More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_1733 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013202  Hmuk_1733  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  100 
 
 		 299 aa  593  1e-168  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.17014 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2322  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  66.45 
 
 		 295 aa  382  1e-105  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.713223  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1812  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  63.58 
 
 		 343 aa  373  1e-102  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.572421  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2256  pseudouridylate synthase TruB domain protein  64.33 
 
 		 304 aa  367  1e-100  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0271  pseudouridylate synthase TruB domain protein  62.34 
 
 		 314 aa  367  1e-100  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1702  putative rRNA pseudouridine synthase  45.03 
 
 		 321 aa  244  9.999999999999999e-64  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.438885  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1494  pseudouridylate synthase TruB domain protein  44.8 
 
 		 286 aa  242  5e-63  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0988  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  43.19 
 
 		 359 aa  234  1.0000000000000001e-60  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0461  putative rRNA pseudouridine synthase  42.38 
 
 		 338 aa  231  9e-60  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0082  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  44.04 
 
 		 338 aa  226  3e-58  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1222  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  43.84 
 
 		 331 aa  224  1e-57  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0985  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  41.53 
 
 		 333 aa  224  2e-57  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0128242  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0961  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  41.53 
 
 		 333 aa  223  2e-57  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1720  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  41.53 
 
 		 333 aa  224  2e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0028  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  41.2 
 
 		 331 aa  221  9e-57  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000488795  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0155  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  38.77 
 
 		 335 aa  204  1e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0406  pseudouridylate synthase subunit TruB  38.13 
 
 		 332 aa  200  1.9999999999999998e-50  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.189117 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2268  pseudouridylate synthase  43.03 
 
 		 310 aa  198  1.0000000000000001e-49  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.570966  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0089  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  37.21 
 
 		 331 aa  196  4.0000000000000005e-49  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08851  Centromere/microtubule-binding protein CBF5 (Centromere-binding factor 5)(Small nucleolar RNP protein CBF5)(H/ACA snoRNP protein CBF5)(rRNA pseudouridine synthase) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:O43100]  36.16 
 
 		 481 aa  193  3e-48  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.842396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2750  pseudouridylate synthase TruB domain protein  43.17 
 
 		 299 aa  192  6e-48  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0080  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  35.55 
 
 		 331 aa  191  1e-47  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.178289 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0054  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  35.88 
 
 		 333 aa  190  2e-47  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1128  H/ACA RNA-protein complex component Cbf5p  35.88 
 
 		 328 aa  189  5.999999999999999e-47  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00000787218 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_64832  nucleolar pseuduridine synthase and putative microtubule binding protein  35.29 
 
 		 475 aa  187  3e-46  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006686  CND02940  centromere/microtubule binding protein cbf5, putative  35.29 
 
 		 503 aa  184  1.0000000000000001e-45  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.701159  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0513  pseudouridylate synthase  42.56 
 
 		 322 aa  184  1.0000000000000001e-45  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0072  hypothetical protein  37.78 
 
 		 282 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00484212 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0538  pseudouridylate synthase  42.26 
 
 		 302 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0902248  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_20773  predicted protein  36.48 
 
 		 484 aa  182  6e-45  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1369  pseudouridylate synthase TruB domain protein  38.56 
 
 		 251 aa  168  1e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.862548  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0057  PUA domain-containing protein  39.25 
 
 		 233 aa  160  2e-38  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.510728 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_30197  predicted protein  37.32 
 
 		 411 aa  155  9e-37  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1954  tRNA pseudouridine synthase B  32.37 
 
 		 310 aa  127  3e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4710  tRNA pseudouridine synthase B  32.23 
 
 		 305 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0723  tRNA pseudouridine synthase B  30.92 
 
 		 305 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.806567  normal  0.0309098 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4575  tRNA pseudouridine synthase B  31.87 
 
 		 305 aa  117  3e-25  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0935427  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1694  tRNA pseudouridine synthase B  31.85 
 
 		 328 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00112277  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0069  tRNA pseudouridine synthase B  30.66 
 
 		 302 aa  111  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00601892  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3606  tRNA pseudouridine synthase B  31.5 
 
 		 306 aa  112  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.825741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1659  tRNA pseudouridine synthase B  30.88 
 
 		 303 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42800  tRNA pseudouridine synthase B  32.6 
 
 		 305 aa  109  5e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1158  tRNA pseudouridine synthase B  30.39 
 
 		 302 aa  109  5e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000801793  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1946  tRNA pseudouridine synthase B  33.09 
 
 		 308 aa  109  7.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0313874 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3185  tRNA pseudouridine synthase B  28.57 
 
 		 309 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.991117  normal  0.361577 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3673  tRNA pseudouridine synthase B  30.28 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0760058  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1559  tRNA pseudouridine synthase B  28.91 
 
 		 306 aa  107  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000014697  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0988  tRNA pseudouridine synthase B  30.73 
 
 		 297 aa  107  2e-22  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62730  tRNA pseudouridine synthase B  30.74 
 
 		 304 aa  107  2e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4488  tRNA pseudouridine synthase B  30.04 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.140717  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5460  tRNA pseudouridine synthase B  30.74 
 
 		 304 aa  107  3e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.525904  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0781  tRNA pseudouridine synthase B  31.14 
 
 		 305 aa  107  3e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00899616  normal  0.133836 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1306  tRNA pseudouridine synthase B  29.72 
 
 		 295 aa  106  4e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000236822  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1753  tRNA pseudouridine synthase B  32.43 
 
 		 310 aa  105  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0346238 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1005  tRNA pseudouridine synthase B  32.35 
 
 		 307 aa  105  8e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.319279  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1478  tRNA pseudouridine synthase B  32.16 
 
 		 310 aa  105  8e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2050  tRNA pseudouridine synthase B  31.48 
 
 		 302 aa  105  9e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2009  tRNA pseudouridine synthase B  33.33 
 
 		 347 aa  105  1e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.845229  normal  0.607065 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2450  tRNA pseudouridine synthase B  31.48 
 
 		 299 aa  104  1e-21  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.226071  normal  0.847147 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1022  tRNA pseudouridine synthase B  31.8 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1502  tRNA pseudouridine synthase B  31.8 
 
 		 310 aa  105  1e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.424281  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4178  tRNA pseudouridine synthase B  30.04 
 
 		 305 aa  103  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.224491  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_853  tRNA pseudouridine synthase B  30.2 
 
 		 300 aa  104  2e-21  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00000359434  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0966  tRNA pseudouridine synthase B  35.71 
 
 		 304 aa  104  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000895381  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1128  tRNA pseudouridine synthase B  30.98 
 
 		 297 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.925084  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1672  tRNA pseudouridine synthase B  30.48 
 
 		 292 aa  103  3e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000366042  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1727  tRNA pseudouridine synthase B  31.58 
 
 		 309 aa  103  4e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.577271  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3072  tRNA pseudouridine synthase B  30.94 
 
 		 307 aa  103  5e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3755  tRNA pseudouridine synthase B  33.33 
 
 		 300 aa  102  9e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.366466  unclonable  0.0000145112 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2978  tRNA pseudouridine synthase B  30.15 
 
 		 295 aa  102  9e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  9.09603e-22 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1424  tRNA pseudouridine synthase B  30.39 
 
 		 310 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0157045 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1029  tRNA pseudouridine synthase B  31.56 
 
 		 308 aa  101  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0084  tRNA pseudouridine synthase B  31.1 
 
 		 302 aa  100  2e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0872  tRNA pseudouridine synthase B  28.62 
 
 		 300 aa  101  2e-20  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.0000436908  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2818  tRNA pseudouridine synthase B  31.06 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0130681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1634  tRNA pseudouridine synthase B  32.58 
 
 		 311 aa  100  3e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.767781  hitchhiker  0.000962415 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1384  tRNA pseudouridine synthase B  30.74 
 
 		 310 aa  100  3e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3632  tRNA pseudouridine synthase B  28.42 
 
 		 307 aa  100  4e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0220119  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3728  tRNA pseudouridine synthase B  27.84 
 
 		 324 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.124557  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3594  tRNA pseudouridine synthase B  27.84 
 
 		 324 aa  100  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0311816  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3995  tRNA pseudouridine synthase B  27.84 
 
 		 324 aa  100  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.866434  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2462  tRNA pseudouridine synthase B  28.68 
 
 		 307 aa  99.8  5e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0554606  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2118  tRNA pseudouridine synthase B  29.89 
 
 		 308 aa  99.8  5e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.206379  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0929  tRNA pseudouridine synthase B  32.86 
 
 		 305 aa  99.8  6e-20  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.590741  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0176  tRNA pseudouridine synthase B  28.83 
 
 		 312 aa  99.4  6e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.721931  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1311  tRNA pseudouridine synthase B  32.03 
 
 		 249 aa  99.8  6e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0354136  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4643  tRNA pseudouridine synthase B  31.42 
 
 		 322 aa  99.4  6e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0247266  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1589  tRNA pseudouridine synthase B  30.53 
 
 		 304 aa  99.4  6e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000648729  normal  0.0689422 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0838  tRNA pseudouridine synthase B  26.13 
 
 		 305 aa  99  8e-20  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0908  tRNA pseudouridine synthase B  29.59 
 
 		 301 aa  99  9e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0981  tRNA pseudouridine synthase B  30.08 
 
 		 300 aa  98.2  1e-19  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.256266  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1336  tRNA pseudouridine synthase B  28.31 
 
 		 307 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.1805  hitchhiker  0.00915441 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0491  tRNA pseudouridine synthase B  28.94 
 
 		 314 aa  98.6  1e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.164014  normal  0.0135399 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1105  tRNA pseudouridine synthase B  31.06 
 
 		 313 aa  98.6  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.26874  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2428  tRNA pseudouridine synthase B  32.18 
 
 		 337 aa  98.6  1e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.36134  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0291  tRNA pseudouridine synthase B  29.68 
 
 		 363 aa  98.6  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0204129 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0629  tRNA pseudouridine synthase B  26.39 
 
 		 317 aa  98.6  1e-19  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0460  tRNA pseudouridine synthase B  25.98 
 
 		 309 aa  97.8  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3569  tRNA pseudouridine synthase B  29.47 
 
 		 293 aa  97.8  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.687406 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3783  tRNA pseudouridine synthase B  33.21 
 
 		 308 aa  97.1  3e-19  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0711171  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>