245 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2570 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2570  sodium:neurotransmitter symporter  100 
 
 
443 aa  848    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.390192 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1637  sodium:neurotransmitter symporter  52.44 
 
 
451 aa  384  1e-105  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.143336 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3091  sodium:neurotransmitter symporter  47.26 
 
 
457 aa  366  1e-100  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.709672  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1741  sodium:neurotransmitter symporter  45.39 
 
 
446 aa  347  2e-94  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2975  sodium:neurotransmitter symporter  47.7 
 
 
488 aa  342  5.999999999999999e-93  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0110  sodium:neurotransmitter symporter  44.47 
 
 
472 aa  322  7e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2007  sodium:neurotransmitter symporter  46.1 
 
 
475 aa  302  8.000000000000001e-81  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3893  sodium:neurotransmitter symporter  45.98 
 
 
488 aa  281  1e-74  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1792  sodium:neurotransmitter symporter  36.91 
 
 
453 aa  270  4e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000197904  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1105  sodium:neurotransmitter symporter  37.99 
 
 
453 aa  259  5.0000000000000005e-68  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.050173  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1622  sodium:neurotransmitter symporter  35.06 
 
 
446 aa  258  1e-67  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.185224  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2246  sodium-dependent transporter, putative  36.41 
 
 
446 aa  256  6e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.010135  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2060  sodium-dependent transporter  36.65 
 
 
446 aa  256  7e-67  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0130438  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2216  sodium-dependent transporter  36.65 
 
 
446 aa  256  7e-67  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.577413  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3127  putative sodium-dependent transporter  36.41 
 
 
446 aa  256  8e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0292515  normal  0.0156327 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2198  putative sodium-dependent transporter  36.25 
 
 
446 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.221753  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2328  putative sodium-dependent transporter  36.17 
 
 
446 aa  254  3e-66  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000364471  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2041  sodium:neurotransmitter symporter  36.25 
 
 
446 aa  253  5.000000000000001e-66  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.628241  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2244  putative sodium-dependent transporter  36.41 
 
 
446 aa  253  7e-66  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.781719999999999e-27 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2000  sodium-dependent transporter  36.43 
 
 
446 aa  252  1e-65  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000556879  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1999  sodium-dependent transporter  36.41 
 
 
446 aa  252  1e-65  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00179819  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0541  sodium-dependent transporter  34.16 
 
 
458 aa  251  1e-65  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0030  sodium:neurotransmitter symporter  37.67 
 
 
449 aa  249  5e-65  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.623873 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2054  sodium:neurotransmitter symporter  34.4 
 
 
452 aa  246  4e-64  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1035  sodium:neurotransmitter symporter  36.89 
 
 
446 aa  246  8e-64  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1256  sodium:neurotransmitter symporter  37.25 
 
 
443 aa  244  9.999999999999999e-64  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00157351  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1260  sodium:neurotransmitter symporter  38.74 
 
 
475 aa  244  1.9999999999999999e-63  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000558037  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0775  sodium-dependent transporter  31.95 
 
 
454 aa  244  1.9999999999999999e-63  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.000147052  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0402  SNF family Na(+)-dependent transporter  37.47 
 
 
468 aa  244  3e-63  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4148  sodium:neurotransmitter symporter  36.64 
 
 
459 aa  244  3e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.500155  normal  0.19565 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1590  putative sodium-dependent transporter  37.36 
 
 
452 aa  243  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000025951  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1157  sodium:neurotransmitter symporter  35.2 
 
 
452 aa  243  3.9999999999999997e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00156035  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1552  sodium-dependent transporter, putative  37.99 
 
 
451 aa  243  7e-63  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.110657  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1312  sodium-dependent transporter  37.76 
 
 
452 aa  243  7e-63  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00101935  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2874  sodium:neurotransmitter symporter  37.83 
 
 
464 aa  243  7e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.673413 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1792  sodium:neurotransmitter symporter  35 
 
 
452 aa  242  1e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1704  sodium:neurotransmitter symporter  33.63 
 
 
450 aa  241  2e-62  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0489471  normal  0.65305 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003803  putative sodium-dependent transporter  35.54 
 
 
476 aa  241  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1520  putative sodium-dependent transporter  37.53 
 
 
452 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0966400000000004e-30 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1338  sodium-dependent transporter  37.53 
 
 
452 aa  241  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.328637  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1311  sodium-dependent transporter  37.53 
 
 
452 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00219151  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1448  sodium-dependent transporter  37.53 
 
 
451 aa  240  2.9999999999999997e-62  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0041724  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2112  sodium:neurotransmitter symporter  40.57 
 
 
455 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2640  sodium:neurotransmitter symporter  36.51 
 
 
454 aa  239  9e-62  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0280072  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1525  sodium-dependent transporter  32.96 
 
 
450 aa  237  3e-61  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000897057  decreased coverage  0.00856693 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2879  sodium:neurotransmitter symporter  34.14 
 
 
470 aa  237  4e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0267989  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1484  putative sodium-dependent transporter  37.76 
 
 
452 aa  236  5.0000000000000005e-61  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00118732  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3860  sodium-dependent tryptophan transporter  37.76 
 
 
452 aa  236  6e-61  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0141824  hitchhiker  0.0000000110845 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2266  sodium:neurotransmitter symporter  35.49 
 
 
455 aa  236  6e-61  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1949  sodium:neurotransmitter symporter  34.53 
 
 
455 aa  235  1.0000000000000001e-60  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.804307  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1352  sodium:neurotransmitter symporter  37.53 
 
 
452 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0221147  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1611  sodium/neurotransmitter symporter family protein  34.31 
 
 
457 aa  234  2.0000000000000002e-60  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.195331  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1701  sodium-dependent transporter  35.83 
 
 
445 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.296759  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1682  SNF family sodium-dependent transporter  35.83 
 
 
445 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1835  sodium-dependent transporter  35.83 
 
 
445 aa  234  2.0000000000000002e-60  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.193759  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1151  sodium:neurotransmitter symporter  38.35 
 
 
451 aa  231  1e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0261986  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1841  sodium-dependent transporter  35.83 
 
 
445 aa  231  1e-59  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1066  sodium-dependent transporter  33.89 
 
 
454 aa  231  1e-59  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.094867  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1903  sodium:neurotransmitter symporter  34.37 
 
 
453 aa  231  1e-59  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.669415 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3502  sodium-dependent transporter  35.83 
 
 
445 aa  232  1e-59  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1440  sodium:neurotransmitter symporter  35.62 
 
 
445 aa  231  2e-59  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0226414  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1657  SNF family sodium-dependent transporter  35.83 
 
 
445 aa  231  2e-59  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1958  sodium-dependent transporter  35.6 
 
 
445 aa  231  2e-59  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.331553  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1923  sodium-dependent transporter  35.83 
 
 
445 aa  230  3e-59  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1818  sodium-dependent transporter  35.51 
 
 
458 aa  231  3e-59  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.00000435894  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1700  sodium:neurotransmitter symporter  34.87 
 
 
486 aa  230  4e-59  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.0878592 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1879  sodium-dependent transporter  35.67 
 
 
447 aa  230  5e-59  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.184026 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1695  sodium:neurotransmitter symporter  36.12 
 
 
447 aa  229  5e-59  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.165275  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0263  sodium:neurotransmitter symporter  34.57 
 
 
464 aa  229  6e-59  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1490  sodium:neurotransmitter symporter  35.16 
 
 
486 aa  227  3e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3274  sodium:neurotransmitter symporter  36.78 
 
 
455 aa  227  3e-58  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0256364  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0963  sodium:neurotransmitter symporter  33.78 
 
 
452 aa  226  8e-58  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02692  hypothetical protein  34.24 
 
 
456 aa  225  1e-57  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2848  sodium:neurotransmitter symporter  35.14 
 
 
461 aa  224  2e-57  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20910  sodium:neurotransmitter symporter  35.08 
 
 
437 aa  223  4e-57  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2371  sodium-dependent symporter family protein  34.15 
 
 
453 aa  222  9e-57  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  unclonable  0.00000000133814  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0698  sodium:neurotransmitter symporter  38.37 
 
 
448 aa  221  9.999999999999999e-57  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0874  sodium:neurotransmitter symporter  37.28 
 
 
454 aa  221  9.999999999999999e-57  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.395268 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2101  sodium:neurotransmitter symporter  33.87 
 
 
466 aa  221  1.9999999999999999e-56  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0284864 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2621  sodium-dependent transporter family protein  32.29 
 
 
452 aa  218  2e-55  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2931  sodium:neurotransmitter symporter  34.09 
 
 
484 aa  217  2.9999999999999998e-55  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2012  sodium:neurotransmitter symporter  34.3 
 
 
450 aa  217  4e-55  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0522104  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1293  Sodium:neurotransmitter symporter  34.51 
 
 
451 aa  216  7e-55  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06480  SNF family Na+-dependent transporter  33.88 
 
 
483 aa  216  9e-55  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0127439  normal  0.268272 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0909  sodium-dependent transporter (SNF family)  30.87 
 
 
454 aa  215  9.999999999999999e-55  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.45649  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1865  sodium-dependent transporter  35.56 
 
 
453 aa  214  3.9999999999999995e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2740  sodium-dependent transporter family protein  33.04 
 
 
457 aa  212  9e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00332714  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22700  SNF family Na+-dependent transporter  34.88 
 
 
470 aa  212  1e-53  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.770731 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3037  sodium:neurotransmitter symporter  40 
 
 
442 aa  211  2e-53  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1069  putative sodium-dependent transporter  30.75 
 
 
447 aa  211  3e-53  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.291946  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0704  sodium-dependent transporter, putative  30.52 
 
 
447 aa  210  4e-53  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0629  sodium-dependent transporter, putative  30.52 
 
 
447 aa  210  4e-53  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2297  Na+-dependent transporter of the SNF family protein  30.55 
 
 
461 aa  209  6e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0556  sodium:neurotransmitter symporter  35.41 
 
 
457 aa  209  8e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12871  hypothetical protein  34.14 
 
 
447 aa  208  1e-52  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0480  sodium:neurotransmitter symporter  32.77 
 
 
446 aa  206  8e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.000000696171  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0493  sodium:neurotransmitter symporter  32.77 
 
 
446 aa  206  8e-52  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000262524  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0381  sodium:neurotransmitter symporter  32.55 
 
 
465 aa  205  1e-51  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.0000000240956  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0960  sodium- and chloride-dependent transporter  32.41 
 
 
447 aa  204  2e-51  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.114639  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24190  SNF family Na+-dependent transporter  35.15 
 
 
468 aa  203  5e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>