232 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2206 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2206  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
410 aa  834    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.685598 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3081  FAD dependent oxidoreductase  63.95 
 
 
413 aa  552  1e-156  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3091  FAD dependent oxidoreductase  65.68 
 
 
410 aa  549  1e-155  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.275239  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2507  FAD dependent oxidoreductase  63.3 
 
 
414 aa  545  1e-154  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0926  FAD dependent oxidoreductase  64.63 
 
 
411 aa  545  1e-154  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.609885  hitchhiker  0.00113671 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1007  FAD dependent oxidoreductase  63.55 
 
 
409 aa  532  1e-150  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1955  hypothetical protein  40.89 
 
 
405 aa  244  1.9999999999999999e-63  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0431  hypothetical protein  30.6 
 
 
422 aa  119  9e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.446535  normal  0.169558 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  29.2 
 
 
452 aa  110  3e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  26.18 
 
 
453 aa  110  6e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  25.97 
 
 
402 aa  107  5e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  26.85 
 
 
399 aa  104  2e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  23.54 
 
 
406 aa  102  1e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  26.38 
 
 
398 aa  102  1e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  25.68 
 
 
395 aa  99  1e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0938  geranylgeranyl reductase  25.94 
 
 
453 aa  97.4  4e-19  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.129052 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  23.66 
 
 
408 aa  94.7  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  26.57 
 
 
407 aa  94.7  3e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  26.02 
 
 
402 aa  94.4  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  28.57 
 
 
398 aa  92  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  25.07 
 
 
384 aa  90.9  3e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1407  geranylgeranyl reductase  28.13 
 
 
398 aa  90.1  6e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.426262  normal  0.248213 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  28.11 
 
 
393 aa  89.7  8e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  27.59 
 
 
397 aa  89  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0811  geranylgeranyl reductase  25.07 
 
 
453 aa  89  1e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  25.74 
 
 
387 aa  88.2  3e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  26.01 
 
 
390 aa  87.8  3e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  25.54 
 
 
390 aa  87.4  5e-16  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  26.08 
 
 
390 aa  87  5e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  23.87 
 
 
390 aa  87  5e-16  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  24.66 
 
 
396 aa  86.7  6e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  27.81 
 
 
393 aa  86.3  9e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0681  geranylgeranyl reductase  23.89 
 
 
453 aa  81.6  0.00000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00166018  hitchhiker  0.00000684168 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2269  geranylgeranyl reductase  26.22 
 
 
398 aa  80.1  0.00000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  22.92 
 
 
375 aa  80.1  0.00000000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1696  geranylgeranyl reductase  25.99 
 
 
459 aa  79.3  0.0000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  23.86 
 
 
391 aa  79.7  0.0000000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4688  monooxygenase FAD-binding  24.47 
 
 
417 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  23.06 
 
 
391 aa  78.2  0.0000000000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  23.22 
 
 
386 aa  77  0.0000000000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1429  hypothetical protein  25.52 
 
 
395 aa  76.6  0.0000000000008  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.0716636 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  28.46 
 
 
430 aa  75.1  0.000000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  25.95 
 
 
376 aa  75.1  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  27.33 
 
 
425 aa  74.7  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1826  geranylgeranyl reductase  28.32 
 
 
393 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1873  geranylgeranyl reductase  28.32 
 
 
393 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700646  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  28.01 
 
 
430 aa  73.9  0.000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1807  geranylgeranyl reductase  28.32 
 
 
393 aa  74.3  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622254  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  23.8 
 
 
396 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0830  geranylgeranyl reductase  26.37 
 
 
415 aa  72  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05461  NAD binding site  22.3 
 
 
377 aa  71.6  0.00000000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  28.82 
 
 
445 aa  69.7  0.00000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1644  FAD dependent oxidoreductase  20.91 
 
 
378 aa  69.7  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00782092 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08531  dehydrogenases (flavoproteins)  26.37 
 
 
398 aa  69.7  0.00000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.741714  hitchhiker  0.00186449 
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  21.92 
 
 
379 aa  69.3  0.0000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  27.42 
 
 
418 aa  68.9  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  28.1 
 
 
434 aa  69.3  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  28.18 
 
 
431 aa  68.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  25.58 
 
 
424 aa  67.4  0.0000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  27.48 
 
 
457 aa  67.8  0.0000000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  27.72 
 
 
431 aa  67.8  0.0000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1090  bacteriochlorophyll synthase 43 kDa subunit  22.34 
 
 
385 aa  67  0.0000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  28.61 
 
 
435 aa  65.5  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  24.94 
 
 
378 aa  65.9  0.000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4604  Electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  25.14 
 
 
432 aa  65.1  0.000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  25.08 
 
 
414 aa  65.5  0.000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0668  geranylgeranyl reductase  25.36 
 
 
458 aa  64.3  0.000000004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.159483  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05761  NAD binding site  20.58 
 
 
377 aa  64.3  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.680324  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2119  tryptophan halogenase  27.47 
 
 
507 aa  64.3  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0671126  normal  0.0332938 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  21.72 
 
 
399 aa  63.9  0.000000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15361  NAD binding site  25.64 
 
 
405 aa  63.9  0.000000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.298365 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  28.08 
 
 
419 aa  63.5  0.000000006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  19.53 
 
 
392 aa  63.5  0.000000006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0539  geranylgeranyl reductase  19.79 
 
 
391 aa  63.5  0.000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07370  geranylgeranyl reductase family protein  27.52 
 
 
431 aa  63.2  0.000000008  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0284516 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0166  geranylgeranyl reductase  24.15 
 
 
453 aa  63.2  0.000000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  23.1 
 
 
444 aa  61.6  0.00000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2031  tryptophan halogenase  21.97 
 
 
413 aa  61.2  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0818162  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1514  geranylgeranyl reductase  21.55 
 
 
485 aa  60.8  0.00000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00785047 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03738  hydroxylase  23.51 
 
 
461 aa  61.2  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  26.91 
 
 
434 aa  60.5  0.00000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2717  geranylgeranyl reductase  28.81 
 
 
443 aa  60.1  0.00000007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.593407 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  26.43 
 
 
365 aa  60.1  0.00000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  25.55 
 
 
375 aa  60.1  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  18.91 
 
 
386 aa  59.7  0.00000008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1070  hypothetical protein  23.49 
 
 
387 aa  59.3  0.0000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  26.59 
 
 
341 aa  58.9  0.0000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2724  tryptophan halogenase  24.63 
 
 
506 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.656683  normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0479  electron-transferring-flavoprotein dehydrogenase  22.65 
 
 
425 aa  59.3  0.0000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  hitchhiker  0.000230935  decreased coverage  0.000263259 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  25.75 
 
 
423 aa  59.3  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1496  geranylgeranyl reductase  25.41 
 
 
361 aa  59.7  0.0000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.963353  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  22.25 
 
 
393 aa  58.9  0.0000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1349  geranylgeranyl reductase  18.91 
 
 
392 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0520  NAD binding site  22.68 
 
 
377 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  30.74 
 
 
425 aa  58.5  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0472  geranylgeranyl reductase  18.47 
 
 
385 aa  58.2  0.0000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.730289  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1220  dehydrogenase (flavoprotein)-like protein  22 
 
 
378 aa  57.4  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_677  hypothetical protein  20.05 
 
 
379 aa  57.4  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.545095  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  23.55 
 
 
382 aa  57  0.0000006  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  26.17 
 
 
413 aa  56.6  0.0000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>