276 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1876 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1876  cation transporter  100 
 
 
520 aa  1027    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.265158 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2082  cation transporter  66.67 
 
 
514 aa  651    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1184  cation transporter  64.74 
 
 
512 aa  624  1e-178  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.543653  hitchhiker  0.000000321699 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3134  cation transporter  54.39 
 
 
510 aa  561  1e-158  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1208  cation transporter  55.79 
 
 
512 aa  548  1e-155  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.432956  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0698  cation transporter  56.09 
 
 
505 aa  549  1e-155  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1412  cation transporter  52.5 
 
 
516 aa  500  1e-140  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1730  cation transporter  44.96 
 
 
509 aa  430  1e-119  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1185  cation transporter  43.95 
 
 
502 aa  410  1e-113  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00000630162 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1309  K+ transporter Trk  41.49 
 
 
479 aa  387  1e-106  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3429  sodium transport protein  41.62 
 
 
483 aa  347  2e-94  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.000905163  normal  0.144349 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3474  cation transporter  41.65 
 
 
514 aa  345  1e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0877614  normal  0.0193815 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1063  K+ transporter Trk  37.43 
 
 
478 aa  342  8e-93  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3423  trk system potassium uptake protein  42.04 
 
 
476 aa  341  2e-92  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.386129 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2454  potassium uptake protein, TrkH family  39.08 
 
 
481 aa  318  2e-85  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.172689  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2912  TrkH family potassium uptake protein  38.82 
 
 
479 aa  315  9.999999999999999e-85  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000731748  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0518  cation transporter  34 
 
 
524 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.608027  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10610  cation transporter  36.63 
 
 
477 aa  300  5e-80  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0386774  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3217  TrkH family potassium uptake protein  37.81 
 
 
482 aa  296  8e-79  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2029  K+ transporter Trk  38.6 
 
 
481 aa  290  4e-77  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00911384  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0735  potassium uptake protein, TrkH family  38.7 
 
 
494 aa  289  7e-77  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.832198  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3184  cation transporter  33.2 
 
 
483 aa  285  2.0000000000000002e-75  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0747652  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0768  cation transporter  38.51 
 
 
473 aa  284  3.0000000000000004e-75  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.369941 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1468  cation transporter  38.51 
 
 
483 aa  284  3.0000000000000004e-75  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0265  cation transporter  35.22 
 
 
466 aa  280  4e-74  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0028  cation transporter  37.31 
 
 
481 aa  277  3e-73  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0029  Trk system potassium uptake protein, putative  36.91 
 
 
481 aa  275  2.0000000000000002e-72  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.725548  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0088  Trk system potassium uptake protein TrkH  36.69 
 
 
480 aa  273  5.000000000000001e-72  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1061  cation transporter  37.43 
 
 
494 aa  271  2e-71  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.316379  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_28  cation transport protein, Trk system  36.61 
 
 
481 aa  270  4e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12238  putative potassium uptake protein  36.8 
 
 
498 aa  268  1e-70  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.590421  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1969  potassium uptake protein, TrkH family  38.46 
 
 
482 aa  266  5e-70  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.938293  normal  0.091936 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0913  K+ transporter trk  32.65 
 
 
482 aa  263  4e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00018  Trk system potassium uptake protein TrkH  34.6 
 
 
483 aa  260  5.0000000000000005e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3436  cation transporter  38.39 
 
 
478 aa  258  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0016  potassium uptake protein TrkH  35.87 
 
 
483 aa  258  3e-67  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0202  potassium uptake protein, TrkH family  37.45 
 
 
483 aa  256  6e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0485488  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2905  cation transporter  34.14 
 
 
485 aa  254  3e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.313942  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3260  cation transporter  35.88 
 
 
488 aa  248  1e-64  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.208251  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1060  cation transporter  34.56 
 
 
495 aa  248  2e-64  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3911  cation transporter  39.36 
 
 
488 aa  247  3e-64  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.874012 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4071  cation transporter  36.67 
 
 
485 aa  247  4e-64  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000478231 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1398  cation transporter  31.97 
 
 
485 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.00000000271372  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1370  cation transporter  34.23 
 
 
479 aa  244  3e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00804508  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0013  TrkH family potassium uptake protein  32.62 
 
 
482 aa  244  3e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.0268571 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0242  K+ transporter Trk  37.84 
 
 
483 aa  244  3.9999999999999997e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4543  cation transporter  33.85 
 
 
498 aa  243  5e-63  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0654  TrkH family potassium uptake protein  34.69 
 
 
481 aa  243  7.999999999999999e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.77805  normal  0.145227 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2041  TrkH family potassium uptake protein  32.75 
 
 
485 aa  241  2e-62  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.505265  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0107  cation transporter  31.07 
 
 
485 aa  241  2.9999999999999997e-62  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2906  potassium uptake protein, TrkH family  33.66 
 
 
486 aa  240  4e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000847661  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3013  cation transporter  33.54 
 
 
484 aa  240  4e-62  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.301904 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0021  trk system potassium uptake membrane protein TrkH  34.18 
 
 
488 aa  239  5.999999999999999e-62  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.432233  normal  0.139805 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5998  cation transporter  34.63 
 
 
488 aa  239  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00443617 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0017  potassium uptake protein TrkH  33.2 
 
 
482 aa  238  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000733585  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2266  potassium uptake protein, TrkH family  37.4 
 
 
484 aa  238  2e-61  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.644044  normal  0.0494123 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0015  Trk system potassium uptake protein TrkH  35.63 
 
 
483 aa  238  3e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3505  cation transporter  34.26 
 
 
485 aa  236  6e-61  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2219  potassium uptake protein TrkH  31.91 
 
 
487 aa  236  7e-61  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000665433 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0186  K+ transporter Trk  35.4 
 
 
483 aa  236  1.0000000000000001e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.568155  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0018  K+ transporter Trk  33.78 
 
 
485 aa  234  2.0000000000000002e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5095  cation transporter  33.95 
 
 
491 aa  231  2e-59  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1859  cation transporter  32.31 
 
 
482 aa  232  2e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00547678 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0197  potassium uptake protein, TrkH family protein  34.54 
 
 
488 aa  231  2e-59  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.846232  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0087  cation transporter  29.26 
 
 
485 aa  231  3e-59  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01339  potassium transporter subunit  32.44 
 
 
485 aa  230  5e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.238746  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2280  potassium uptake protein, TrkH family  32.36 
 
 
474 aa  228  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4081  cation transporter  34.06 
 
 
491 aa  228  2e-58  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0039  potassium uptake protein TrkH  30.77 
 
 
480 aa  227  3e-58  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.169188 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0026  TrkH family potassium uptake protein  32.26 
 
 
485 aa  224  2e-57  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0293301  normal  0.0416133 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3617  potassium uptake protein, TrkH family  31.66 
 
 
486 aa  224  2e-57  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.723793  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0016  potassium uptake protein, TrkH family protein  32.82 
 
 
485 aa  225  2e-57  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.339355  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2406  Trk system potassium uptake protein  32.05 
 
 
482 aa  224  3e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0517889  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0021  TrkH family potassium uptake protein  33.27 
 
 
485 aa  223  7e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0490  cation transporter  32.55 
 
 
485 aa  222  9.999999999999999e-57  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1801  potassium uptake protein TrkH  29.94 
 
 
484 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.641993  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1935  cation transporter  31.03 
 
 
482 aa  221  1.9999999999999999e-56  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.27929 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0020  TrkH family potassium uptake protein  31.59 
 
 
480 aa  222  1.9999999999999999e-56  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3593  K+ transporter Trk  29.94 
 
 
484 aa  221  3e-56  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0183365  normal  0.751025 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002053  potassium uptake protein TrkH  31.33 
 
 
481 aa  221  3e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00395  K+ transport system protein  31.33 
 
 
481 aa  221  3.9999999999999997e-56  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0028  potassium uptake protein TrkH  31.01 
 
 
480 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3796  TrkH family potassium uptake protein  30.82 
 
 
484 aa  219  1e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000000285199 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0035  TrkH family potassium uptake protein  31.83 
 
 
485 aa  219  1e-55  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.161257  normal  0.16596 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4507  TrkH family potassium uptake protein  29.72 
 
 
484 aa  218  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2477  potassium uptake protein TrkH  31.21 
 
 
481 aa  218  2e-55  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0536  cation transporter  30.34 
 
 
482 aa  218  2e-55  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.306165  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3898  potassium transporter  33.01 
 
 
483 aa  216  5.9999999999999996e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000274395  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0020  potassium uptake protein, TrkH family protein  30.93 
 
 
480 aa  216  7e-55  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.76809  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0022  TrkH family potassium uptake protein  31.92 
 
 
485 aa  216  9e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00747974  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0016  TrkH family potassium uptake protein  35.65 
 
 
483 aa  216  9e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.81784  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0024  TrkH family potassium uptake protein  31.54 
 
 
485 aa  216  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.981015  normal  0.0103181 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1404  TrkH family potassium uptake protein  30.12 
 
 
484 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0143112  normal  0.607881 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3744  potassium transporter  33.07 
 
 
483 aa  214  2.9999999999999995e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.000338344  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1570  potassium uptake system protein  29.45 
 
 
487 aa  214  2.9999999999999995e-54  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.559966  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4013  cation transporter  29.46 
 
 
484 aa  214  2.9999999999999995e-54  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.398378  hitchhiker  0.000106015 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1811  TrkH family potassium uptake protein  31.16 
 
 
486 aa  214  3.9999999999999995e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000393317  unclonable  0.0000000582873 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0024  potassium uptake protein TrkH  32.61 
 
 
486 aa  211  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1479  K+ transporter Trk  28.85 
 
 
484 aa  211  2e-53  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0756741  normal  0.260835 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0265  potassium transporter  31.43 
 
 
483 aa  211  2e-53  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00329538  normal  0.0155167 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>