17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2933 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2933  sodium/calcium exchanger membrane region  100 
 
 		 452 aa  890    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  decreased coverage  0.00262618  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2005  sodium/calcium exchanger membrane region  62.27 
 
 		 462 aa  510  1e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2477  sodium/calcium exchanger membrane region  62.15 
 
 		 448 aa  490  1e-137  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1901  sodium/calcium exchanger membrane region  61.37 
 
 		 436 aa  457  1e-127  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0545835  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1109  sodium/calcium exchanger membrane region  37.35 
 
 		 408 aa  236  6e-61  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.40784 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0633  sodium/calcium exchanger membrane region  36.19 
 
 		 406 aa  231  2e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27910  Ca2+/Na+ antiporter  37.47 
 
 		 452 aa  227  3e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.629726  normal  0.0279319 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3015  sodium/calcium exchanger membrane region  38.13 
 
 		 443 aa  222  9.999999999999999e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.74257  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0594  sodium/calcium exchanger membrane region  37.19 
 
 		 406 aa  206  1e-51  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.00000257465  n/a   
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6755  sodium/calcium exchanger membrane region  36.66 
 
 		 412 aa  197  4.0000000000000005e-49  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.546188  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1879  sodium/calcium exchanger membrane region  34.68 
 
 		 428 aa  188  2e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.335578  normal  0.697081 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2287  sodium/calcium exchanger membrane region  35.95 
 
 		 440 aa  187  4e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0637  sodium/calcium exchanger membrane region  36.98 
 
 		 397 aa  183  6e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1150  sodium/calcium exchanger membrane region  28.93 
 
 		 333 aa  47.4  0.0005  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5184  sodium/calcium exchanger membrane region  27.34 
 
 		 336 aa  43.5  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2770  Sodium/calcium exchanger membrane region  25.14 
 
 		 336 aa  43.5  0.008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.212327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0802  Ca2+/H+ antiporter  25.14 
 
 		 333 aa  43.1  0.009  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.462867  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>