219 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1828 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1828  50S ribosomal protein L3P  100 
 
 		 338 aa  685    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.752407 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2292  50S ribosomal protein L3P  83.73 
 
 		 338 aa  590  1e-167  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2218  ribosomal protein L3  78.17 
 
 		 339 aa  553  1e-156  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2449  50S ribosomal protein L3P  78.11 
 
 		 338 aa  550  1e-155  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0210  ribosomal protein L3  78.24 
 
 		 340 aa  540  9.999999999999999e-153  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2253  50S ribosomal protein L3P  51.62 
 
 		 337 aa  367  1e-100  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  unclonable  0.0000000000233811  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0442  50S ribosomal protein L3P  51.03 
 
 		 337 aa  365  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00631361  normal  0.320791 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0532  50S ribosomal protein L3P  48.38 
 
 		 337 aa  348  5e-95  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.576221 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0564  50S ribosomal protein L3P  53.39 
 
 		 337 aa  335  5e-91  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.415651  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0110  50S ribosomal protein L3P  46.9 
 
 		 337 aa  333  3e-90  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0001  50S ribosomal protein L3P  47.79 
 
 		 337 aa  332  6e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0115454  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0081  50S ribosomal protein L3P  49.4 
 
 		 333 aa  322  6e-87  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.123311 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1728  50S ribosomal protein L3P  49.85 
 
 		 335 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0791  50S ribosomal protein L3P  46.9 
 
 		 334 aa  301  1e-80  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.106931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0857  50S ribosomal protein L3P  46.61 
 
 		 334 aa  299  5e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.603922  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1127  50S ribosomal protein L3P  46.61 
 
 		 334 aa  298  8e-80  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0033  50S ribosomal protein L3P  46.61 
 
 		 334 aa  298  1e-79  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.555828  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1521  ribosomal protein L3  45.11 
 
 		 340 aa  291  1e-77  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000186989  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0807  50S ribosomal protein L3P  44.64 
 
 		 333 aa  283  3.0000000000000004e-75  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1796  50S ribosomal protein L3P  42.6 
 
 		 342 aa  239  5.999999999999999e-62  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.483338  normal  0.601736 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1583  50S ribosomal protein L3P  43.66 
 
 		 338 aa  236  5.0000000000000005e-61  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0230  50S ribosomal protein L3P  41.59 
 
 		 334 aa  234  2.0000000000000002e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0813  50S ribosomal protein L3P  41.72 
 
 		 338 aa  226  5.0000000000000005e-58  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0317  50S ribosomal protein L3P  41.04 
 
 		 347 aa  220  1.9999999999999999e-56  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2046  50S ribosomal protein L3P  40.65 
 
 		 338 aa  219  6e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.998273 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1778  ribosomal protein L3  36.89 
 
 		 351 aa  202  7e-51  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.890936  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0091  50S ribosomal protein L3P  36.92 
 
 		 341 aa  200  3e-50  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.000000432349  hitchhiker  0.00000658147 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0809  50S ribosomal protein L3P  33.96 
 
 		 331 aa  193  3e-48  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.5331 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06202  60S ribosomal protein L3 [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV31]  35.52 
 
 		 392 aa  189  5e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.123441  normal  0.683069 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_13361  predicted protein  33.33 
 
 		 389 aa  179  5.999999999999999e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_23838  Ribosomal protein L3, component of cytosolic 80S ribosome and 60S large subunit  30.96 
 
 		 386 aa  179  8e-44  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02240  large subunit ribosomal protein L3, putative  32.88 
 
 		 390 aa  178  9e-44  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_88844  60S large subunit ribosomal protein L3.e  33.7 
 
 		 389 aa  172  9e-42  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  hitchhiker  0.0000473174 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0104  50S ribosomal protein L3  25.98 
 
 		 210 aa  62  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000119433  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl123  50S ribosomal protein L3  28.26 
 
 		 238 aa  61.2  0.00000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  9.499549999999999e-37  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0196  50S ribosomal protein L3  28.47 
 
 		 228 aa  60.5  0.00000004  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0113604  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0255  50S ribosomal protein L3  28.79 
 
 		 216 aa  60.1  0.00000006  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0110  50S ribosomal protein L3  31.3 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.000000000528056  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0110  50S ribosomal protein L3  31.3 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.00000000000986131  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0106  50S ribosomal protein L3  31.3 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  2.6707699999999998e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0104  50S ribosomal protein L3  31.3 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000168091  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0141  50S ribosomal protein L3  31.3 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000551418  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0122  50S ribosomal protein L3  31.3 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  1.0599700000000001e-61 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0131  50S ribosomal protein L3  31.3 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000141135  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0110  50S ribosomal protein L3  31.3 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000246604  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0422  50S ribosomal protein L3  29.77 
 
 		 209 aa  59.3  0.00000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000195061  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0105  50S ribosomal protein L3  31.3 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.0000000775669  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5195  50S ribosomal protein L3  31.3 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.000000000842867  unclonable  2.19314e-25 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6721  50S ribosomal protein L3  31.3 
 
 		 243 aa  58.9  0.0000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0696  50S ribosomal protein L3  28.35 
 
 		 223 aa  57.8  0.0000002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.372092  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1707  50S ribosomal protein L3  29.1 
 
 		 213 aa  58.5  0.0000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  decreased coverage  0.00287886  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01170  50S ribosomal protein L3  26.71 
 
 		 211 aa  58.2  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000794381  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3435  50S ribosomal protein L3  26.15 
 
 		 218 aa  57.4  0.0000003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1867  50S ribosomal protein L3  30.95 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0222976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1555  ribosomal protein L3  30.52 
 
 		 210 aa  57  0.0000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00791107  normal  0.982603 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3667  50S ribosomal protein L3  29.37 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.000000000330884  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1907  50S ribosomal protein L3  28.24 
 
 		 208 aa  56.6  0.0000006  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000032853  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0562  50S ribosomal protein L3  25.98 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0111  50S ribosomal protein L3  24.01 
 
 		 211 aa  55.8  0.0000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000151121  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1161  ribosomal protein L3  29.5 
 
 		 206 aa  55.8  0.000001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000266904  hitchhiker  0.000000567921 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0421  50S ribosomal protein L3P  25.09 
 
 		 212 aa  55.5  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00399818  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4321  ribosomal protein L3  30 
 
 		 216 aa  54.7  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2711  50S ribosomal protein L3  28.24 
 
 		 211 aa  54.7  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00000399657  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0107  50S ribosomal protein L3  29.84 
 
 		 213 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0587  ribosomal protein L3  30.61 
 
 		 219 aa  55.1  0.000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.295272  normal  0.46094 
 
 
-
 
NC_009373  OSTLU_6632  Putative mitochondrial ribosomal protein L3  32.26 
 
 		 211 aa  55.1  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0234782  hitchhiker  0.000000645255 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1745  50S ribosomal protein L3  29.73 
 
 		 210 aa  54.3  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000981122  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10715  50S ribosomal protein L3  27.94 
 
 		 217 aa  53.9  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.249834 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2857  50S ribosomal protein L3  27.92 
 
 		 210 aa  53.9  0.000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.918611  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0226  ribosomal protein L3  26.07 
 
 		 216 aa  53.9  0.000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0327  50S ribosomal protein L3  30.16 
 
 		 210 aa  53.5  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.322183  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2975  50S ribosomal protein L3  29.93 
 
 		 216 aa  53.9  0.000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.454423  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0497  50S ribosomal protein L3  30.16 
 
 		 210 aa  53.5  0.000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.443535  hitchhiker  0.00000000471094 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0058  50S ribosomal protein L3  27.54 
 
 		 208 aa  53.5  0.000005  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00491271  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0981  ribosomal protein L3  28.24 
 
 		 215 aa  53.1  0.000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.843676  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0701  50S ribosomal protein L3  24.47 
 
 		 210 aa  52.8  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000481863  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2646  50S ribosomal protein L3  34.09 
 
 		 216 aa  52.8  0.000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.334348  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1249  50S ribosomal protein L3  32.12 
 
 		 251 aa  52  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2714  50S ribosomal protein L3  28.03 
 
 		 209 aa  52  0.00001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00000231855  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0595  50S ribosomal protein L3P  31.16 
 
 		 247 aa  52  0.00001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  unclonable  0.000000158145  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0719  ribosomal protein L3  25.45 
 
 		 212 aa  52  0.00001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000525785  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5049  50S ribosomal protein L3  25.74 
 
 		 218 aa  52.4  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.399218 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2659  50S ribosomal protein L3  29.55 
 
 		 219 aa  52  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17160  50S ribosomal protein L3  29.25 
 
 		 216 aa  51.6  0.00002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.283771  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0758  50S ribosomal protein L3  28.57 
 
 		 212 aa  51.6  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000233446  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0582  50S ribosomal protein L3  31.06 
 
 		 235 aa  51.6  0.00002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1013  50S ribosomal protein L3  27.54 
 
 		 217 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2399  50S ribosomal protein L3  27.27 
 
 		 209 aa  51.6  0.00002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000824684  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1030  50S ribosomal protein L3  27.54 
 
 		 217 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.676061 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1305  50S ribosomal protein L3  25.74 
 
 		 218 aa  52  0.00002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.207115  normal  0.106977 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1040  50S ribosomal protein L3  27.54 
 
 		 217 aa  51.6  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1524  50S ribosomal protein L3  29.01 
 
 		 209 aa  50.8  0.00003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.593746  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1394  50S ribosomal protein L3  31.25 
 
 		 207 aa  50.8  0.00003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000462367  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1292  50S ribosomal protein L3  31.25 
 
 		 207 aa  50.8  0.00003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000263563  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00445  50S ribosomal protein L3  22.97 
 
 		 212 aa  50.8  0.00003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.000559916  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0304  ribosomal protein L3  28.47 
 
 		 211 aa  50.4  0.00004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.234109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2318  50S ribosomal protein L3  27.94 
 
 		 220 aa  50.4  0.00004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000223614  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23810  LSU ribosomal protein L3P  32.54 
 
 		 226 aa  50.8  0.00004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3338  50S ribosomal protein L3  29.1 
 
 		 212 aa  50.4  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000254045  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1614  50S ribosomal protein L3  27.22 
 
 		 256 aa  50.1  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.236212 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>