More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2721 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2721  type II secretion system protein E  100 
 
 
542 aa  1107  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.261716 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1064  type II secretion system protein E  68.39 
 
 
591 aa  700  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1032  type II secretion system protein E  64.04 
 
 
551 aa  676  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.621216  normal  0.536815 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2814  type II secretion system protein E  76.88 
 
 
556 aa  831  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2687  type II secretion system protein E  50.51 
 
 
549 aa  518  1e-145  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.719039 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2355  type II secretion system protein E  48.08 
 
 
628 aa  511  1e-143  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.692167  normal  0.583317 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0448  type II secretion system protein E  46.8 
 
 
797 aa  501  1e-141  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2400  type II secretion system protein E  47.74 
 
 
549 aa  497  1e-139  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0731  type II secretion system protein  46.76 
 
 
558 aa  495  1e-139  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3170  type II secretion system protein E  48.03 
 
 
609 aa  492  1e-138  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1172  type II secretion system protein E  46.6 
 
 
640 aa  484  1e-135  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00958345  normal  0.662669 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0254  type II secretion system protein E  46.04 
 
 
654 aa  476  1e-133  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1500  type II secretion system protein E  44.29 
 
 
682 aa  472  1e-132  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0597313  normal  0.0634104 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2003  type II secretion system protein E  46.08 
 
 
791 aa  464  1e-129  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1906  type II secretion system protein E  44.23 
 
 
749 aa  464  1e-129  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.124978  normal  0.483962 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0009  type II secretion system protein E  43.5 
 
 
547 aa  424  1e-117  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2148  type II secretion system protein E  40.11 
 
 
831 aa  416  1e-115  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.0453138 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2859  type II secretion system protein E  40.55 
 
 
847 aa  414  1e-114  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1537  aminoacyl-tRNA hydrolase  43.68 
 
 
583 aa  407  1e-112  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.20083  hitchhiker  0.0017261 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3137  type II secretion system protein E  47.24 
 
 
1319 aa  397  1e-109  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.0446325  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0946  type II secretion system protein E  47.48 
 
 
1335 aa  397  1e-109  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0978  type II secretion system protein E  49.23 
 
 
1255 aa  394  1e-108  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.742375  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2386  type II secretion system protein E  43.39 
 
 
692 aa  384  1e-105  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.934402  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1459  hypothetical protein  40.64 
 
 
770 aa  375  1e-103  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.362322 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0006  type II secretion system protein E  39.75 
 
 
545 aa  370  1e-101  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0314  type II secretion system protein E  39.5 
 
 
991 aa  357  3e-97  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.281088  normal  0.2578 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2422  type II secretion system protein E  38.37 
 
 
722 aa  354  2e-96  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3536  type II secretion system protein E  41.92 
 
 
612 aa  337  2e-91  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0808  type II secretion system protein E  36.97 
 
 
510 aa  318  2e-85  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1204  type II secretion system protein E  37.65 
 
 
519 aa  314  3e-84  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.431618  hitchhiker  0.000463314 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0439  type II secretion system protein E  37.48 
 
 
671 aa  311  2e-83  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1965  flagella related protein FlaI  33.64 
 
 
604 aa  296  4e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1344  type II secretion system protein E  34.86 
 
 
491 aa  281  3e-74  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.286284 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0104  type II secretion system protein E  37.78 
 
 
620 aa  279  1e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0352  type II secretion system protein E  37.28 
 
 
610 aa  275  1e-72  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.540636  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1862  type II secretion system protein E  36.87 
 
 
618 aa  270  5e-71  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0949  type II secretion system protein E  35.56 
 
 
617 aa  269  1e-70  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0134957  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1403  type II secretion system protein E  34.75 
 
 
492 aa  265  1e-69  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1870  type II secretion system protein E  37.36 
 
 
492 aa  265  2e-69  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0816791  normal  0.90316 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1342  type II secretion system protein E  36.43 
 
 
622 aa  264  4e-69  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.136296  normal  0.284799 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0128  type II secretion system protein E  37.8 
 
 
513 aa  263  5e-69  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.510633  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1318  type II secretion system protein E  38.85 
 
 
547 aa  262  1e-68  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.101894  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0948  type II secretion system protein E  34.38 
 
 
546 aa  260  5e-68  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0997  type II secretion system protein E  33.96 
 
 
546 aa  259  1e-67  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1732  type II secretion system protein E  33.68 
 
 
546 aa  259  1e-67  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0975  type II secretion system protein E  34.11 
 
 
546 aa  257  3e-67  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.844334  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1325  type II secretion system protein E  34.95 
 
 
512 aa  255  1e-66  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00455821  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0267  type II secretion system protein E  35.61 
 
 
543 aa  253  7e-66  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0424  type II secretion system protein E  31.97 
 
 
489 aa  252  1e-65  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.983223 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0230  type II secretion system protein E  34.35 
 
 
557 aa  252  1e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1574  type II secretion system protein E  31.78 
 
 
549 aa  248  1e-64  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0960  type II secretion system protein E  33.19 
 
 
557 aa  242  1e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0650  type II secretion system protein E  31.11 
 
 
572 aa  237  3e-61  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.200962 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3412  type II secretion system protein E  33.05 
 
 
559 aa  234  2e-60  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2568  type II secretion system protein E  32.72 
 
 
557 aa  234  2e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2874  type II secretion system protein E  31.51 
 
 
557 aa  234  4e-60  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.358987  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0196  type II secretion system protein E  32.53 
 
 
577 aa  233  8e-60  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.191118  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1037  type II secretion system protein E  34.51 
 
 
552 aa  214  4e-54  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0840117 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1154  type II secretion system protein E  30.99 
 
 
544 aa  214  4e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0909  type II secretion system protein E  34.01 
 
 
548 aa  211  2e-53  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0853  type II secretion system protein E  35.78 
 
 
311 aa  211  2e-53  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.647249  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1640  type II secretion system protein E  33.5 
 
 
552 aa  207  5e-52  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.160134  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1095  type II secretion system protein E  28.88 
 
 
473 aa  201  3e-50  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.132714  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2104  type II secretion system protein E  30.9 
 
 
476 aa  200  6e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.609091  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1037  type II secretion system protein E  32.24 
 
 
553 aa  194  4e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1055  type II secretion system protein E  32.24 
 
 
553 aa  194  4e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1049  type II secretion system protein E  32.24 
 
 
553 aa  194  4e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.487211  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1043  type II secretion system protein E  32.24 
 
 
553 aa  194  4e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0495  type II secretion system protein E  31.39 
 
 
515 aa  183  7e-45  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4447  type II secretion system protein E  35.03 
 
 
438 aa  172  1e-41  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1856  type II secretion system protein E  33.76 
 
 
521 aa  169  1e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.808966  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2070  type II secretion system protein E  33.74 
 
 
440 aa  167  3e-40  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.577602  normal  0.86382 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2290  type II secretion system protein E  29.61 
 
 
498 aa  167  5e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1405  type II secretion system protein E  34.85 
 
 
454 aa  166  1e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  37.45 
 
 
444 aa  164  3e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  33.13 
 
 
451 aa  164  4e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2569  type II secretion system protein E  29.12 
 
 
463 aa  163  7e-39  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4663  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  35.18 
 
 
447 aa  163  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0858858  decreased coverage  0.000709192 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1791  type II/IV secretion system protein  37.89 
 
 
447 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.24079  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  34.78 
 
 
468 aa  162  1e-38  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3656  type II/IV secretion system protein, ATPase domain-containing protein  34.53 
 
 
438 aa  162  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1770  type II/IV secretion system protein  37.89 
 
 
447 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1944  type II/IV secretion system protein  37.89 
 
 
447 aa  162  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000254156  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  33.83 
 
 
453 aa  162  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1523  type II secretion system protein E  34.53 
 
 
450 aa  161  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.68059  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2540  type II/IV secretion system protein  37.5 
 
 
446 aa  161  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.511754  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1043  type II secretion system protein E  34.53 
 
 
450 aa  161  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.994378  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1499  type II secretion system protein E  34.53 
 
 
450 aa  161  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  3.1609e-06 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1655  type II secretion system protein E  38.67 
 
 
469 aa  161  3e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.591506 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5411  type II secretion system protein E  34.53 
 
 
440 aa  161  3e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0593921  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2796  putative type II/IV secretion ATPase protein, TadA  34.85 
 
 
469 aa  160  5e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.178047  normal  0.242978 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1730  type II secretion system protein E  34.53 
 
 
447 aa  160  6e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  decreased coverage  2.24608e-07 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1339  type II secretion system protein E  33.65 
 
 
412 aa  160  8e-38  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1445  type II secretion system protein E  34.5 
 
 
455 aa  159  8e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.314248  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  32.39 
 
 
479 aa  159  9e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2323  type II secretion system protein E  33.82 
 
 
449 aa  159  1e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.935094 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  36.09 
 
 
442 aa  159  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0554  type II secretion system protein E  36.23 
 
 
485 aa  159  2e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1852  type II secretion system protein E  33.44 
 
 
470 aa  158  2e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1905  putative Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  36.23 
 
 
485 aa  159  2e-37  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.094928  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>