35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1833 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1833  ribosomal protein L22  100 
 
 		 153 aa  315  1e-85  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.271117 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2297  50S ribosomal protein L22P  81.7 
 
 		 156 aa  265  1e-70  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0215  ribosomal protein L22  80.85 
 
 		 165 aa  241  3e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2223  ribosomal protein L22  75.71 
 
 		 159 aa  226  7e-59  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2444  50S ribosomal protein L22P  63.33 
 
 		 154 aa  193  6e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1388  50S ribosomal protein L22P  46.62 
 
 		 153 aa  139  9.999999999999999e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0447  50S ribosomal protein L22P  42.67 
 
 		 156 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0102501  normal  0.42812 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0105  50S ribosomal protein L22P  45.64 
 
 		 151 aa  128  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.379943  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1723  ribosomal protein L22  42.28 
 
 		 152 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  decreased coverage  0.00000443469  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2248  50S ribosomal protein L22P  42.47 
 
 		 154 aa  126  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.00000896212  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0175  50S ribosomal protein L22P  41.22 
 
 		 153 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  hitchhiker  0.000281865  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1270  50S ribosomal protein L22P  41.22 
 
 		 153 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  hitchhiker  0.000000000869512  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0648  50S ribosomal protein L22P  41.22 
 
 		 153 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  hitchhiker  0.00000866939  hitchhiker  0.000275224 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0714  50S ribosomal protein L22P  41.89 
 
 		 153 aa  125  1.0000000000000001e-28  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00766872  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0537  50S ribosomal protein L22P  41.33 
 
 		 154 aa  122  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.34854  normal  0.63908 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0569  50S ribosomal protein L22P  42.18 
 
 		 153 aa  120  8e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0413889  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0006  50S ribosomal protein L22P  42.95 
 
 		 151 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00000000000018702  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0556  50S ribosomal protein L22P  38.31 
 
 		 168 aa  110  5e-24  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0086  50S ribosomal protein L22P  41.72 
 
 		 157 aa  107  5e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.438509 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1773  ribosomal protein L22  39.6 
 
 		 157 aa  107  9.000000000000001e-23  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0770  50S ribosomal protein L22P  36.67 
 
 		 185 aa  102  2e-21  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0748  50S ribosomal protein L22P  37.09 
 
 		 185 aa  101  3e-21  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1732  50S ribosomal protein L22P  37.33 
 
 		 198 aa  101  4e-21  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0805  50S ribosomal protein L22  34.72 
 
 		 152 aa  99.8  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.589501 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1516  ribosomal protein L22  38.51 
 
 		 151 aa  90.9  6e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  unclonable  9.68145e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0096  50S ribosomal protein L22P  33.11 
 
 		 156 aa  87  7e-17  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000000729368  unclonable  0.000000429528 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00776  60S ribosomal protein L17 (AFU_orthologue; AFUA_1G14410)  33.83 
 
 		 184 aa  86.7  1e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.844288  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1930  50S ribosomal protein L22P  32.43 
 
 		 185 aa  85.1  3e-16  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.70908  normal  1 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32234  Ribosomal protein L17, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  34.48 
 
 		 183 aa  84.3  5e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.333156 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29177  predicted protein  32.69 
 
 		 185 aa  82.4  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.669765  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_89240  ribosomal protein L17B  30.67 
 
 		 186 aa  82.4  0.000000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0489  ribosomal protein L22  39.53 
 
 		 127 aa  82  0.000000000000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006683  CNN01720  60s ribosomal protein l17, putative  29.58 
 
 		 182 aa  68.9  0.00000000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0853  50S ribosomal protein L22  29.27 
 
 		 110 aa  41.2  0.006  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0696  50S ribosomal protein L22  26.28 
 
 		 119 aa  40.8  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00931457  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>