67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2756 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2756  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
476 aa  919    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.1976  normal  0.927782 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2947  polysaccharide biosynthesis protein  45.4 
 
 
484 aa  349  6e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0922  polysaccharide biosynthesis protein  43.86 
 
 
479 aa  324  2e-87  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0537  polysaccharide biosynthesis protein  35.94 
 
 
485 aa  225  2e-57  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2137  polysaccharide biosynthesis protein  29.52 
 
 
470 aa  172  7.999999999999999e-42  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  29.45 
 
 
475 aa  159  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1608  polysaccharide biosynthesis protein  28.2 
 
 
492 aa  141  3e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1422  hypothetical protein  28.5 
 
 
490 aa  133  6e-30  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.379895  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  27.88 
 
 
504 aa  132  1.0000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2972  polysaccharide biosynthesis protein  27.71 
 
 
480 aa  131  3e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  24.09 
 
 
482 aa  95.9  1e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0011  polysaccharide biosynthesis protein  26.97 
 
 
481 aa  84.7  0.000000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.099852 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  23.21 
 
 
423 aa  81.6  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  24.32 
 
 
483 aa  79.3  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  23.13 
 
 
489 aa  72.8  0.00000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  22.59 
 
 
490 aa  72  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  28.5 
 
 
427 aa  68.6  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  28.78 
 
 
488 aa  67.8  0.0000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  20.29 
 
 
435 aa  67  0.0000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  23.95 
 
 
512 aa  66.2  0.000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1120  polysaccharide biosynthesis protein  23.39 
 
 
478 aa  66.2  0.000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77221  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1128  polysaccharide biosynthesis protein  26.37 
 
 
547 aa  65.1  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0506  polysaccharide biosynthesis protein  26.47 
 
 
583 aa  65.1  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  20.05 
 
 
499 aa  64.3  0.000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1311  polysaccharide biosynthesis protein  21.74 
 
 
477 aa  63.9  0.000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1767  polysaccharide biosynthesis protein  24.49 
 
 
447 aa  61.6  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.0935149 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1071  polysaccharide biosynthesis protein  25.1 
 
 
489 aa  60.1  0.00000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1846  polysaccharide biosynthesis protein  23.4 
 
 
433 aa  58.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  26.22 
 
 
474 aa  57.8  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  25.83 
 
 
463 aa  57  0.0000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  24.88 
 
 
461 aa  57  0.0000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0177  polysaccharide biosynthesis protein  21.96 
 
 
446 aa  57  0.0000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.89066  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2455  polysaccharide biosynthesis protein  24.47 
 
 
434 aa  56.6  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0777  polysaccharide biosynthesis protein  23.16 
 
 
441 aa  54.7  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1796  polysaccharide biosynthesis protein  22.06 
 
 
453 aa  53.9  0.000007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3272  polysaccharide biosynthesis protein  25.23 
 
 
546 aa  53.9  0.000007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509561  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2748  polysaccharide biosynthesis protein  28.03 
 
 
526 aa  52  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.327125  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2567  heteropolysaccharide repeat-containing protein  23.94 
 
 
517 aa  51.6  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.09409  normal  0.0273385 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1271  polysaccharide biosynthesis protein  26.32 
 
 
429 aa  51.2  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.958308  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3832  polysaccharide biosynthesis protein  25.99 
 
 
471 aa  51.2  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.431872  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0118  polysaccharide biosynthesis protein  23.32 
 
 
476 aa  50.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0224366  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0123  polysaccharide biosynthesis protein  23.32 
 
 
476 aa  50.8  0.00005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.281108  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0234  lipopolysaccharide O-side chain biosynthesis protein (O-antigen transpoter)  25.29 
 
 
476 aa  50.1  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00421263  normal  0.454805 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05310  hypothetical protein  26.07 
 
 
433 aa  49.3  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198261  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1738  polysaccharide biosynthesis protein  25.65 
 
 
514 aa  48.9  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.405975  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0796  polysaccharide biosynthesis protein  24.91 
 
 
482 aa  48.9  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.733222  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0483  polysaccharide biosynthesis protein  22.87 
 
 
477 aa  48.1  0.0004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2534  integral membrane protein MviN  23.16 
 
 
515 aa  47.4  0.0005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0132262 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0782  polysaccharide biosynthesis protein  26.26 
 
 
519 aa  47.4  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3233  polysaccharide biosynthesis protein  28.19 
 
 
473 aa  46.2  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2062  polysaccharide biosynthesis protein  21.36 
 
 
511 aa  45.4  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.445911  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0869  polysaccharide biosynthesis protein  23.11 
 
 
509 aa  45.1  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0457  polysaccharide biosynthesis protein  24.53 
 
 
488 aa  44.7  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4400  polysaccharides export protein  25.56 
 
 
506 aa  45.1  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  hitchhiker  0.0000000000248278 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2481  polysaccharide biosynthesis protein  24.15 
 
 
477 aa  44.7  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206749  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1791  polysaccharide biosynthesis protein  26.6 
 
 
504 aa  44.3  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2823  polysaccharide biosynthesis protein  24.58 
 
 
472 aa  44.3  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3713  polysaccharide biosynthesis protein  21.69 
 
 
445 aa  44.3  0.005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.336357  normal  0.0558632 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2783  polysaccharide biosynthesis protein  21.36 
 
 
494 aa  43.9  0.006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3859  polysaccharide biosynthesis protein  23.16 
 
 
461 aa  43.5  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0201275  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1966  integral membrane protein MviN  26.1 
 
 
524 aa  43.9  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2504  polysaccharide biosynthesis protein  22.22 
 
 
486 aa  43.9  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2457  polysaccharide biosynthesis protein  23.38 
 
 
514 aa  43.9  0.007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.267844  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4269  polysaccharide biosynthesis protein  23.99 
 
 
440 aa  43.5  0.008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1069  polysaccharide biosynthesis protein  29.33 
 
 
488 aa  43.1  0.01  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0264507  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0931  polysaccharides export protein  23.56 
 
 
506 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.201799  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0417  polysaccharide biosynthesis protein  23.75 
 
 
512 aa  43.1  0.01  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>