34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2482 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2482  DNA primase, small subunit  100 
 
 
392 aa  793  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0410  DNA primase, small subunit  70.66 
 
 
391 aa  576  1e-163  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.193863  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2564  DNA primase, small subunit  71.43 
 
 
391 aa  573  1e-162  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2753  DNA primase small subunit  65.14 
 
 
386 aa  517  1e-145  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1798  DNA primase small subunit  57.25 
 
 
387 aa  431  1e-119  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0420  DNA primase small subunit  41.09 
 
 
395 aa  268  1e-70  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.669616  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1392  DNA primase small subunit  37.44 
 
 
390 aa  261  2e-68  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.369939  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2047  putative DNA primase, small subunit  37.53 
 
 
387 aa  233  4e-60  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1571  DNA primase small subunit  35.61 
 
 
414 aa  233  6e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1955  putative DNA primase, small subunit  34.75 
 
 
374 aa  219  5e-56  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.804448 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1303  DNA primase small subunit  34.73 
 
 
380 aa  219  8e-56  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1245  DNA primase, small subunit  32.92 
 
 
404 aa  216  4e-55  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0953  DNA primase, small subunit  35.66 
 
 
378 aa  212  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1132  DNA primase, small subunit, putative  34.41 
 
 
388 aa  200  3e-50  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0622  putative DNA primase, small subunit  30.47 
 
 
389 aa  151  2e-35  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1378  putative DNA primase, small subunit  31.31 
 
 
348 aa  135  1e-30  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.214397  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0991  DNA primase small subunit  36.84 
 
 
312 aa  117  3e-25  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2019  DNA primase small subunit  32.65 
 
 
330 aa  104  3e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.358314  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1787  putative DNA primase, small subunit  27.7 
 
 
312 aa  103  5e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.057405 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1683  DNA primase, small subunit  29.89 
 
 
312 aa  103  7e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.773478 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0437  putative DNA primase, small subunit  33.33 
 
 
312 aa  103  8e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0066  DNA primase small subunit  24.94 
 
 
373 aa  93.6  6e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1793  DNA primase small subunit  35.38 
 
 
320 aa  91.7  2e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0877  DNA primase, small subunit  25.21 
 
 
357 aa  75.1  2e-12  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1070  putative DNA primase, small subunit  25.54 
 
 
363 aa  70.9  4e-11  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1606  DNA primase small subunit  25.08 
 
 
357 aa  70.5  5e-11  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0882  putative DNA primase, small subunit  22.9 
 
 
364 aa  69.3  1e-10  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.506684  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1084  putative DNA primase, small subunit  24.22 
 
 
355 aa  67.4  4e-10  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.346262  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41816  predicted protein  30.41 
 
 
398 aa  61.6  2e-08  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.251296 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_48208  predicted protein  30.41 
 
 
398 aa  61.6  2e-08  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.180067 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_55030  p48 polypeptide of DNA primase  39.18 
 
 
437 aa  52.8  1e-05  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006687  CNE01650  conserved hypothetical protein  24.31 
 
 
429 aa  49.7  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03033  DNA primase subunit Pri1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G09020)  24.81 
 
 
521 aa  46.6  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.344659 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54992  predicted protein  24.86 
 
 
458 aa  44.7  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.030257  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>