268 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3007 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_3007  Dihydrofolate reductase  100 
 
 		 172 aa  344  4e-94  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.035164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1681  Dihydrofolate reductase  56.73 
 
 		 181 aa  176  2e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2988  Dihydrofolate reductase  54.44 
 
 		 183 aa  176  2e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.302882  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2167  dihydrofolate reductase region  54.91 
 
 		 194 aa  156  2e-37  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1051  Dihydrofolate reductase  43.9 
 
 		 163 aa  141  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1115  Dihydrofolate reductase  45.45 
 
 		 164 aa  139  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1195  dihydrofolate reductase  45.78 
 
 		 164 aa  138  3e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.193216  normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1963  dihydrofolate reductase  41.46 
 
 		 183 aa  137  4.999999999999999e-32  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0857  dihydrofolate reductase  45.51 
 
 		 160 aa  137  1e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.535024  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2039  dihydrofolate reductase  45.78 
 
 		 167 aa  135  2e-31  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.570547  normal  0.482414 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0959  dihydrofolate reductase  43.11 
 
 		 160 aa  135  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0341  Dihydrofolate reductase  46.95 
 
 		 177 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0874  dihydrofolate reductase  42.51 
 
 		 160 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0789491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3214  dihydrofolate reductase  46.85 
 
 		 160 aa  132  1.9999999999999998e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.871101  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3646  dihydrofolate reductase  42.51 
 
 		 160 aa  132  3e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2947  dihydrofolate reductase  45.68 
 
 		 161 aa  132  3e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.631471  normal  0.0218136 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0984  dihydrofolate reductase  47.59 
 
 		 160 aa  132  3e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.69665  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0571  dihydrofolate reductase  44.79 
 
 		 160 aa  131  5e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2090  dihydrofolate reductase  42.14 
 
 		 161 aa  131  5e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.475399  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0189  dihydrofolate reductase  40.85 
 
 		 161 aa  131  5e-30  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0900  dihydrofolate reductase  47.55 
 
 		 160 aa  131  5e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.131279  normal  0.732147 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0096  dihydrofolate reductase  42.14 
 
 		 161 aa  131  5e-30  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.987213  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1640  dihydrofolate reductase  41.55 
 
 		 162 aa  130  6e-30  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00601598  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2431  dihydrofolate reductase  40.72 
 
 		 171 aa  131  6e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3318  Dihydrofolate reductase  43.11 
 
 		 160 aa  130  9e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3120  dihydrofolate reductase  46.15 
 
 		 160 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2842  dihydrofolate reductase  43.98 
 
 		 167 aa  129  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.551792  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1009  dihydrofolate reductase  43.11 
 
 		 160 aa  129  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.415728  hitchhiker  0.0000243395 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2542  Dihydrofolate reductase  42.2 
 
 		 172 aa  129  2.0000000000000002e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.929799 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6098  dihydrofolate reductase  43.35 
 
 		 170 aa  128  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2952  dihydrofolate reductase  43.98 
 
 		 167 aa  129  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.700087  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0972  dihydrofolate reductase  42.51 
 
 		 160 aa  128  3e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.415398  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1045  dihydrofolate reductase  40.54 
 
 		 163 aa  128  3e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.46602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0925  dihydrofolate reductase  42.66 
 
 		 169 aa  128  3e-29  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1074  dihydrofolate reductase  41.92 
 
 		 160 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0303057  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1041  dihydrofolate reductase  41.92 
 
 		 160 aa  128  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0691593  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4811  Dihydrofolate reductase  39.53 
 
 		 183 aa  127  5.0000000000000004e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.431649  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48110  Dihydrofolate reductase  45.22 
 
 		 171 aa  127  7.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  hitchhiker  0.000576537  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2571  dihydrofolate reductase  43.09 
 
 		 195 aa  127  7.000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.115778  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1310  dihydrofolate reductase region  38.46 
 
 		 161 aa  127  7.000000000000001e-29  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000886123  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2569  dihydrofolate reductase  44.83 
 
 		 166 aa  127  8.000000000000001e-29  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.858438  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0423  dihydrofolate reductase  47.52 
 
 		 166 aa  127  8.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200309 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0244  dihydrofolate reductase  43.37 
 
 		 167 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0387  dihydrofolate reductase  43.37 
 
 		 167 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2902  dihydrofolate reductase  43.37 
 
 		 167 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.95504  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2530  dihydrofolate reductase  43.37 
 
 		 167 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0903  dihydrofolate reductase  43.37 
 
 		 167 aa  127  9.000000000000001e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0888  Dihydrofolate reductase  45.52 
 
 		 167 aa  126  1.0000000000000001e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.733276  normal  0.450678 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2729  dihydrofolate reductase  45.64 
 
 		 172 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0802679  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1674  dihydrofolate reductase  46.21 
 
 		 219 aa  126  1.0000000000000001e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.69831  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2985  dihydrofolate reductase  43.29 
 
 		 164 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2824  dihydrofolate reductase  46.43 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.545858 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0946  dihydrofolate reductase oxidoreductase protein  46.21 
 
 		 167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0266319 
 
 
-
 
NC_004310  BR1398  dihydrofolate reductase  45.33 
 
 		 172 aa  126  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0351  dihydrofolate reductase  41.14 
 
 		 171 aa  126  2.0000000000000002e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.146405  normal  0.312334 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1822  dihydrofolate reductase  41.36 
 
 		 164 aa  126  2.0000000000000002e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.11244  hitchhiker  0.00306792 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2729  dihydrofolate reductase  45.71 
 
 		 178 aa  125  2.0000000000000002e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1750  dihydrofolate reductase  43.2 
 
 		 167 aa  125  2.0000000000000002e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.175283  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2037  dihydrofolate reductase  40.11 
 
 		 179 aa  125  3e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.750289  normal  0.473794 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2052  dihydrofolate reductase  47.9 
 
 		 165 aa  125  3e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837329  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1468  dihydrofolate reductase  35.15 
 
 		 160 aa  125  4.0000000000000003e-28  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1020  dihydrofolate reductase  40 
 
 		 166 aa  125  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.831665  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1591  Dihydrofolate reductase  45.24 
 
 		 164 aa  125  4.0000000000000003e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00889611  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0782  dihydrofolate reductase  41.46 
 
 		 166 aa  124  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.039834 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0817  Dihydrofolate reductase  44.83 
 
 		 167 aa  124  5e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3173  dihydrofolate reductase  41.72 
 
 		 162 aa  124  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.481323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1448  dihydrofolate reductase  43.45 
 
 		 165 aa  124  6e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.349105  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3353  dihydrofolate reductase  40.88 
 
 		 179 aa  124  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.0397175 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1793  dihydrofolate reductase  42.67 
 
 		 174 aa  124  8.000000000000001e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.928797  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0914  dihydrofolate reductase  45.52 
 
 		 166 aa  124  9e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2350  dihydrofolate reductase region  44.83 
 
 		 178 aa  124  9e-28  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1663  Dihydrofolate reductase  39.77 
 
 		 177 aa  124  9e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2964  Dihydrofolate reductase  38.79 
 
 		 166 aa  124  9e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.159706  normal  0.451516 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4971  dihydrofolate reductase  43.2 
 
 		 166 aa  122  2e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2748  Dihydrofolate reductase  43.92 
 
 		 162 aa  122  2e-27  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2221  dihydrofolate reductase  45.52 
 
 		 209 aa  122  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2048  dihydrofolate reductase  47.24 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2801  Dihydrofolate reductase  41.62 
 
 		 172 aa  122  3e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.22692  normal  0.836348 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2588  Dihydrofolate reductase  39.26 
 
 		 164 aa  121  4e-27  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0579  dihydrofolate reductase  42.07 
 
 		 163 aa  121  4e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4209  dihydrofolate reductase  42.76 
 
 		 176 aa  121  4e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1905  Dihydrofolate reductase  43.67 
 
 		 163 aa  121  4e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3084  dihydrofolate reductase  40.72 
 
 		 160 aa  121  4e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1582  Dihydrofolate reductase  38.89 
 
 		 162 aa  121  4e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000274022  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2083  dihydrofolate reductase  38.73 
 
 		 162 aa  121  5e-27  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.25981  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2021  dihydrofolate reductase  38.73 
 
 		 162 aa  121  5e-27  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.981299  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2021  dihydrofolate reductase  38.73 
 
 		 162 aa  121  5e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2349  dihydrofolate reductase  38.73 
 
 		 162 aa  121  5e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000130652  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2237  dihydrofolate reductase  38.73 
 
 		 162 aa  121  5e-27  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.044685  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6452  Dihydrofolate reductase  39.74 
 
 		 164 aa  121  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.816768  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2449  dihydrofolate reductase  42.17 
 
 		 169 aa  121  5e-27  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.110989 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2062  dihydrofolate reductase  38.73 
 
 		 162 aa  121  5e-27  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000278641  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2264  dihydrofolate reductase  38.73 
 
 		 162 aa  121  6e-27  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.24191e-31 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1421  Dihydrofolate reductase  38.61 
 
 		 161 aa  120  6e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.491047 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1354  dihydrofolate reductase  44 
 
 		 172 aa  120  7e-27  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.340933  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2220  dihydrofolate reductase  38.3 
 
 		 162 aa  120  9e-27  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.151366  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2061  dihydrofolate reductase  44.9 
 
 		 162 aa  119  9.999999999999999e-27  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0932  dihydrofolate reductase  40.99 
 
 		 163 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3263  dihydrofolate reductase  45.93 
 
 		 171 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.254952  normal  0.239963 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0221  dihydrofolate reductase  41.67 
 
 		 259 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.935978 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>