89 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2435 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2435  halocyanin domain protein  100 
 
 
347 aa  678    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  decreased coverage  0.000875368 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2685  halocyanin domain protein  41 
 
 
292 aa  181  1e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.197365  normal  0.0848247 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0581  halocyanin domain protein  45.7 
 
 
212 aa  146  6e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679046  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1156  halocyanin domain protein  63.79 
 
 
186 aa  144  3e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.362387 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0570  halocyanin domain protein  46.15 
 
 
209 aa  136  5e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23024  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3100  halocyanin domain protein  44.81 
 
 
224 aa  127  3e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2688  halocyanin domain protein  53.85 
 
 
179 aa  126  5e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266175  normal  0.114793 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1476  halocyanin domain protein  55.65 
 
 
231 aa  125  2e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2854  halocyanin domain protein  48.21 
 
 
210 aa  124  3e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.811461  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0739  halocyanin domain protein  48.59 
 
 
160 aa  122  9.999999999999999e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1173  halocyanin domain protein  59.6 
 
 
136 aa  115  1.0000000000000001e-24  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00281151 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2576  halocyanin domain protein  40.66 
 
 
218 aa  112  1.0000000000000001e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0793  halocyanin domain protein  49.57 
 
 
205 aa  107  3e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.289912  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0583  blue (type 1) copper domain protein  40 
 
 
209 aa  85.1  0.000000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.308341 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0645  blue (type 1) copper domain protein  38.61 
 
 
214 aa  73.2  0.000000000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.375984  normal  0.285724 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  38.32 
 
 
125 aa  67  0.0000000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1871  blue (type 1) copper domain protein  36.04 
 
 
221 aa  62.8  0.000000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0614509 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  32.71 
 
 
119 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  32.71 
 
 
119 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1005  blue (type 1) copper domain protein  38.05 
 
 
138 aa  61.6  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0916  plastocyanin  42.86 
 
 
119 aa  60.5  0.00000004  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0239  blue (type1) copper domain-containing protein  42.31 
 
 
97 aa  58.2  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1015  plastocyanin  41.11 
 
 
126 aa  58.2  0.0000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.381594  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1734  hypothetical protein  27.31 
 
 
276 aa  57.8  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0063943  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0721  blue (type 1) copper domain protein  36.27 
 
 
144 aa  57  0.0000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3202  blue (type 1) copper domain protein  36.27 
 
 
807 aa  56.6  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.720894  normal  0.248673 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0784  blue (type 1) copper domain protein  42.53 
 
 
136 aa  55.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.46005  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6275  pseudoazurin  40.91 
 
 
147 aa  55.1  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.246646 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1313  blue (type 1) copper domain protein  42.7 
 
 
172 aa  55.5  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705795  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06371  plastocyanin  35 
 
 
116 aa  54.7  0.000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0952102  normal  0.874773 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0581  plastocyanin  32.74 
 
 
116 aa  55.1  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10711  plastocyanin  39 
 
 
128 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.590546 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06071  plastocyanin  33.63 
 
 
116 aa  54.3  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06461  plastocyanin  32.74 
 
 
116 aa  54.7  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.937671  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1509  blue (type 1) copper domain protein  35.4 
 
 
146 aa  54.3  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0017  plastocyanin  35 
 
 
116 aa  53.9  0.000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.771707  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1244  blue (type1) copper domain-containing protein  30.48 
 
 
173 aa  53.5  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0146  blue (type 1) copper domain protein  37.18 
 
 
119 aa  53.5  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0975  blue (type1) copper domain-containing protein  38.95 
 
 
120 aa  53.1  0.000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2129  blue (type 1) copper domain protein  38.78 
 
 
137 aa  53.1  0.000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1216  pseudoazurin  35.35 
 
 
146 aa  53.1  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0391  blue (type 1) copper domain protein  38.16 
 
 
114 aa  52.8  0.000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1788  plastocyanin-like protein  31.34 
 
 
264 aa  52  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341565  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1087  pseudoazurin  34.69 
 
 
148 aa  52.4  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.155956 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1621  blue (type 1) copper domain protein  37.62 
 
 
110 aa  52  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0571414  normal  0.244235 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  36 
 
 
417 aa  52.4  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0263  blue (type1) copper domain-containing protein  36.25 
 
 
146 aa  51.6  0.00002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.804107  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4301  blue (type 1) copper domain protein  35.63 
 
 
235 aa  52  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0575  blue (type 1) copper domain protein  37.27 
 
 
141 aa  52  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.093408  normal  0.720315 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  28.95 
 
 
127 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1021  pseudoazurin  36.08 
 
 
144 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2726  pseudoazurin  36.36 
 
 
147 aa  51.6  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0568  pseudoazurin  34.62 
 
 
144 aa  51.6  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06371  plastocyanin  31.86 
 
 
116 aa  51.2  0.00003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1008  pseudoazurin  32.43 
 
 
150 aa  50.8  0.00003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338576  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18341  plastocyanin  35.56 
 
 
119 aa  49.7  0.00007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2525  blue (type 1) copper domain protein  40.58 
 
 
179 aa  49.7  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1226  blue (type1) copper domain-containing protein  28.57 
 
 
358 aa  49.3  0.00009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2687  putative pseudoazurin precursor  31.71 
 
 
161 aa  49.3  0.00009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0140682  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0817  blue (type1) copper domain-containing protein  39.47 
 
 
97 aa  48.9  0.0001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.737466  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3552  blue (type 1) copper domain protein  31.33 
 
 
119 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0323  blue (type1) copper domain-containing protein  34.21 
 
 
123 aa  48.5  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00521297  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2077  pseudoazurin  26.72 
 
 
151 aa  48.1  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4690  plastocyanin like protein  40 
 
 
72 aa  48.5  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.571062  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0960  plastocyanin  31.07 
 
 
139 aa  47.4  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.821855  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0247  blue (type 1) copper domain protein  36.17 
 
 
157 aa  47.4  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12818  hypothetical protein  32.82 
 
 
192 aa  47  0.0005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.562782  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0345  blue (type 1) copper domain protein  36.36 
 
 
119 aa  46.6  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0227778 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1705  pseudoazurin  29.03 
 
 
145 aa  46.6  0.0007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2563  plastocyanin  31.18 
 
 
133 aa  46.2  0.0008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2424  blue (type 1) copper domain protein  36.63 
 
 
146 aa  46.2  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  30.28 
 
 
444 aa  45.8  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3437  hypothetical protein  35.23 
 
 
181 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5624  pseudoazurin  30.3 
 
 
152 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.300096  normal  0.462695 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5841  pseudoazurin  28.85 
 
 
152 aa  45.1  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0493  blue (type1) copper domain-containing protein  26.88 
 
 
318 aa  45.1  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2298  beta-Ig-H3/fasciclin  40 
 
 
301 aa  44.7  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1926  pseudoazurin  32.22 
 
 
144 aa  45.4  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0642736 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1663  pseudoazurin  31.58 
 
 
153 aa  44.7  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0434336  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1652  blue (type 1) copper domain protein  32.04 
 
 
486 aa  44.3  0.003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373533  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2055  pseudoazurin  32.94 
 
 
144 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3272  blue (type1) copper domain-containing protein  39.24 
 
 
116 aa  44.3  0.003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.639699  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2780  blue (type 1) copper domain protein  37.14 
 
 
112 aa  43.9  0.004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235268  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2686  pseudoazurin  33.7 
 
 
173 aa  43.5  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0680681  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1206  blue (type1) copper domain-containing protein  23.83 
 
 
545 aa  43.5  0.006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4790  blue (type1) copper domain-containing protein  36.76 
 
 
116 aa  43.5  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.339634  normal  0.129438 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4222  pseudoazurin  35.23 
 
 
147 aa  43.1  0.007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1250  protease inhibitor Kazal-type  41.67 
 
 
239 aa  43.1  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2900  pseudoazurin  32.1 
 
 
146 aa  42.7  0.009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.497446  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>