More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2843 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2843  type III restriction protein res subunit  100 
 
 		 444 aa  872    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.109265  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0308  type III restriction protein res subunit  71.26 
 
 		 449 aa  613  9.999999999999999e-175  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1556  type III restriction protein res subunit  70.09 
 
 		 470 aa  599  1e-170  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2015  type III restriction protein res subunit  65.39 
 
 		 488 aa  580  1e-164  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0659  type III restriction protein res subunit  58.24 
 
 		 531 aa  540  9.999999999999999e-153  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2643  DNA repair helicase RAD25  50.66 
 
 		 491 aa  444  1e-123  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0920189 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1762  type III restriction enzyme, res subunit  48.88 
 
 		 451 aa  409  1e-113  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3185  type III restriction protein res subunit  46.25 
 
 		 466 aa  395  1e-109  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3083  type III restriction protein res subunit  46.54 
 
 		 466 aa  386  1e-106  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0583  DNA repair helicase RAD25  44.21 
 
 		 443 aa  371  1e-101  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.71742  normal  0.481027 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1455  type III restriction protein res subunit  43.4 
 
 		 444 aa  367  1e-100  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.437061  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1994  type III restriction enzyme, res subunit  46.56 
 
 		 468 aa  367  1e-100  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.143159  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0951  Type III restriction enzyme, res subunit  42.79 
 
 		 517 aa  340  4e-92  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.12396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0079  type III restriction protein res subunit  41.61 
 
 		 499 aa  338  9.999999999999999e-92  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.288486 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0580  type III restriction protein res subunit  40.31 
 
 		 509 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0563  type III restriction protein res subunit  40.31 
 
 		 509 aa  336  5e-91  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1709  type III restriction protein res subunit  41.52 
 
 		 494 aa  332  7.000000000000001e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.17082  normal  0.0133576 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4175  type III restriction protein res subunit  41.29 
 
 		 479 aa  332  1e-89  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.776953  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4412  type III restriction enzyme, res subunit  41.52 
 
 		 590 aa  332  1e-89  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.307944  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4977  type III restriction protein res subunit  46.4 
 
 		 479 aa  330  2e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.313567  normal  0.389941 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1901  type III restriction enzyme, res subunit  42.15 
 
 		 451 aa  323  5e-87  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1432  type III restriction enzyme, res subunit  42.15 
 
 		 451 aa  317  3e-85  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.503563  normal  0.0109836 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0299  DNA repair helicase RAD25  41.48 
 
 		 456 aa  315  9.999999999999999e-85  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0649  type III restriction enzyme, res subunit  38.48 
 
 		 462 aa  313  4.999999999999999e-84  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.674278  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1191  type III restriction protein res subunit  42.6 
 
 		 451 aa  305  1.0000000000000001e-81  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0100  type III restriction protein res subunit  44.03 
 
 		 440 aa  300  3e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000273539  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1743  DNA repair helicase RAD25  34.09 
 
 		 531 aa  241  2e-62  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.763617 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1936  type III restriction protein res subunit  34.82 
 
 		 551 aa  238  2e-61  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0298009  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0670  type III restriction protein res subunit  34.13 
 
 		 652 aa  189  1e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1646  type III restriction enzyme, res subunit  32.7 
 
 		 654 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0299889 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2154  type III restriction enzyme, res subunit  33.33 
 
 		 650 aa  172  1e-41  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.508076  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2049  helicase domain protein  33.76 
 
 		 558 aa  171  2e-41  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2932  type III restriction protein res subunit  35.31 
 
 		 558 aa  170  5e-41  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.406282  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21590  DNA/RNA helicase, superfamily II  33.76 
 
 		 550 aa  164  3e-39  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.515357  hitchhiker  0.0079461 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31430  DNA/RNA helicase, superfamily II  33.25 
 
 		 558 aa  162  2e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0658169  normal  0.0482356 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0787  helicase domain-containing protein  33.25 
 
 		 551 aa  162  2e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6094  type III restriction protein res subunit  33.25 
 
 		 549 aa  159  1e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4794  helicase domain protein  33.92 
 
 		 554 aa  157  2e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.767422 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4400  helicase-like  34.79 
 
 		 545 aa  158  2e-37  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.116832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0605  type III restriction enzyme, res subunit  32.37 
 
 		 647 aa  158  2e-37  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0173  helicase domain-containing protein  33.76 
 
 		 545 aa  158  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0878922 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0725  helicase domain protein  32.99 
 
 		 548 aa  157  3e-37  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.013884  hitchhiker  0.0000273082 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0453  type III restriction protein res subunit  33.59 
 
 		 550 aa  157  3e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0810  helicase domain protein  33.08 
 
 		 550 aa  157  4e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8907  hypothetical protein  33.59 
 
 		 548 aa  157  4e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1697  type III restriction enzyme, res subunit  35.19 
 
 		 549 aa  157  5.0000000000000005e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.859108 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8107  helicase domain protein  31.46 
 
 		 548 aa  155  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0846  type III restriction protein res subunit  33.5 
 
 		 548 aa  155  2e-36  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0849054  normal  0.0359313 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3296  helicase domain-containing protein  32.74 
 
 		 551 aa  154  2.9999999999999998e-36  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.553593 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0905  helicase domain protein  32.91 
 
 		 548 aa  153  5.9999999999999996e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.223145 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0809  type III restriction protein res subunit  33.76 
 
 		 556 aa  152  1e-35  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4190  helicase domain protein  34.79 
 
 		 548 aa  151  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5056  type III restriction enzyme, res subunit  34.02 
 
 		 549 aa  152  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3950  helicase domain-containing protein  34.02 
 
 		 581 aa  151  2e-35  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.626862  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1210  helicase domain protein  33.25 
 
 		 555 aa  151  3e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4485  type III restriction enzyme, res subunit  33.08 
 
 		 549 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.111108  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4572  type III restriction enzyme, res subunit  33.08 
 
 		 549 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0637895 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4868  type III restriction enzyme, res subunit  33.08 
 
 		 549 aa  150  4e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.712757  normal  0.131426 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07930  DNA/RNA helicase, superfamily II  32.07 
 
 		 555 aa  149  8e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.181797  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34360  DNA/RNA helicase, superfamily II  32.32 
 
 		 548 aa  149  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0803  type III restriction protein res subunit  33.76 
 
 		 561 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.310817  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10878  DNA helicase ercc3  32.32 
 
 		 542 aa  148  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.000621155  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1918  DEAD/DEAH box helicase-like  30.73 
 
 		 602 aa  147  3e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0105236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4341  helicase domain-containing protein  32.99 
 
 		 559 aa  147  5e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3612  helicase domain protein  32.74 
 
 		 557 aa  144  2e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.175264  normal  0.0680888 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3146  type III restriction protein res subunit  31.78 
 
 		 630 aa  144  4e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0164842  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2721  helicase domain-containing protein  29.17 
 
 		 590 aa  142  8e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2739  helicase domain protein  27.66 
 
 		 564 aa  143  8e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.628328  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0960  type III restriction protein res subunit  30.5 
 
 		 485 aa  140  3e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1535  type III restriction protein res subunit  32.32 
 
 		 658 aa  137  4e-31  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5118  type III restriction protein res subunit  30.84 
 
 		 666 aa  137  5e-31  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4437  RNA polymerase, sigma 32 subunit, RpoH  31.81 
 
 		 951 aa  137  5e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.118841 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1218  type III restriction protein res subunit  30.26 
 
 		 485 aa  137  5e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00150525 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3947  helicase domain-containing protein  31.71 
 
 		 546 aa  135  9.999999999999999e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0896  type III restriction protein res subunit  30.54 
 
 		 479 aa  134  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0708  type III restriction protein res subunit  30.3 
 
 		 479 aa  131  3e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.922597 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0819  type III restriction protein res subunit  30.05 
 
 		 479 aa  130  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008696  Tpen_1875  DEAD/DEAH box helicase domain-containing protein  30.99 
 
 		 633 aa  127  4.0000000000000003e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0773  type III restriction protein res subunit  28.99 
 
 		 463 aa  125  1e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0952838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1032  type III restriction protein res subunit  29.8 
 
 		 479 aa  125  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3039  type III restriction protein res subunit  32.45 
 
 		 649 aa  124  3e-27  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1040  type III restriction enzyme, res subunit  27.81 
 
 		 385 aa  119  9.999999999999999e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.343931  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82790  DNA helicase  27.8 
 
 		 838 aa  119  9.999999999999999e-26  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.179856 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1769  type III restriction enzyme, res subunit  26.86 
 
 		 464 aa  117  3.9999999999999997e-25  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1686  type III restriction enzyme, res subunit  24.7 
 
 		 698 aa  116  1.0000000000000001e-24  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.025526  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2593  type III restriction protein res subunit  26.59 
 
 		 493 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1355  type III restriction protein res subunit  27.78 
 
 		 455 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.914304  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2199  Type III restriction enzyme, res subunit  27.03 
 
 		 492 aa  114  3e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.216053 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2052  type III restriction protein res subunit  27.83 
 
 		 489 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2026  type III restriction protein res subunit  27.83 
 
 		 489 aa  114  3e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1537  type III restriction enzyme, res subunit  25.45 
 
 		 732 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_08201  component of the holoenzyme form of RNA polymerase transcription factor (Eurofung)  28.3 
 
 		 818 aa  110  5e-23  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0920251 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34480  predicted protein  26.08 
 
 		 781 aa  110  7.000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2481  type III restriction enzyme, res subunit  28.05 
 
 		 706 aa  109  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.839221  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20574  predicted protein  27.61 
 
 		 720 aa  109  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000077682  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1942  type III restriction enzyme, res subunit  25.24 
 
 		 469 aa  105  1e-21  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.823738  normal  0.0282791 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05940  general RNA polymerase II transcription factor, putative  25.65 
 
 		 866 aa  104  3e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.687804  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0652  type III restriction enzyme, res subunit  34.29 
 
 		 630 aa  103  4e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  unclonable  0.000000732435  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1374  type III restriction protein res subunit  23.56 
 
 		 707 aa  103  8e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.304908  normal  0.550958 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0822  helicase domain-containing protein  33.55 
 
 		 886 aa  102  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>