30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3276 on replicon NC_013201
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013201  Hmuk_3276  SirA family protein  100 
 
 
94 aa  188  2e-47  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0498195 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  36.36 
 
 
75 aa  47  0.00009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  33.82 
 
 
189 aa  46.6  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0565  SirA family protein  34.33 
 
 
189 aa  45.8  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000944688  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1718  SirA family protein  39.66 
 
 
81 aa  46.2  0.0002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0756  SirA family protein  36.36 
 
 
75 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0477358 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  30.16 
 
 
75 aa  45.4  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0826  SirA family protein  36.36 
 
 
75 aa  45.1  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.24854 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  40 
 
 
75 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0811  SirA-like protein  42.59 
 
 
75 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.0842772 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  29.03 
 
 
75 aa  44.3  0.0005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1011  SirA-like  35.14 
 
 
75 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1827  sulfur transfer protein SirA  32.1 
 
 
84 aa  43.1  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0248688  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0567  SirA family protein  31.15 
 
 
75 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.23848  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0574  hypothetical protein  33.33 
 
 
75 aa  43.5  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000789219  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2819  SirA-like protein  33.33 
 
 
83 aa  42.7  0.002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1436  SirA family protein  37.93 
 
 
81 aa  41.6  0.003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.324916  normal  0.46012 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  32.31 
 
 
76 aa  41.6  0.003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2932  SirA family protein  27.42 
 
 
77 aa  41.6  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1989  SirA family protein  37.74 
 
 
75 aa  41.6  0.004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000867317 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  31.75 
 
 
75 aa  41.6  0.004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  31.75 
 
 
75 aa  41.2  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0093  SirA-like protein  31.15 
 
 
82 aa  41.2  0.005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1524  SirA family protein  31.15 
 
 
189 aa  40.4  0.007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3436  SirA family protein  24.29 
 
 
81 aa  40.4  0.008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000543679  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0830  rhodanese domain protein  24.29 
 
 
186 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233764  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0937  rhodanese domain protein  24.29 
 
 
186 aa  40.4  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000726035  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0776  rhodanese domain-containing protein  22.86 
 
 
186 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0738  rhodanese domain-containing protein  22.86 
 
 
186 aa  40.4  0.008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0001064  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  30.77 
 
 
76 aa  40.4  0.009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>