222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3091 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_3091  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
410 aa  850    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.275239  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0926  FAD dependent oxidoreductase  68.61 
 
 
411 aa  596  1e-169  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.609885  hitchhiker  0.00113671 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3081  FAD dependent oxidoreductase  68.7 
 
 
413 aa  597  1e-169  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2507  FAD dependent oxidoreductase  66.75 
 
 
414 aa  585  1e-166  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2206  FAD dependent oxidoreductase  65.68 
 
 
410 aa  549  1e-155  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.685598 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1007  FAD dependent oxidoreductase  60.15 
 
 
409 aa  530  1e-149  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1955  hypothetical protein  35.63 
 
 
405 aa  209  9e-53  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0431  hypothetical protein  30.81 
 
 
422 aa  120  3e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.446535  normal  0.169558 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  28.62 
 
 
398 aa  99.8  8e-20  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  28.37 
 
 
390 aa  99  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  28.41 
 
 
452 aa  98.6  2e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  26.45 
 
 
399 aa  97.1  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  26.61 
 
 
396 aa  95.9  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  28.38 
 
 
453 aa  95.9  1e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  27.34 
 
 
390 aa  95.1  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  26.33 
 
 
402 aa  94.7  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  25.21 
 
 
395 aa  94.7  3e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  27.95 
 
 
390 aa  93.6  6e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  25.94 
 
 
398 aa  93.2  8e-18  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  26.56 
 
 
391 aa  93.2  8e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  24.65 
 
 
398 aa  91.7  2e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  24.8 
 
 
384 aa  90.5  5e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  22.45 
 
 
406 aa  90.1  6e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  22.66 
 
 
408 aa  89.7  9e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  25.06 
 
 
390 aa  89.4  1e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0938  geranylgeranyl reductase  27.82 
 
 
453 aa  88.2  2e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.129052 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  27.43 
 
 
397 aa  88.6  2e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15361  NAD binding site  27.22 
 
 
405 aa  87.4  5e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.298365 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4688  monooxygenase FAD-binding  28.29 
 
 
417 aa  85.1  0.000000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  24.16 
 
 
393 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  23.6 
 
 
402 aa  83.6  0.000000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0830  geranylgeranyl reductase  28.62 
 
 
415 aa  83.2  0.000000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  22.81 
 
 
386 aa  82.8  0.000000000000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  25.07 
 
 
398 aa  82  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  24.23 
 
 
407 aa  80.9  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  25.63 
 
 
387 aa  80.1  0.00000000000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  23.88 
 
 
393 aa  79.7  0.00000000000008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  22.07 
 
 
396 aa  79  0.0000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  28.29 
 
 
425 aa  78.6  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1429  hypothetical protein  25.07 
 
 
395 aa  78.6  0.0000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0716636 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  23.1 
 
 
392 aa  78.2  0.0000000000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  27.71 
 
 
430 aa  77.4  0.0000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  28.29 
 
 
430 aa  76.6  0.0000000000007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  25.5 
 
 
423 aa  74.7  0.000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1826  geranylgeranyl reductase  25 
 
 
393 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1873  geranylgeranyl reductase  25 
 
 
393 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700646  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0811  geranylgeranyl reductase  29.31 
 
 
453 aa  74.7  0.000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0472  geranylgeranyl reductase  21.78 
 
 
385 aa  72.8  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.730289  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1696  geranylgeranyl reductase  27.78 
 
 
459 aa  72.4  0.00000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1807  geranylgeranyl reductase  24.72 
 
 
393 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622254  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1349  geranylgeranyl reductase  20.98 
 
 
392 aa  72.8  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08531  dehydrogenases (flavoproteins)  25.56 
 
 
398 aa  71.6  0.00000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.741714  hitchhiker  0.00186449 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  27.71 
 
 
431 aa  71.2  0.00000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  25.92 
 
 
424 aa  71.2  0.00000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  27.42 
 
 
418 aa  71.2  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05461  NAD binding site  23.47 
 
 
377 aa  71.2  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  27.76 
 
 
445 aa  70.9  0.00000000004  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  21.22 
 
 
399 aa  70.5  0.00000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  24.87 
 
 
431 aa  70.5  0.00000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  23.58 
 
 
386 aa  69.7  0.00000000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  25.62 
 
 
375 aa  68.9  0.0000000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0668  geranylgeranyl reductase  25.9 
 
 
458 aa  69.7  0.0000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.159483  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  25.82 
 
 
435 aa  68.6  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  23.3 
 
 
382 aa  68.6  0.0000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  26.89 
 
 
434 aa  68.2  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  21.82 
 
 
391 aa  67.8  0.0000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  25.3 
 
 
378 aa  66.6  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  22.64 
 
 
391 aa  66.6  0.0000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3883  monooxygenase FAD-binding  25.44 
 
 
409 aa  66.2  0.0000000009  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.964641  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  27.27 
 
 
457 aa  66.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  26.37 
 
 
506 aa  65.1  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0023  geranylgeranyl reductase  23.6 
 
 
398 aa  65.5  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  23.26 
 
 
379 aa  64.3  0.000000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  23.51 
 
 
387 aa  63.5  0.000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  24.93 
 
 
425 aa  63.5  0.000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0681  geranylgeranyl reductase  22.43 
 
 
453 aa  63.5  0.000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00166018  hitchhiker  0.00000684168 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  27.67 
 
 
434 aa  62.8  0.00000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1090  bacteriochlorophyll synthase 43 kDa subunit  23.68 
 
 
385 aa  62  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1496  geranylgeranyl reductase  25.07 
 
 
361 aa  62  0.00000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.963353  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  28.06 
 
 
419 aa  61.6  0.00000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  26.86 
 
 
379 aa  61.6  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  25.08 
 
 
379 aa  61.2  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  22.63 
 
 
376 aa  61.2  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_677  hypothetical protein  22.99 
 
 
379 aa  60.8  0.00000004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.545095  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05761  NAD binding site  20.78 
 
 
377 aa  60.8  0.00000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  23.84 
 
 
406 aa  60.1  0.00000007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0166  geranylgeranyl reductase  25.54 
 
 
453 aa  59.7  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6095  geranylgeranyl reductase  27.44 
 
 
440 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0614228 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1377  geranylgeranyl reductase  27.87 
 
 
467 aa  58.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  24.46 
 
 
379 aa  58.9  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3232  FAD dependent oxidoreductase  28.19 
 
 
430 aa  58.5  0.0000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  23.71 
 
 
455 aa  57.4  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  26.51 
 
 
443 aa  57.4  0.0000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2679  FAD dependent oxidoreductase  24.8 
 
 
430 aa  57.4  0.0000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.678719 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0520  NAD binding site  22.93 
 
 
377 aa  56.2  0.0000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3481  geranylgeranyl reductase  24.82 
 
 
374 aa  56.6  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  23.58 
 
 
421 aa  55.8  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  26.57 
 
 
411 aa  55.8  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  23.23 
 
 
365 aa  55.8  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  23.08 
 
 
406 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0200135 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>