237 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1955 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1955  hypothetical protein  100 
 
 		 405 aa  816    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2206  FAD dependent oxidoreductase  39.52 
 
 		 410 aa  251  1e-65  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.685598 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1007  FAD dependent oxidoreductase  40.72 
 
 		 409 aa  233  6e-60  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3081  FAD dependent oxidoreductase  35.29 
 
 		 413 aa  221  9.999999999999999e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0926  FAD dependent oxidoreductase  37.56 
 
 		 411 aa  219  5e-56  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.609885  hitchhiker  0.00113671 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2507  FAD dependent oxidoreductase  36.34 
 
 		 414 aa  219  6e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.206191  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3091  FAD dependent oxidoreductase  35.63 
 
 		 410 aa  218  2e-55  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.275239  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0631  geranylgeranyl reductase  27.65 
 
 		 402 aa  139  1e-31  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0431  hypothetical protein  30.97 
 
 		 422 aa  125  1e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.446535  normal  0.169558 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1073  geranylgeranyl reductase  28.82 
 
 		 452 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  26.45 
 
 		 408 aa  110  5e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4688  monooxygenase FAD-binding  25.99 
 
 		 417 aa  109  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1347  geranylgeranyl reductase  28.98 
 
 		 453 aa  109  1e-22  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.0129504  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0938  geranylgeranyl reductase  28.08 
 
 		 453 aa  101  3e-20  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.129052 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  24.45 
 
 		 406 aa  96.7  6e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  29.96 
 
 		 399 aa  95.1  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4420  geranylgeranyl reductase  30.58 
 
 		 418 aa  94.7  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  25.89 
 
 		 390 aa  92.8  1e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  27.88 
 
 		 391 aa  92.4  1e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0811  geranylgeranyl reductase  27.1 
 
 		 453 aa  92.4  1e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0648  geranylgeranyl reductase  29.94 
 
 		 430 aa  91.7  2e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0626765  normal  0.0232794 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  29.67 
 
 		 398 aa  91.7  2e-17  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0668  geranylgeranyl reductase  28.42 
 
 		 458 aa  90.9  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.159483  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1696  geranylgeranyl reductase  27.06 
 
 		 459 aa  90.1  6e-17  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  25.8 
 
 		 396 aa  89.7  7e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  25.24 
 
 		 390 aa  89.4  1e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0431  PUA domain-containing protein  27.52 
 
 		 397 aa  89  1e-16  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3422  geranylgeranyl reductase  25.89 
 
 		 407 aa  88.6  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.351163 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  26.8 
 
 		 387 aa  88.6  2e-16  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0583  geranylgeranyl reductase  29.36 
 
 		 425 aa  87.8  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  26.89 
 
 		 398 aa  84.7  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1514  geranylgeranyl reductase  25.99 
 
 		 485 aa  83.2  0.000000000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00785047 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1429  hypothetical protein  25.94 
 
 		 395 aa  82  0.00000000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.0716636 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  24.36 
 
 		 390 aa  80.9  0.00000000000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  29.44 
 
 		 402 aa  80.5  0.00000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  24.58 
 
 		 390 aa  79.7  0.00000000000008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  24.2 
 
 		 395 aa  79.7  0.00000000000009  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15361  NAD binding site  26.25 
 
 		 405 aa  79.7  0.00000000000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.298365 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08531  dehydrogenases (flavoproteins)  24.71 
 
 		 398 aa  79.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.741714  hitchhiker  0.00186449 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  25.28 
 
 		 396 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4066  geranylgeranyl reductase  29.79 
 
 		 423 aa  77.4  0.0000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.449431  normal  0.299227 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0661  geranylgeranyl reductase  22.58 
 
 		 375 aa  76.3  0.0000000000008  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4464  geranylgeranyl reductase  29.2 
 
 		 423 aa  73.9  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.152921  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  27.17 
 
 		 423 aa  73.9  0.000000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  29.01 
 
 		 445 aa  73.6  0.000000000007  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4291  geranylgeranyl reductase  25.56 
 
 		 393 aa  72.8  0.00000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.464527 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1070  hypothetical protein  31.12 
 
 		 387 aa  71.6  0.00000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1392  excinuclease ABC subunit C  24.63 
 
 		 382 aa  72  0.00000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.0201698  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1090  bacteriochlorophyll synthase 43 kDa subunit  25.14 
 
 		 385 aa  70.5  0.00000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  27.2 
 
 		 424 aa  70.5  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0973  geranylgeranyl reductase  27.73 
 
 		 430 aa  70.5  0.00000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  24.23 
 
 		 387 aa  70.1  0.00000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3230  geranylgeranyl reductase  28.34 
 
 		 431 aa  69.7  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716202 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  24.26 
 
 		 391 aa  69.7  0.00000000009  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07370  geranylgeranyl reductase family protein  29.52 
 
 		 431 aa  69.3  0.0000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0284516 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1087  electron transfer flavoprotein  23.35 
 
 		 384 aa  68.9  0.0000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.384904  normal  0.110599 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0390  monooxygenase FAD-binding  26.65 
 
 		 425 aa  68.6  0.0000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0398453 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1273  geranylgeranyl reductase  27.03 
 
 		 457 aa  68.6  0.0000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4559  geranylgeranyl reductase  26.67 
 
 		 419 aa  68.2  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0939  FAD dependent oxidoreductase  23.85 
 
 		 385 aa  67  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0379493  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  27.78 
 
 		 435 aa  66.6  0.0000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3116  tryptophan halogenase  25.65 
 
 		 417 aa  66.2  0.000000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.406166  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  23.89 
 
 		 376 aa  65.5  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2055  geranylgeranyl reductase  25.07 
 
 		 393 aa  65.1  0.000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1343  geranylgeranyl reductase  25 
 
 		 411 aa  65.5  0.000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.263408 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0472  geranylgeranyl reductase  21.91 
 
 		 385 aa  64.7  0.000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.730289  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2388  flavoprotein-containing dehydrogenase  24.66 
 
 		 414 aa  64.7  0.000000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0523144  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0537  geranylgeranyl reductase  31.58 
 
 		 434 aa  64.3  0.000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.118976 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6683  geranylgeranyl reductase  28.95 
 
 		 426 aa  63.9  0.000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00871957  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0166  geranylgeranyl reductase  22.71 
 
 		 453 aa  63.5  0.000000006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0365  geranylgeranyl reductase  21.59 
 
 		 386 aa  63.5  0.000000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.230405  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2279  geranylgeranyl reductase  28.82 
 
 		 413 aa  63.5  0.000000007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05841  NAD binding site  23.66 
 
 		 377 aa  63.2  0.000000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1413  geranylgeranyl reductase  25.5 
 
 		 456 aa  63.2  0.000000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.145276  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  25.74 
 
 		 452 aa  62.4  0.00000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  25.74 
 
 		 405 aa  62  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  25.74 
 
 		 405 aa  61.6  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000608264  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1447  geranylgeranyl reductase  20.41 
 
 		 392 aa  61.6  0.00000003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.134641  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0697  FAD dependent oxidoreductase  24.2 
 
 		 393 aa  61.6  0.00000003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  25.07 
 
 		 468 aa  61.2  0.00000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0681  geranylgeranyl reductase  21.91 
 
 		 453 aa  60.8  0.00000005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.00166018  hitchhiker  0.00000684168 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5052  geranylgeranyl reductase  29.73 
 
 		 434 aa  60.5  0.00000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3528  geranylgeranyl reductase  26.86 
 
 		 394 aa  60.5  0.00000005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.673829 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1807  geranylgeranyl reductase  25.59 
 
 		 393 aa  60.1  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.622254  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1826  geranylgeranyl reductase  25.59 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.253785  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1873  geranylgeranyl reductase  25.59 
 
 		 393 aa  60.5  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.700646  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2969  tryptophan halogenase  27.75 
 
 		 455 aa  60.1  0.00000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.339747  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1644  FAD dependent oxidoreductase  22.84 
 
 		 378 aa  60.1  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00782092 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0387  geranylgeranyl reductase  27.56 
 
 		 403 aa  59.7  0.00000009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0771  hypothetical protein  23.28 
 
 		 379 aa  59.3  0.0000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1494  oxidoreductase, FAD-binding, putative  24.7 
 
 		 455 aa  59.3  0.0000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0467837  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4197  monooxygenase, FAD-binding:FAD dependent oxidoreductase:tryptophan halogenase  20.92 
 
 		 444 aa  58.9  0.0000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.107815 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  25.2 
 
 		 455 aa  59.3  0.0000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  22.51 
 
 		 399 aa  59.3  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0075  hypothetical protein  22.87 
 
 		 404 aa  58.5  0.0000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  24.4 
 
 		 380 aa  58.5  0.0000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05461  NAD binding site  22.6 
 
 		 377 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  24.6 
 
 		 446 aa  58.5  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  26.09 
 
 		 406 aa  58.5  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0468  geranylgeranyl reductase  27.39 
 
 		 431 aa  58.2  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>