65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3295 on replicon NC_013201
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013201  Hmuk_3295  restriction endonuclease  100 
 
 		 346 aa  686    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.978849  normal  0.622246 
 
 
-
 
NC_013748  Htur_5043  restriction endonuclease  36.61 
 
 		 349 aa  69.3  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12548  restriction system protein mrr  33.11 
 
 		 306 aa  62.8  0.000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00923915 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3443  endonuclease  33.64 
 
 		 171 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.861488  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4342  type II restriction endonuclease family protein  30.25 
 
 		 182 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000331313  hitchhiker  0.000000000249094 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4774  restriction endonuclease  38.82 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2785  restriction endonuclease  40.28 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1094  restriction endonuclease  41.43 
 
 		 310 aa  57.8  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.907503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5241  restriction endonuclease  38.82 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.944294 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3186  Mrr restriction system protein  40.28 
 
 		 305 aa  57.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1093  type II restriction endonuclease family protein  29.41 
 
 		 182 aa  57  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4809  restriction endonuclease  38.46 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3899  restriction endonuclease  31.71 
 
 		 313 aa  56.2  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.146985  normal  0.0281314 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2162  Mrr restriction protein-related  30.56 
 
 		 125 aa  55.8  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.660936  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1631  restriction endonuclease  34.19 
 
 		 345 aa  55.8  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.796365  normal  0.0242548 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0154  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 305 aa  55.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0091  restriction endonuclease  33.33 
 
 		 305 aa  55.8  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0464771  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2342  Mrr restriction protein-related  30.56 
 
 		 154 aa  55.5  0.000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2859  restriction endonuclease  28.57 
 
 		 374 aa  55.1  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2317  Mrr restriction protein-related  30.56 
 
 		 154 aa  55.1  0.000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.233057  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2101  Mrr restriction protein-related  30.56 
 
 		 154 aa  55.1  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.579298  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1797  DNA topoisomerase I:restriction endonuclease  30.28 
 
 		 355 aa  52  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4155  restriction endonuclease  37.65 
 
 		 247 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00289  putative transmembrane protein  26.62 
 
 		 252 aa  51.6  0.00002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4531  restriction endonuclease  32.23 
 
 		 289 aa  50.4  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0968  Mrr restriction system protein  36.11 
 
 		 305 aa  50.4  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.299295 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0042  endonuclease  31.25 
 
 		 326 aa  50.1  0.00006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.000000000176557  hitchhiker  0.000586339 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6871  restriction endonuclease  31.25 
 
 		 200 aa  49.7  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0116  restriction endonuclease  28.57 
 
 		 262 aa  49.7  0.00008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04060  DNA topoisomerase I and restriction endonuclease domain-containing protein  29.96 
 
 		 285 aa  49.7  0.00008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0753  Mrr restriction system protein  32.76 
 
 		 296 aa  49.3  0.00009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.113295  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1379  restriction endonuclease  30.65 
 
 		 310 aa  48.5  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.732895 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2767  restriction endonuclease  32.74 
 
 		 520 aa  48.9  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0680  restriction endonuclease  31.45 
 
 		 304 aa  49.3  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5316  restriction endonuclease  37.65 
 
 		 260 aa  48.5  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.493703  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1446  restriction endonuclease  31.2 
 
 		 328 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0714463  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22830  restriction endonuclease  29.51 
 
 		 306 aa  48.5  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.275041 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_05300  restriction endonuclease  31.03 
 
 		 305 aa  47.8  0.0003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.979407  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4576  restriction endonuclease  29.91 
 
 		 169 aa  47.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000197116  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0477  restriction endonuclease  31.71 
 
 		 303 aa  47.8  0.0003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.863286  normal  0.802026 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2498  restriction endonuclease  34.45 
 
 		 493 aa  47.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.480892  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3544  restriction endonuclease  31.2 
 
 		 305 aa  47.4  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1061  restriction endonuclease  30.16 
 
 		 310 aa  47.4  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3356  restriction endonuclease  30.08 
 
 		 287 aa  47.4  0.0004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.521085  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3646  restriction endonuclease  28.86 
 
 		 304 aa  46.6  0.0006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2534  restriction endonuclease  31.4 
 
 		 302 aa  46.6  0.0006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.983155  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0993  restriction endonuclease-like protein  32.14 
 
 		 421 aa  46.6  0.0007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04183  hypothetical protein  28.86 
 
 		 304 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04217  methylated adenine and cytosine restriction protein  28.86 
 
 		 304 aa  46.6  0.0007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4420  restriction endonuclease  33.61 
 
 		 249 aa  46.6  0.0007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.432554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2286  restriction endonuclease  35.79 
 
 		 359 aa  45.4  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.227945 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3127  restriction endonuclease  35.71 
 
 		 454 aa  45.8  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1090  restriction endonuclease  30.16 
 
 		 310 aa  45.8  0.001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.978634  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1753  restriction endonuclease  29.71 
 
 		 215 aa  44.7  0.002  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1078  restriction endonuclease  29.51 
 
 		 333 aa  44.7  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.272779  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1365  Mrr restriction system protein, putative  24.8 
 
 		 348 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.451451  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5377  restriction endonuclease  30.84 
 
 		 230 aa  44.7  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1692  mrr restriction system protein  31.4 
 
 		 303 aa  44.3  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.337411 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1996  Mrr restriction system protein-like  29.17 
 
 		 447 aa  44.7  0.003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00366255  normal  0.311144 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3416  hypothetical protein  30 
 
 		 281 aa  43.9  0.004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1324  restriction endonuclease  29.46 
 
 		 493 aa  43.9  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0899903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_7364  putative Mrr restriction system protein  30.91 
 
 		 400 aa  43.9  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  hitchhiker  0.00238713  n/a   
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3352  restriction endonuclease  30.85 
 
 		 201 aa  43.5  0.005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0200  restriction endonuclease  31.07 
 
 		 403 aa  43.1  0.007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0304  endonuclease  30.3 
 
 		 320 aa  42.7  0.009  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>