 
 		 316 aa  100  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4184  periplasmic solute binding protein  26.34 
 
 		 307 aa  100  5e-20  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0757118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1885  periplasmic solute binding protein  23.58 
 
 		 316 aa  99.8  6e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0182568  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1889  adhesion lipoprotein  23.58 
 
 		 316 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.994637  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1841  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  23.58 
 
 		 316 aa  99.4  1e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.18542  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2035  adhesion lipoprotein  23.58 
 
 		 316 aa  99  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1851  high-affinity zinc uptake system periplasmic-binding protein  22.96 
 
 		 316 aa  97.4  3e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.623587  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0278  periplasmic solute binding protein  25.75 
 
 		 293 aa  96.7  6e-19  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.664498  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04310  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  26.4 
 
 		 349 aa  96.7  6e-19  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0184  laminin-binding surface protein  26.96 
 
 		 317 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.570136  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0278  laminin-binding surface protein  26.96 
 
 		 317 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3480  periplasmic solute binding protein  29.44 
 
 		 462 aa  93.2  7e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.653162  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2065  periplasmic solute binding protein  26.53 
 
 		 304 aa  92.4  1e-17  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2125  ABC transporter, substrate-binding protein  25.35 
 
 		 298 aa  92.4  1e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.570615  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2413  ABC transporter, substrate-binding protein  25.26 
 
 		 298 aa  91.3  2e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.423087  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0042  periplasmic solute binding protein  25.19 
 
 		 332 aa  89.7  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000671872  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0598  periplasmic solute binding protein  22.26 
 
 		 333 aa  88.6  1e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3534  periplasmic solute binding protein  24.45 
 
 		 304 aa  87.4  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2986  adhesion lipoprotein  28.51 
 
 		 326 aa  87  5e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2435  periplasmic solute binding protein  24.91 
 
 		 301 aa  85.5  0.000000000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000000148152  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1833  periplasmic solute binding protein  25.4 
 
 		 321 aa  85.9  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.475081  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3600  periplasmic solute binding protein  24.45 
 
 		 304 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2183  periplasmic solute binding protein  28.04 
 
 		 311 aa  84.7  0.000000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.143573 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0491  periplasmic solute binding protein  27.27 
 
 		 318 aa  84  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4951  periplasmic solute binding protein  25.78 
 
 		 317 aa  83.6  0.000000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1937  periplasmic solute binding protein  30.04 
 
 		 311 aa  83.2  0.000000000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.456944  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1058  periplasmic solute binding protein  25 
 
 		 333 aa  83.2  0.000000000000007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.985578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2066  putative adhesion lipoprotein  24.02 
 
 		 265 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0993  zinc ABC transporter, zinc-binding protein  26.64 
 
 		 323 aa  81.3  0.00000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.27598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1128  periplasmic solute binding protein  26.42 
 
 		 296 aa  80.9  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.29041 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1578  periplasmic solute binding protein  23.48 
 
 		 314 aa  79.7  0.00000000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0601  ABC transporter substrate-binding protein  23.75 
 
 		 302 aa  79  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.498334  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1655  periplasmic solute binding protein  23.95 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0535  zinc ABC transporter, zinc-binding adhesion liprotein  27.34 
 
 		 506 aa  78.6  0.0000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0968782  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2051  periplasmic solute binding protein  28.63 
 
 		 303 aa  77.8  0.0000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0478383  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0188  periplasmic solute binding protein  24.71 
 
 		 334 aa  77  0.0000000000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.494723  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0816  periplasmic solute binding protein  27.27 
 
 		 300 aa  76.3  0.0000000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.313747  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1602  periplasmic solute binding protein  27.67 
 
 		 324 aa  76.3  0.0000000000008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.174683  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3262  periplasmic solute binding protein  29.32 
 
 		 341 aa  76.3  0.0000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000710757  normal  0.410992 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7253  periplasmic solute binding protein  30.08 
 
 		 346 aa  75.9  0.000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0518447  normal  0.0520295 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0516  periplasmic solute binding protein  22.48 
 
 		 365 aa  75.1  0.000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06661  ABC transporter substrate-binding protein  26.53 
 
 		 300 aa  75.1  0.000000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.391111  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0046  periplasmic solute binding protein  26.36 
 
 		 316 aa  74.3  0.000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1938  adhesion lipoprotein  27.94 
 
 		 307 aa  73.9  0.000000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1010  ABC transporter substrate-binding protein  28.03 
 
 		 310 aa  74.3  0.000000000003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.172647  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1999  periplasmic solute binding protein  28.64 
 
 		 292 aa  74.3  0.000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.870733  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06571  ABC transporter substrate-binding protein  27.92 
 
 		 299 aa  73.9  0.000000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.351556  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18691  ABC transporter substrate-binding protein  29.5 
 
 		 287 aa  73.6  0.000000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.349553 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2088  periplasmic solute binding protein  27.73 
 
 		 323 aa  73.2  0.000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.245809  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2141  periplasmic solute binding protein  27.23 
 
 		 315 aa  72  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2047  periplasmic solute binding protein  30.7 
 
 		 311 aa  72.4  0.00000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.862803 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06271  ABC transporter substrate-binding protein  24.55 
 
 		 302 aa  72  0.00000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4439  periplasmic solute binding protein  23.78 
 
 		 339 aa  71.2  0.00000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.914781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1488  ABC transporter substrate-binding protein  28.95 
 
 		 337 aa  72  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.520647  normal  0.191838 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1111  periplasmic solute binding protein  25.91 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13680  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  26.46 
 
 		 320 aa  70.9  0.00000000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.785587 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1659  metal ABC transporter substrate-binding lipoprotein  27.69 
 
 		 296 aa  71.2  0.00000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00160044 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0333  periplasmic solute binding protein  23.29 
 
 		 302 aa  70.5  0.00000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000273282  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1612  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  26.42 
 
 		 294 aa  70.1  0.00000000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0432091  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0131  periplasmic solute binding protein  25.18 
 
 		 285 aa  70.1  0.00000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3170  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  26.42 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.857236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2043  periplasmic solute binding protein  25.56 
 
 		 353 aa  69.7  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000010108  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4439  periplasmic solute binding protein  27.23 
 
 		 304 aa  69.7  0.00000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.977167  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2419  zinc ABC transporter substrate-binding protein  25.93 
 
 		 280 aa  69.7  0.00000000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0902077  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3168  periplasmic solute binding protein  25.67 
 
 		 313 aa  69.7  0.00000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2964  adhesion lipoprotein  20.69 
 
 		 311 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00274739  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3189  adhesion lipoprotein  20.69 
 
 		 311 aa  69.3  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2067  manganese ABC transporter substrate-binding lipoprotein  20.34 
 
 		 311 aa  68.9  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1915  periplasmic solute binding protein  26.92 
 
 		 365 aa  68.2  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.163703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1533  periplasmic solute binding protein  27.16 
 
 		 308 aa  68.2  0.0000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.411014  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4568  periplasmic solute-binding protein  24.08 
 
 		 322 aa  68.6  0.0000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.328746  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1775  periplasmic solute binding protein  25.38 
 
 		 312 aa  68.6  0.0000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.176875  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3280  periplasmic solute binding protein  24.23 
 
 		 326 aa  68.6  0.0000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.956978  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1142  periplasmic solute binding protein  29.87 
 
 		 307 aa  67.8  0.0000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.987303  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_13190  ABC-type metal ion transport system, periplasmic component/surface adhesin  25.99 
 
 		 320 aa  68.2  0.0000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0992578  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7033  periplasmic solute binding protein  27.82 
 
 		 315 aa  67.4  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10491  ABC transporter substrate-binding protein  24.37 
 
 		 320 aa  67.8  0.0000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.232212  normal  1 
 
 
-
 
NC_010488  EcSMS35_A0084  iron/manganese transport system periplasmic binding protein SitA  26.02 
 
 		 304 aa  67.8  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.224306  hitchhiker  0.0000000789185 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4557  periplasmic solute binding protein  33.33 
 
 		 304 aa  67.4  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.667309  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0833  periplasmic solute binding protein  27.31 
 
 		 345 aa  67.4  0.0000000004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2064  periplasmic solute binding protein  28.57 
 
 		 325 aa  66.6  0.0000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>