More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2995 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2995  L-tyrosine decarboxylase  100 
 
 		 349 aa  706    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2743  L-tyrosine decarboxylase  79.94 
 
 		 349 aa  553  1e-156  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0805  Pyridoxal-dependent decarboxylase  66.76 
 
 		 361 aa  464  1e-129  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2599  Pyridoxal-dependent decarboxylase  67.71 
 
 		 365 aa  456  1e-127  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0591  L-tyrosine decarboxylase  68.95 
 
 		 355 aa  429  1e-119  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0146124  normal  0.883082 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1848  L-tyrosine decarboxylase  44.41 
 
 		 365 aa  294  1e-78  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2080  L-tyrosine decarboxylase  42.98 
 
 		 363 aa  287  2e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.895699 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2166  L-tyrosine decarboxylase  44.94 
 
 		 365 aa  281  1e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.511307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1636  L-tyrosine decarboxylase  44.76 
 
 		 384 aa  276  3e-73  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1732  L-tyrosine decarboxylase  42.54 
 
 		 379 aa  275  8e-73  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1545  L-tyrosine decarboxylase  40.23 
 
 		 365 aa  254  2.0000000000000002e-66  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0671702  hitchhiker  0.0000867545 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2611  L-tyrosine decarboxylase  39.43 
 
 		 369 aa  252  5.000000000000001e-66  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0977  L-tyrosine decarboxylase  38.71 
 
 		 395 aa  249  4e-65  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1008  L-tyrosine decarboxylase  35.83 
 
 		 390 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.461391  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1547  L-tyrosine decarboxylase  37.26 
 
 		 384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.875736  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1130  L-tyrosine decarboxylase  37.26 
 
 		 384 aa  234  2.0000000000000002e-60  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0821  L-tyrosine decarboxylase  37.26 
 
 		 384 aa  231  2e-59  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.750414  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1136  L-tyrosine decarboxylase  35.67 
 
 		 384 aa  221  9.999999999999999e-57  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2007  pyridoxal-dependent decarboxylase  33.15 
 
 		 403 aa  205  1e-51  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1436  Pyridoxal-dependent decarboxylase  34.77 
 
 		 374 aa  203  3e-51  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.687898  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0806  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.49 
 
 		 411 aa  146  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.168032 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2190  pyridoxal-dependent decarboxylase  32.3 
 
 		 474 aa  125  8.000000000000001e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2562  Pyridoxal-dependent decarboxylase  32.26 
 
 		 468 aa  121  1.9999999999999998e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000400331  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3073  Pyridoxal-dependent decarboxylase  32.8 
 
 		 514 aa  120  3.9999999999999996e-26  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.441347  normal  0.218881 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1039  Pyridoxal-dependent decarboxylase  27.08 
 
 		 412 aa  113  5e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3418  pyridoxal-dependent decarboxylase  32.09 
 
 		 472 aa  111  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.3739  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1072  pyridoxal-dependent decarboxylase  32.23 
 
 		 474 aa  109  7.000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1873  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.25 
 
 		 472 aa  107  2e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.044289  normal  0.812242 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1769  glutamate decarboxylase, putative  32.36 
 
 		 533 aa  107  3e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0159  Pyridoxal-dependent decarboxylase  28.45 
 
 		 513 aa  106  6e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1867  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.79 
 
 		 498 aa  105  1e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3961  Pyridoxal-dependent decarboxylase  31.15 
 
 		 478 aa  105  1e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1569  pyridoxal-dependent decarboxylase  32.13 
 
 		 549 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2535  pyridoxal-dependent decarboxylase  32.97 
 
 		 546 aa  103  4e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1574  pyridoxal-dependent decarboxylase  32.49 
 
 		 549 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2520  pyridoxal-dependent decarboxylase  32.36 
 
 		 549 aa  103  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.212789 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2588  pyridoxal-dependent decarboxylase  32.36 
 
 		 549 aa  103  5e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2686  pyridoxal-dependent decarboxylase  32.36 
 
 		 549 aa  103  5e-21  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.555524 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2774  Pyridoxal-dependent decarboxylase  32.49 
 
 		 549 aa  103  5e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00267346 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01989  conserved hypothetical protein similar to dihydrosphingosine phosphate lyase (Eurofung)  27.12 
 
 		 572 aa  102  9e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.108973 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1603  pyridoxal-dependent decarboxylase  32.49 
 
 		 549 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00702468  normal  0.288093 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003759  glutamate decarboxylase eukaryotic type  32.25 
 
 		 548 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1624  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.58 
 
 		 552 aa  101  2e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1469  pyridoxal-dependent decarboxylase  32.13 
 
 		 549 aa  98.6  1e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.899491  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05447  hypothetical glutamic acid decarboxylase (Eurofung)  26.43 
 
 		 515 aa  98.2  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.224544  normal  0.629944 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3135  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.32 
 
 		 551 aa  98.2  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.0142161 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2032  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.2 
 
 		 547 aa  97.4  3e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0351867  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2715  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.91 
 
 		 548 aa  97.4  3e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.288765  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15730  predicted protein  27.11 
 
 		 442 aa  97.1  4e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.0024811  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1644  pyridoxal-dependent decarboxylase  32.56 
 
 		 550 aa  96.7  6e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2643  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.77 
 
 		 546 aa  96.7  6e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.160588  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1500  pyridoxal-dependent decarboxylase  25.21 
 
 		 500 aa  96.3  7e-19  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.112242  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2780  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.55 
 
 		 550 aa  95.5  1e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.300778 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2597  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.01 
 
 		 498 aa  94.7  2e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317944 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2434  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.98 
 
 		 554 aa  94.7  2e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1807  Pyridoxal-dependent decarboxylase  32.98 
 
 		 789 aa  94.7  2e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.0000170312  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0959  Pyridoxal-dependent decarboxylase  33.47 
 
 		 538 aa  94.7  2e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0389  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.79 
 
 		 499 aa  94  3e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1200  pyridoxal-dependent decarboxylase  30.77 
 
 		 560 aa  94.4  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.644401 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02632  glutamate decarboxylase  30.29 
 
 		 548 aa  93.6  5e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2744  glutamate decarboxylase  26.89 
 
 		 468 aa  93.6  5e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0749502  hitchhiker  0.000505067 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03552  Glutamate decarboxylase putative  29.5 
 
 		 544 aa  92.8  7e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0285  pyridoxal-dependent decarboxylase  35 
 
 		 529 aa  92.8  8e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1766  glutamate decarboxylase  25.99 
 
 		 460 aa  92.4  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.184514 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0931  pyridoxal-dependent decarboxylase  32.06 
 
 		 567 aa  90.9  3e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0460  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.91 
 
 		 552 aa  90.1  5e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.362513  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1707  group II decarboxylase  30.74 
 
 		 552 aa  89.4  9e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0663746  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07278  glutamate decarboxylase (Eurofung)  28.35 
 
 		 521 aa  88.6  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1007  putative decarboxylase  28.83 
 
 		 543 aa  89  1e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16491  pyridoxal-dependent decarboxylase family protein  31.8 
 
 		 470 aa  89.4  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.360036 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3771  Pyridoxal-dependent decarboxylase  34.55 
 
 		 464 aa  89.4  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0013231  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119543  Sphingosine-1-phosphate lyase  26.14 
 
 		 532 aa  87.8  2e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0719  putative glutamate decarboxylase  29.3 
 
 		 548 aa  87.8  2e-16  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0831  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.5 
 
 		 573 aa  87  4e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00169678  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22660  PLP-dependent enzyme, glutamate decarboxylase  32.38 
 
 		 483 aa  87  5e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00560  sphinganine-1-phosphate aldolase, putative  26.44 
 
 		 546 aa  86.7  6e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2059  Pyridoxal-dependent decarboxylase  31.87 
 
 		 495 aa  86.7  6e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.00190827  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2354  Pyridoxal-dependent decarboxylase  31.87 
 
 		 495 aa  86.3  6e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0161317  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2418  pyridoxal-dependent decarboxylase  32.26 
 
 		 490 aa  86.3  8e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000894226  normal  0.0292471 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0981  Pyridoxal-dependent decarboxylase  28.74 
 
 		 541 aa  85.9  9e-16  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3997  pyridoxal-dependent decarboxylase  34.28 
 
 		 516 aa  85.1  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.167245  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3584  pyridoxal-dependent decarboxylase  29.84 
 
 		 611 aa  85.9  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3373  Pyridoxal-dependent decarboxylase  34.15 
 
 		 494 aa  84.7  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0563875  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4546  pyridoxal-dependent decarboxylase conserved domain protein  29.92 
 
 		 472 aa  85.1  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0851794  normal  0.218359 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6904  glutamate decarboxylase  28.65 
 
 		 473 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3459  pyridoxal-dependent decarboxylase  34.42 
 
 		 511 aa  84.3  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5339  glutamate decarboxylase  26.61 
 
 		 468 aa  84  0.000000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2714  pyridoxal-dependent decarboxylase  31.08 
 
 		 488 aa  83.6  0.000000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000216735  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3931  pyridoxal-dependent decarboxylase  27.34 
 
 		 536 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0196  Pyridoxal-dependent decarboxylase  36.41 
 
 		 484 aa  83.2  0.000000000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.6927  normal  0.0347054 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1139  pyridoxal-dependent decarboxylase domain-containing protein  28.35 
 
 		 473 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.428342  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2756  sphingosine-1-phosphate lyase  28.35 
 
 		 473 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02100  histidine decarboxylase  25 
 
 		 386 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1803  Pyridoxal-dependent decarboxylase  34.91 
 
 		 529 aa  81.6  0.00000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.0338537  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2912  sphingosine-1-phosphate lyase  28.35 
 
 		 473 aa  81.6  0.00000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0389716  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0309  sphingosine-1-phosphate lyase  29.7 
 
 		 473 aa  82  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13469  glutamate decarboxylase gadB  30.65 
 
 		 460 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.294595  hitchhiker  0.000990947 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0311  sphingosine-1-phosphate lyase  31.95 
 
 		 473 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0935746  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1581  Pyridoxal-dependent decarboxylase  30.08 
 
 		 475 aa  80.9  0.00000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0451  Pyridoxal-dependent decarboxylase  29.63 
 
 		 425 aa  80.9  0.00000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0038225 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>