50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_2015 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_2015  hypothetical protein  100 
 
 		 347 aa  692    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.509344 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1925  hypothetical protein  68.62 
 
 		 347 aa  459  9.999999999999999e-129  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.315657  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1426  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  66.25 
 
 		 362 aa  429  1e-119  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2190  FAD dependent oxidoreductase  59.26 
 
 		 344 aa  377  1e-103  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0435  FAD dependent oxidoreductase  37.43 
 
 		 347 aa  227  2e-58  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.164811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0167  FAD dependent oxidoreductase  42.41 
 
 		 336 aa  220  3e-56  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.205435  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4204  FAD dependent oxidoreductase  36.49 
 
 		 346 aa  215  8e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.429398 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2785  FAD dependent oxidoreductase  35.44 
 
 		 335 aa  199  3.9999999999999996e-50  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.81235  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0027  FAD dependent oxidoreductase  35.22 
 
 		 344 aa  155  1e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1126  amine oxidase, flavin-containing protein  26.59 
 
 		 328 aa  100  4e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1075  FAD dependent oxidoreductase  28.86 
 
 		 328 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.817137 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0742  hypothetical protein  29.56 
 
 		 328 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.64643  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0783  FAD dependent oxidoreductase  28.39 
 
 		 328 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.918451  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4447  hypothetical protein  28.08 
 
 		 328 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0770  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like protein  28.93 
 
 		 328 aa  94.4  2e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.780127  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5306  hypothetical protein  27.54 
 
 		 327 aa  94.4  3e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61600  hypothetical protein  27.25 
 
 		 327 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0728796 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1906  FAD dependent oxidoreductase  30.53 
 
 		 351 aa  87.4  4e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.118317  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0288  DNA photolyase FAD-binding protein  29.13 
 
 		 843 aa  85.1  0.000000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1481  FAD dependent oxidoreductase  27.69 
 
 		 341 aa  82.4  0.00000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0965  amine oxidase, flavin-containing  27.41 
 
 		 328 aa  81.3  0.00000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3599  FAD dependent oxidoreductase  27.66 
 
 		 346 aa  80.9  0.00000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.469063 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4732  FAD dependent oxidoreductase  28.28 
 
 		 328 aa  80.5  0.00000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.104678  normal  0.528339 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4064  FAD dependent oxidoreductase  28.53 
 
 		 361 aa  79.3  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.521902 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0425  putative transmembrane protein  29.38 
 
 		 355 aa  78.2  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.133341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2933  FAD dependent oxidoreductase  29.55 
 
 		 383 aa  78.2  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.677522  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2903  FAD dependent oxidoreductase  28.8 
 
 		 358 aa  77  0.0000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0779713  normal  0.848921 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0410  putative transmembrane protein  29.58 
 
 		 332 aa  76.6  0.0000000000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0126834 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0049  FAD dependent oxidoreductase  29.15 
 
 		 313 aa  76.6  0.0000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0871855  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0533  putative transmembrane protein  29.58 
 
 		 343 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.515103  normal  0.24784 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4982  FAD dependent oxidoreductase  28.21 
 
 		 368 aa  72  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2285  FAD dependent oxidoreductase  27.95 
 
 		 314 aa  72  0.00000000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41390  FAD dependent oxidoreductase  24.85 
 
 		 329 aa  71.2  0.00000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.196664  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4574  HI0933-like protein  25 
 
 		 359 aa  68.9  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0886  putative transmembrane protein  27.08 
 
 		 329 aa  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5843  FAD dependent oxidoreductase  27 
 
 		 354 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4301  FAD dependent oxidoreductase  28.84 
 
 		 339 aa  64.3  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1783  FAD dependent oxidoreductase  25.93 
 
 		 367 aa  63.5  0.000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1983  FAD dependent oxidoreductase  25.93 
 
 		 367 aa  63.2  0.000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.460512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4691  FAD dependent oxidoreductase  25.82 
 
 		 323 aa  61.6  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0114981 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1229  putative deoxyribodipyrimidine photolyase  27.25 
 
 		 324 aa  60.5  0.00000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0596771  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1655  FAD dependent oxidoreductase  22.77 
 
 		 333 aa  58.5  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3950  FAD dependent oxidoreductase  27.65 
 
 		 330 aa  52.8  0.000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1735  hypothetical protein  27.52 
 
 		 313 aa  50.4  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00347473 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4414  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  25.29 
 
 		 381 aa  49.7  0.00007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0288059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3125  FAD dependent oxidoreductase  25.69 
 
 		 360 aa  48.9  0.0001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0961162  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01726  lipoprotein, putative  23.78 
 
 		 344 aa  48.9  0.0001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4048  FAD dependent oxidoreductase  25.71 
 
 		 407 aa  48.1  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0468618 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_00981  hypothetical protein  18.13 
 
 		 371 aa  45.8  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0926997  normal  0.536427 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0204  NAD/FAD-dependent oxidoreductase-like  23.28 
 
 		 389 aa  43.5  0.005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.508635  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>