87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1991 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1991  Transcription factor TFIIB cyclin-related  100 
 
 
322 aa  657    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.204428 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1327  Transcription factor TFIIB cyclin-related  91.41 
 
 
326 aa  531  1e-150  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.662077 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0083  Transcription factor TFIIB cyclin-related  83.8 
 
 
323 aa  531  1e-150  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.404784  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1187  Transcription factor TFIIB cyclin-related  81.88 
 
 
323 aa  526  1e-148  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0221286  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0554  Transcription factor TFIIB cyclin-related  81.59 
 
 
330 aa  509  1e-143  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.175964  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2440  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  83.86 
 
 
323 aa  509  1e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3548  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  77.33 
 
 
349 aa  508  1e-143  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.261257  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2805  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  81.33 
 
 
326 aa  507  9.999999999999999e-143  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0527  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  81.06 
 
 
329 aa  506  9.999999999999999e-143  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.534958  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0836  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  86.6 
 
 
329 aa  501  1e-141  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3030  Transcription factor TFIIB cyclin-related  87.29 
 
 
327 aa  504  1e-141  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.628736  normal  0.142191 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2412  Transcription factor TFIIB cyclin-related  81.91 
 
 
324 aa  483  1e-135  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.158661 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0601  Transcription factor TFIIB cyclin-related  79.48 
 
 
324 aa  475  1e-133  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1513  Zinc finger TFIIB-type domain protein  75.08 
 
 
333 aa  431  1e-119  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0202903 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1896  Transcription factor TFIIB cyclin-related  70.51 
 
 
334 aa  422  1e-117  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2586  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  64.98 
 
 
320 aa  406  1.0000000000000001e-112  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1219  Transcription factor TFIIB cyclin-related  66.78 
 
 
321 aa  401  1e-111  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0308  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  64.67 
 
 
320 aa  404  1e-111  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2679  Transcription factor TFIIB cyclin-related  65.05 
 
 
317 aa  383  1e-105  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.616816 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1495  Transcription factor TFIIB cyclin-related  63.12 
 
 
317 aa  375  1e-103  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.924157 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0478  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  61.76 
 
 
319 aa  375  1e-103  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4179  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  62.17 
 
 
321 aa  375  1e-103  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0309  Transcription factor TFIIB cyclin-related  59.94 
 
 
333 aa  367  1e-100  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.137561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0331  transcription initiation factor IIB  56.62 
 
 
334 aa  349  3e-95  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.554084 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2311  transcription initiation factor IIB  56.29 
 
 
334 aa  347  2e-94  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.969841  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0473  transcription initiation factor IIB  55.88 
 
 
337 aa  343  2e-93  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  decreased coverage  0.00145549  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2481  transcription initiation factor IIB  55.45 
 
 
337 aa  342  5e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3037  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  56.58 
 
 
317 aa  340  1e-92  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1511  transcription initiation factor IIB  56.27 
 
 
340 aa  340  2e-92  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.939228 
 
 
-
 
NC_013747  Htur_5247  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  57.04 
 
 
318 aa  339  5e-92  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0473  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  54.67 
 
 
312 aa  328  6e-89  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0908  transcription initiation factor IIB  53.72 
 
 
339 aa  325  6e-88  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1038  transcription initiation factor IIB  53.72 
 
 
339 aa  325  6e-88  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.20206 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1056  transcription initiation factor IIB  53.72 
 
 
339 aa  325  9e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1050  transcription initiation factor IIB  53.72 
 
 
339 aa  325  9e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.18393  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1044  transcription initiation factor IIB  53.72 
 
 
339 aa  325  9e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1038  transcription initiation factor IIB  53.72 
 
 
339 aa  325  9e-88  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1394  transcription initiation factor IIB  54.3 
 
 
337 aa  323  3e-87  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1639  transcription initiation factor IIB  53.38 
 
 
339 aa  322  6e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1155  transcription initiation factor IIB  52.86 
 
 
334 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0963  transcription initiation factor IIB  54.93 
 
 
337 aa  318  1e-85  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000142091  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0265  transcription initiation factor IIB  55.71 
 
 
337 aa  316  4e-85  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0605  Zinc finger TFIIB-type domain protein  47.59 
 
 
313 aa  297  2e-79  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1424  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  45.39 
 
 
306 aa  276  5e-73  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0624  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  43.1 
 
 
302 aa  254  9e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2209  transcription initiation factor IIB  43.73 
 
 
305 aa  249  5e-65  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000356449 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0020  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  40.74 
 
 
301 aa  249  5e-65  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1976  transcription initiation factor IIB  44.3 
 
 
333 aa  248  1e-64  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.525385  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1667  transcription initiation factor IIB  45.3 
 
 
333 aa  248  1e-64  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.831794  hitchhiker  0.00863869 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0694  transcription initiation factor IIB  44.14 
 
 
333 aa  246  4e-64  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0584  transcription initiation factor IIB  43.84 
 
 
331 aa  246  4e-64  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2880  Zinc finger TFIIB-type domain protein  43.2 
 
 
308 aa  243  3e-63  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0987  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  42.16 
 
 
315 aa  242  7e-63  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.51718 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0690  transcription initiation factor IIB  44.08 
 
 
327 aa  240  2e-62  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1697  Transcription factor TFIIB cyclin-related  43.71 
 
 
307 aa  239  4e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_3140  Zinc finger TFIIB-type domain protein  44.11 
 
 
331 aa  236  4e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0797  transcription initiation factor IIB  40.42 
 
 
336 aa  234  2.0000000000000002e-60  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1340  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  41.5 
 
 
306 aa  232  6e-60  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000744308 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3420  Transcription factor TFIIB cyclin-related  41.24 
 
 
309 aa  230  3e-59  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0072  Transcription factor TFIIB cyclin-related  43.6 
 
 
330 aa  221  1.9999999999999999e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.96574 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1047  Transcription factor TFIIB cyclin-related  41.26 
 
 
286 aa  220  3e-56  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.235926 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0317  Transcription factor TFIIB cyclin-related protein  42.28 
 
 
299 aa  218  1e-55  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2168  Transcription factor TFIIB cyclin-related  41.26 
 
 
290 aa  216  2.9999999999999998e-55  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0013  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  36.86 
 
 
306 aa  201  9.999999999999999e-51  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2197  Zinc finger TFIIB-type domain protein  41.89 
 
 
328 aa  199  3.9999999999999996e-50  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0979  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  36.3 
 
 
303 aa  187  2e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.290745 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1341  transcription factor TFIIB cyclin-related protein  34.19 
 
 
309 aa  183  4.0000000000000006e-45  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00144116 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0517  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  35.57 
 
 
318 aa  180  2.9999999999999997e-44  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1921  Zinc finger TFIIB-type domain protein  33.88 
 
 
293 aa  169  7e-41  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.235505  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1733  transcription initiation factor IIB  32.77 
 
 
294 aa  159  4e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.278852  normal  0.98163 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04928  transcription initiation protein (AFU_orthologue; AFUA_3G10620)  30.28 
 
 
351 aa  132  1.0000000000000001e-29  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.381689 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43151  predicted protein  28.62 
 
 
390 aa  122  9e-27  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_85155  predicted protein  27.53 
 
 
350 aa  121  9.999999999999999e-27  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0573  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  30.92 
 
 
298 aa  103  3e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.569731  hitchhiker  0.00347492 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1632  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  26.09 
 
 
286 aa  102  1e-20  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.178944 
 
 
-
 
NC_006691  CNF01950  transcription initiation factor iib, putative  25.25 
 
 
447 aa  99.4  8e-20  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.107157  n/a   
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_30925  predicted protein  24.32 
 
 
601 aa  87.4  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.338329  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_40669  Transcription factor IIIB 70 kDa subunit (TFIIIB) (B-related factor) (BRF)  26.26 
 
 
570 aa  85.9  8e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.644489  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1734  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  29.55 
 
 
298 aa  84.7  0.000000000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.610707 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1743  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  28.57 
 
 
298 aa  84  0.000000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.744593  hitchhiker  0.000774381 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41529  predicted protein  24.5 
 
 
576 aa  78.2  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.137974 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_36784  predicted protein  24.5 
 
 
576 aa  78.2  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00059248  normal  0.0129799 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1563  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  31.02 
 
 
298 aa  75.5  0.000000000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0374  zinc finger TFIIB-type domain-containing protein  26.53 
 
 
279 aa  72  0.00000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03116  transcription factor TFIIIB complex subunit Brf1, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G12730)  28.24 
 
 
713 aa  63.9  0.000000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0572721  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_94516  predicted protein  21.66 
 
 
233 aa  51.2  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0405528  decreased coverage  0.00937964 
 
 
-
 
NC_006691  CNF00660  transcription factor iiib 70 kd subunit, putative  23.68 
 
 
691 aa  51.2  0.00003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>