More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2898 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2898  chromosome segregation protein  100 
 
 		 891 aa  1720    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0181  chromosome segregation protein  52.34 
 
 		 902 aa  730    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1495  SMC domain protein  54.09 
 
 		 895 aa  781    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2437  SMC domain protein  50.27 
 
 		 924 aa  776    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0371  chromosome segregation protein  56.92 
 
 		 890 aa  839    Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1501  SMC-like protein  32.93 
 
 		 888 aa  415  1e-114  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2789  SMC domain protein  29.83 
 
 		 926 aa  307  6e-82  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0360  chromosome segregation protein  47.45 
 
 		 1074 aa  242  2.9999999999999997e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0961  SMC domain protein  22.81 
 
 		 891 aa  150  1.0000000000000001e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000356641  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1081  SMC domain-containing protein  26.28 
 
 		 804 aa  135  1.9999999999999998e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000660429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0762  SMC domain-containing protein  26.52 
 
 		 858 aa  135  3e-30  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.0108669  decreased coverage  0.00239369 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0068  Rad50 zinc hook domain protein  23.23 
 
 		 864 aa  134  6.999999999999999e-30  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191393  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0985  SMC domain-containing protein  25.93 
 
 		 702 aa  114  6e-24  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000497741 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0237  SMC domain-containing protein  23.04 
 
 		 993 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0769992  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0855  SMC domain protein  24.39 
 
 		 802 aa  111  6e-23  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.128097  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0948  SMC domain protein  21.78 
 
 		 789 aa  108  4e-22  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.217826  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1332  SMC domain-containing protein  22.15 
 
 		 993 aa  107  1e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0982  SMC domain-containing protein  25.11 
 
 		 906 aa  105  4e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4093  SMC domain-containing protein  30 
 
 		 1022 aa  102  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.240758  normal  0.708538 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0711  SMC domain-containing protein  24.63 
 
 		 994 aa  102  4e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00173757  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0586  SMC domain-containing protein  24.32 
 
 		 993 aa  100  8e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.594919  normal  0.0182683 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0652  SMC domain-containing protein  28.98 
 
 		 1019 aa  99.8  2e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.105285  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1709  exonuclease SbcC  35.23 
 
 		 1008 aa  95.5  4e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3877  exonuclease SbcC  29.73 
 
 		 1016 aa  95.5  4e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.371142  normal  0.0827458 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0905  SMC domain-containing protein  32.7 
 
 		 1022 aa  92.8  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.995306  hitchhiker  0.000299578 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3179  SMC domain-containing protein  30.08 
 
 		 1023 aa  92.8  3e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0019664  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3541  exonuclease SbcC  30.73 
 
 		 1003 aa  91.7  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.757761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2951  SMC domain protein  27.29 
 
 		 1031 aa  90.5  1e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00128287  unclonable  0.000000102622 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1257  SMC domain protein  27.1 
 
 		 1019 aa  87.8  9e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.861215  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0696  exonuclease SbcC  32.57 
 
 		 1007 aa  86.7  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0525  SMC domain-containing protein  28.49 
 
 		 859 aa  82.4  0.00000000000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0315541  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3009  exonuclease SbcC  25.75 
 
 		 1008 aa  81.6  0.00000000000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.291694  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6131  SMC domain protein  30.34 
 
 		 851 aa  81.6  0.00000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.983245 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1484  SMC domain-containing protein  28.27 
 
 		 1061 aa  81.3  0.00000000000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0728646  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1617  SMC domain-containing protein  24.65 
 
 		 1057 aa  80.9  0.00000000000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3111  exonuclease SbcC  30.22 
 
 		 1008 aa  80.5  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1245  SMC domain-containing protein  26.32 
 
 		 693 aa  78.2  0.0000000000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0939  SMC domain-containing protein  27.8 
 
 		 812 aa  77.8  0.0000000000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0924914  normal  0.567341 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0748  SMC domain-containing protein  21.16 
 
 		 935 aa  75.1  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.874201  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04030  Exodeoxyribonuclease I subunit C  23.62 
 
 		 1108 aa  73.2  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0894457  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1819  SMC domain-containing protein  28.87 
 
 		 702 aa  73.2  0.00000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.000524613  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0302  SMC domain-containing protein  28.31 
 
 		 702 aa  72.8  0.00000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1874  SMC domain protein  28.77 
 
 		 1021 aa  72  0.00000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1725  nuclease SbcCD, C subunit, putative  28.57 
 
 		 813 aa  71.2  0.00000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.536729  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1626  SMC domain protein  23.12 
 
 		 978 aa  69.7  0.0000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2301  SMC domain protein  26.74 
 
 		 987 aa  69.3  0.0000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1811  SMC domain-containing protein  24.52 
 
 		 794 aa  68.9  0.0000000004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.305534 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0823  SMC protein-like protein  33.57 
 
 		 910 aa  68.9  0.0000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.465313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0448  SMC protein-like protein  30.06 
 
 		 955 aa  67.8  0.0000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.507994  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1246  SMC domain-containing protein  30.06 
 
 		 1038 aa  67.8  0.0000000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1551  SMC domain-containing protein  28.79 
 
 		 824 aa  67  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.875451  normal  0.721096 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  21.66 
 
 		 1189 aa  66.6  0.000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0025  chromosome segregation protein SMC  28.95 
 
 		 1146 aa  66.6  0.000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.962242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1194  chromosome segregation protein SMC  26.27 
 
 		 1154 aa  66.2  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1922  SMC domain protein  26.29 
 
 		 987 aa  66.2  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.664102 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2384  exonuclease SbcC  30.53 
 
 		 1099 aa  65.9  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00297099  hitchhiker  0.00111486 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0772  SMC domain protein  25.19 
 
 		 961 aa  65.9  0.000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00238509  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2570  SMC domain-containing protein  27.43 
 
 		 984 aa  65.9  0.000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0859  exonuclease SbcC  26.52 
 
 		 950 aa  65.5  0.000000004  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0696  SMC domain protein  25.4 
 
 		 618 aa  65.1  0.000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  22.17 
 
 		 1191 aa  65.1  0.000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1303  SMC domain-containing protein  28.57 
 
 		 1234 aa  65.1  0.000000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0356  SMC domain-containing protein  25.76 
 
 		 700 aa  65.1  0.000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  20.55 
 
 		 1174 aa  64.7  0.000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4983  chromosome segregation protein SMC  25.25 
 
 		 1154 aa  64.3  0.000000009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.127534  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  23.53 
 
 		 1172 aa  64.3  0.00000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1495  hypothetical protein  19.96 
 
 		 10624 aa  63.2  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  26.02 
 
 		 1188 aa  63.2  0.00000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1524  hypothetical protein  19.96 
 
 		 10624 aa  63.2  0.00000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2822  SMC domain-containing protein  31.18 
 
 		 1020 aa  63.2  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1814  chromosome segregation protein SMC  24.64 
 
 		 1181 aa  63.5  0.00000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1890  DNA repair exonuclease, SbcC  30.21 
 
 		 989 aa  62.8  0.00000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.295467  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  23.35 
 
 		 1167 aa  62.4  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  26.03 
 
 		 1170 aa  62.4  0.00000003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  25.23 
 
 		 1170 aa  62.8  0.00000003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4031  SMC domain-containing protein  26.11 
 
 		 810 aa  62  0.00000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.515725  normal  0.378288 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0018  SMC domain protein  33.79 
 
 		 862 aa  62  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0623828 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  21.57 
 
 		 1189 aa  62  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3777  exonuclease SbcC  29.29 
 
 		 1103 aa  61.6  0.00000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  unclonable  0.00618704  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1066  chromosome segregation protein SMC  29.91 
 
 		 1154 aa  61.6  0.00000006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1915  SMC domain protein  26.29 
 
 		 815 aa  61.6  0.00000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00125008  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  21.02 
 
 		 1189 aa  61.2  0.00000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0084  exonuclease sbcC  20.77 
 
 		 1039 aa  61.2  0.00000008  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4373  chromosome segregation protein SMC  29.63 
 
 		 1153 aa  61.2  0.00000008  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.991905 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2199  condensin subunit Smc  27.22 
 
 		 1148 aa  61.2  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.53129 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2199  chromosome segregation protein SMC  24.14 
 
 		 1171 aa  60.8  0.0000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4374  chromosome segregation protein SMC  28.64 
 
 		 1154 aa  60.8  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.95695  normal  0.0465691 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  25.49 
 
 		 1134 aa  60.8  0.0000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0064  SMC domain protein  30.25 
 
 		 1511 aa  59.7  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0434137 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1496  SMC domain-containing protein  28.43 
 
 		 824 aa  59.7  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  decreased coverage  0.00508772  hitchhiker  0.000363104 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2049  chromosome segregation protein SMC  23.51 
 
 		 1167 aa  60.1  0.0000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  30.23 
 
 		 1177 aa  59.7  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2130  chromosome segregation protein  23.51 
 
 		 1167 aa  60.1  0.0000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.157775  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2318  condensin subunit Smc  28.64 
 
 		 1154 aa  59.7  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2144  DNA repair exonuclease, SbcC  31.18 
 
 		 1006 aa  59.3  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.214587  normal  0.18739 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5583  exonuclease SbcC, putative  30.53 
 
 		 1020 aa  59.7  0.0000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  25.63 
 
 		 1193 aa  59.7  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  24.26 
 
 		 1171 aa  59.7  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  29.95 
 
 		 1179 aa  59.3  0.0000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2026  chromosome segregation SMC protein  30.72 
 
 		 1168 aa  58.9  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.557942  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>