27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2330 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2330  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  100 
 
 
179 aa  360  7.0000000000000005e-99  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.373955 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1708  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  83.04 
 
 
174 aa  270  7e-72  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3157  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  82.46 
 
 
178 aa  267  5e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.484396  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0965  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  81.87 
 
 
172 aa  264  5e-70  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0285  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  79.53 
 
 
174 aa  261  3e-69  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.137025  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1650  transcription factor TFIIE, alpha subunit  45.68 
 
 
167 aa  149  2e-35  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0196  transcription factor IIE (TFIIE), alpha subunit  44.3 
 
 
164 aa  138  4.999999999999999e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1524  transcription factor TFIIE, alpha subunit  37.87 
 
 
173 aa  137  6e-32  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2797  transcription factor TFIIE, alpha subunit  38.69 
 
 
173 aa  137  1e-31  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0975699 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0372  transcription factor IIE (TFIIE), alpha subunit  44.23 
 
 
165 aa  137  1e-31  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0000142035  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1279  transcription factor TFIIE, alpha subunit  37.95 
 
 
173 aa  134  6.0000000000000005e-31  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.11333 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2009  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  38.46 
 
 
173 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.735877  normal  0.179064 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0913  transcription initiation factor E subunit alpha  36.09 
 
 
185 aa  120  7e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1644  transcription initiation factor E subunit alpha  35.71 
 
 
185 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.275573  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1033  transcription initiation factor E subunit alpha  36.09 
 
 
185 aa  120  9.999999999999999e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0325255 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1033  transcription initiation factor E subunit alpha  35.93 
 
 
185 aa  119  3e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0458  hypothetical protein  31.53 
 
 
211 aa  117  9e-26  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.848866  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1150  transcription initiation factor E subunit alpha  32.35 
 
 
183 aa  109  2.0000000000000002e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1244  Transcription factor TFIIE, alpha subunit  36.57 
 
 
178 aa  105  3e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2279  transcription factor IIE (TFIIE), alpha subunit  35.37 
 
 
176 aa  103  2e-21  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.933385 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0710  transcription factor TFIIE, alpha subunit  36.69 
 
 
178 aa  89.7  2e-17  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1607  transcription factor TFIIE subunit alpha  30.54 
 
 
171 aa  85.5  4e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0035  transcription factor TFIIE, alpha subunit  27.69 
 
 
170 aa  58.5  0.00000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1074  transcription factor TFIIE, alpha subunit  24 
 
 
170 aa  56.2  0.0000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_2147  transcription factor IIE (TFIIE), alpha subunit  26.15 
 
 
170 aa  55.1  0.0000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0032  transcription factor TFIIE, alpha subunit  25 
 
 
170 aa  54.3  0.0000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00767088 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1388  transcription factor TFIIE, alpha subunit  29.81 
 
 
183 aa  51.6  0.000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.299499  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>